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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G468260
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 118215244-118218395 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1297 bp · TkA04G468260|TK1151|cDNA

CACATAACAATGGCACCAACAATTCCTCTTCTCTCTCCATACAAGATGCGCAACTTCAATCTCTCCCACAGGGTGGTACTCGCACCCATGACTCGAAATAGATCGTATGATAATATGCCACAACCACATGCCATTTTGTATTATTCGCAAAGAGCGACTGAAGGAGGTCTTCTTGTCACCGAAGCAACTGGGGTCTCCAACACTGCCCAAGGGTATCCTGAAACACCTGGAATTTGGACGAAAGAACAAGTCGAGGCATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1083 bp · TkA04G468260|TK1151|CDS

ATGGCACCAACAATTCCTCTTCTCTCTCCATACAAGATGCGCAACTTCAATCTCTCCCACAGGGTGGTACTCGCACCCATGACTCGAAATAGATCGTATGATAATATGCCACAACCACATGCCATTTTGTATTATTCGCAAAGAGCGACTGAAGGAGGTCTTCTTGTCACCGAAGCAACTGGGGTCTCCAACACTGCCCAAGGGTATCCTGAAACACCTGGAATTTGGACGAAAGAACAAGTCGAGGCATGGAAACCGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

360 aa · TkA04G468260|TK1151|PROTEIN

MAPTIPLLSPYKMRNFNLSHRVVLAPMTRNRSYDNMPQPHAILYYSQRATEGGLLVTEATGVSNTAQGYPETPGIWTKEQVEAWKPIVNAVHEKGGIIFCQIWHVGRVSNNGFQPNNEAPLSSTDKGITPGLAGGDWSPPRRLRTDEIPALVNDFKLAARNAIDAGFDGVEIHGANGYIIDQFLKDQVNDRTDEYGGTLENRCRFALEIVEAVAKEIGGERVGIRLSTFANYMECEDSNPEALGLYMANALNKYEILYLH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G468260
TK1151 IDTkA04G468260
OH-1004 IDLXL04_038812
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 91.005
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G468260
位置Chr04:118215244-118218395 (+)
描述Similar to OPR11: Putative 12-oxophytodienoate reductase 11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76680 特异性地切断α、β-不饱和羰基中的烯烃键，并可能参与这些反应性化合物的解毒或修饰。
12-Oxophytodienoate reductase 3 (OPR3) is the isoenzyme involved in jasmonate biosynthesis.2000 · DOI: 10.1007/s004250050706
The role of oxophytodienoate reductases in the detoxification of the explosive 2,4,6-trinitrotoluene by Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.141598
At1g76690 特异性切割 α,β-不饱和羰基化合物中的烯键，可能参与这些活性化合物的解毒或修饰（可能）。
12-Oxophytodienoate reductase 3 (OPR3) is the isoenzyme involved in jasmonate biosynthesis.2000 · DOI: 10.1007/s004250050706
The role of oxophytodienoate reductases in the detoxification of the explosive 2,4,6-trinitrotoluene by Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.141598
An OPR3-independent pathway uses 4,5-didehydrojasmonate for jasmonate synthesis.2018 · DOI: 10.1038/nchembio.2540

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B9FSC8 推测的氧植物脂酮酸还原酶，可能参与氧脂素信号分子的生物合成或代谢。 暂无已核实直接文献
Os06g0215600 推测的氧植物脂酮酸还原酶，可能参与氧脂素信号分子的生物合成或代谢。 暂无已核实直接文献
Os06g0215500 推测的氧植物脂酮酸还原酶，可能参与氧脂素信号分子的生物合成或代谢。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038812 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0031407 oxylipin metabolic process 生物过程
GO:0031408 oxylipin biosynthetic process 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G76680
ath:AT1G76690
dosa:Os06g0215600
dosa:Os06g0216300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.821
排名 1 · TkA04G468260 · TK1151
细胞核0.320
排名 2 · TkA04G468260 · TK1151
过氧化物酶体0.071
排名 3 · TkA04G468260 · TK1151
线粒体0.063
排名 4 · TkA04G468260 · TK1151
质体0.038
排名 5 · TkA04G468260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00724Oxidored_FMN7-330 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G468260PF00724Oxidored_FMN73301.6e-87294.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LAH7拟南芥sp|Q8LAH7|OPR1_ARATH 12-oxophytodienoate reductase 170.900%Swiss-Prot高置信
Q8GYB8拟南芥sp|Q8GYB8|OPR2_ARATH 12-oxophytodienoate reductase 269.500%Swiss-Prot高置信
B9FSC8水稻sp|B9FSC8|OPR11_ORYSJ Putative 12-oxophytodienoate reductase 1170.200%Swiss-Prot高置信
Q69TI0水稻sp|Q69TI0|OPR5_ORYSJ Putative 12-oxophytodienoate reductase 568.200%Swiss-Prot高置信
Q69TI2水稻sp|Q69TI2|OPR6_ORYSJ Putative 12-oxophytodienoate reductase 668.700%Swiss-Prot高置信

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