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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G470070
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 118705767-118712407 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3317 bp · TkA04G470070|TK1151|cDNA

ATCACATCTCACCTGGTCATTAAATTTCACTTGTAAATGATTCCTCTTTATGTCCTCCTGCCCAGTTGCATCATCCTGTCTGGACGCACCTAGCCAATTTAAATTCAAAAAGGTTTCAAATCTCACTGTAGAACCCTAAAAATATCACTCGATCCGTCATTGATTCCCATTAAAAACCTTGGGTTTATAGTGTTTTCGAATTGTTTTGTACCTCTGGATTCAGTGCTTGAGGCTTCTCATCTTCATCCATTGCTCGATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2739 bp · TkA04G470070|TK1151|CDS

ATGGAGGCGATTGAAGAACTGGCTCAACTTGCGGATTCGATGCGGCAGGCTGCGTCTCTGCTTAACGATGAAGATGTTGACGCAAACTCATCGTCTTCTTCAAAACGCCCTTCCACATTTCTCAACGTTGTTGCTCTTGGCAATACCAGTGCAGGTAAATCAGCAGTTTTGAACAGTTTGATTGGACATCCTGCTTTGCCAACTGGTGAAGGTGGTGCAACTCGCGCGCCTATATGCATTGACCTAAAGAGGGATGGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

912 aa · TkA04G470070|TK1151|PROTEIN

MEAIEELAQLADSMRQAASLLNDEDVDANSSSSSKRPSTFLNVVALGNTSAGKSAVLNSLIGHPALPTGEGGATRAPICIDLKRDGNLSSKSIVLQIDSKSQPVSASSLRHSLQDRLSKVSSKSQSEIYLKLKTSTAPPLKLIDLPGVDKGNLDDSLSEYAQHNDAILLVIIPAAQAPEIASSKALKFAKEYDSESTRTIGVISKIDQASSDPKTLAAVKALLSGQGPRSSADIPWVALIGQSVSIASAQSGNVGPDNSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G470070
TK1151 IDTkA04G470070
OH-1004 IDLXL04_038838
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G470070
位置Chr04:118705767-118712407 (+)
描述Similar to DRP2B: Dynamin-2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10290 微管相关的力产生蛋白参与网格蛋白介导的囊泡从反式高尔基体网络到中央液泡的运输。
A new dynamin-like protein, ADL6, is involved in trafficking from the trans-Golgi network to the central vacuole in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1105/tpc.000534
The intermolecular interaction between the PH domain and the C-terminal domain of Arabidopsis dynamin-like 6 determines lipid binding specificity.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m204770200
Regulation of ADL6 activity by its associated molecular network.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01377.x
At1g59610 推测的微管相关力生成蛋白，能够结合和水解 GTP（通过相似性）。
Arabidopsis dynamin-related proteins DRP2B and DRP1A participate together in clathrin-coated vesicle formation during endocytosis.2010 · DOI: 10.1073/pnas.0913562107
Arabidopsis D6PK is a lipid domain-dependent mediator of root epidermal planar polarity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.162
At3g60190 微管相关的产生力蛋白，在细胞分裂过程中定位于形成中的细胞板的管-泡网络。
Members of the Arabidopsis dynamin-like gene family, ADL1, are essential for plant cytokinesis and polarized cell growth.2003 · DOI: 10.1105/tpc.009670
Phragmoplastin dynamics: multiple forms, microtubule association and their roles in cell plate formation in plants.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000006936.50532.3a
At2g44590 假定的微管相关力产生蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g14830 微管相关产力蛋白，在细胞分裂过程中靶向于细胞板的生长边缘。
The dynamin-like protein ADL1C is essential for plasma membrane maintenance during pollen maturation.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01775.x
Phragmoplastin dynamics: multiple forms, microtubule association and their roles in cell plate formation in plants.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000006936.50532.3a
Comparison of the dynamics and functional redundancy of the Arabidopsis dynamin-related isoforms DRP1A and DRP1C during plant development.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.116863

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006896 Golgi to vacuole transport 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0048766 root hair initiation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:2000114 regulation of establishment of cell polarity 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10290
ath:AT1G59610
ath:AT2G44590
ath:AT3G60190
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.489
排名 1 · TkA04G470070 · TK1151
细胞膜0.335
排名 2 · TkA04G470070 · TK1151
细胞核0.231
排名 3 · TkA04G470070 · TK1151
高尔基体0.097
排名 4 · TkA04G470070 · TK1151
内质网0.083
排名 5 · TkA04G470070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21943TetR_C_467-31 aa
PF04548AIG141-65 aa
PF00350Dynamin_N43-205 aa
PF01926MMR_HSR143-189 aa
PF03193RsgA_GTPase43-70 aa
PF29316ECM1977-125 aa
PF18290Nudix_hydro96-136 aa
PF15413PH_11100-137 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G470070PF21943TetR_C_467310.3311.9
TkA04G470070PF04548AIG141650.07513.1
TkA04G470070PF00350Dynamin_N432051.4e-31110.5
TkA04G470070PF01926MMR_HSR1431894.7e-0730.6
TkA04G470070PF03193RsgA_GTPase43700.1312.8
TkA04G470070PF29316ECM19771250.2911.6
TkA04G470070PF18290Nudix_hydro961360.1812.5
TkA04G470070PF15413PH_111001370.1513.3
TkA04G470070PF10662PduV-EutP1412260.2911.7
TkA04G470070PF03193RsgA_GTPase1692150.1312.8
TkA04G470070PF03823Neurokinin_B1902174.48.3
TkA04G470070PF01031Dynamin_M2594924.6e-2382.5
TkA04G470070PF21943TetR_C_462933360.3311.9
TkA04G470070PF03823Neurokinin_B3013264.48.3
TkA04G470070PF01706FliG_C3143494.78.3
TkA04G470070PF10662PduV-EutP4384680.2911.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SE83拟南芥sp|Q9SE83|DRP2A_ARATH Dynamin-2A75.300%Swiss-Prot高置信
Q9LQ55拟南芥sp|Q9LQ55|DRP2B_ARATH Dynamin-2B73.400%Swiss-Prot高置信
Q9FNX5拟南芥sp|Q9FNX5|DRP1E_ARATH Phragmoplastin DRP1E31.000%Swiss-Prot中等置信
Q8S3C9拟南芥sp|Q8S3C9|DRP1D_ARATH Phragmoplastin DRP1D29.600%Swiss-Prot低置信
Q8LF21拟南芥sp|Q8LF21|DRP1C_ARATH Phragmoplastin DRP1C30.200%Swiss-Prot中等置信

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