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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G462550
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 116746865-116750217 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1910 bp · TkA04G462550|TK1151|cDNA

TTTAACCCCTTGGTAAATTGTCTTCAACCCAATCCCTGTCGTTTCCCTCTCATTCCAAGAAAGTTCAGTCTATTTTTAGATATTCTCTCTCCAATCCATAAACAATCCCGATTTCTTTAGAATCTCTCTCTCCTACAGATTCCATAGATGCACAAATGCACGCACTTCTCTCTTTTGCAATCGGTTTGCATGTCCTTTCATAACCTGTTCTTTTAATAATCCCCCGCAATCCAACATACTTGTCACTAAAATCATCCCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1113 bp · TkA04G462550|TK1151|CDS

ATGGACAAGTACGAGCTTGTGAAGGATATAGGATCTGGGAATTTTGGCGTTGCCAGGTTGATGAGGAACAAGGTCACCAAAGAGCTTGTTGCCATGAAATATATAGAAAGAGGGCATAAGATTGATGAAAATGTTGCCCGAGAGATCATAAATCACAGATCGCTTCGTCACCCGAATATAATTCGGTTTAGAGAGGTGGTGCTGACTCCCACCCATCTTGCTATTGTGATGGAGTATGCTGCTGGAGGGGAGCTTTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

370 aa · TkA04G462550|TK1151|PROTEIN

MDKYELVKDIGSGNFGVARLMRNKVTKELVAMKYIERGHKIDENVAREIINHRSLRHPNIIRFREVVLTPTHLAIVMEYAAGGELFDRICNAGRFSEDEARYFFQQLISGVHYCHFMQICHRDLKLENTLLDGSPAPRLKICDFGYSKSSLLHSRPKSTVGTPAYIAPEVLSRREYDGKLADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDQEDPKNFRKTIHRIMAVQYKIPDYVHISQDCRHLLSRIFVAGASRRINLKEIKSHPWF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G462550
TK1151 IDTkA04G462550
OH-1004 IDLXL04_038754
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G462550
位置Chr04:116746865-116750217 (-)
描述Similar to SRK2B: Serine/threonine-protein kinase SRK2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10940 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SRK2A。 暂无已核实直接文献
At1g60940 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SRK2B。 暂无已核实直接文献
At5g63650 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 SRK2H。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0432000 可能在高渗反应的信号转导中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0551100 可能在高渗应答信号转导中起作用（可能）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038754 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10940
ath:AT1G60940
ath:AT5G63650
dosa:Os02g0551100
dosa:Os04g0432000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.549
排名 1 · TkA04G462550 · TK1151
细胞核0.472
排名 2 · TkA04G462550 · TK1151
细胞膜0.184
排名 3 · TkA04G462550 · TK1151
线粒体0.050
排名 4 · TkA04G462550 · TK1151
内质网0.046
排名 5 · TkA04G462550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase4-260 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5-256 aa
PF11705RNA_pol_3_Rpc31250-355 aa
PF04889Cwf_Cwc_15262-356 aa
PF15336Auts2270-357 aa
PF10846DUF2722272-354 aa
PF09849DUF2076287-354 aa
PF04931DNA_pol_phi289-360 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G462550PF00069Pkinase42606.2e-70236.3
TkA04G462550PF07714PK_Tyr_Ser-Thr52565.8e-31108.4
TkA04G462550PF11705RNA_pol_3_Rpc312503550.0004920.9
TkA04G462550PF04889Cwf_Cwc_152623560.01316.0
TkA04G462550PF15336Auts22703571.110.0
TkA04G462550PF10846DUF27222723540.1212.4
TkA04G462550PF09849DUF20762873543.88.2
TkA04G462550PF04931DNA_pol_phi2893600.1311.1
TkA04G462550PF09507CDC273173570.3710.9
TkA04G462550PF12226Astro_capsid_p3173570.749.6
TkA04G462550PF02724CDC453193570.04312.8
TkA04G462550PF24181TPR_TTI1_C3193595.17.4
TkA04G462550PF30130VID28_C3203641.58.3
TkA04G462550PF05132RNA_pol_Rpc43203542.69.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P43291拟南芥sp|P43291|SRK2A_ARATH Serine/threonine-protein kinase SRK2A84.300%Swiss-Prot高置信
Q9C958拟南芥sp|Q9C958|SRK2B_ARATH Serine/threonine-protein kinase SRK2B87.600%Swiss-Prot高置信
Q9FFP9拟南芥sp|Q9FFP9|SRK2H_ARATH Serine/threonine-protein kinase SRK2H84.000%Swiss-Prot高置信
Q7XQP4水稻sp|Q7XQP4|SAPK7_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase SAPK781.900%Swiss-Prot高置信
Q6ZI44水稻sp|Q6ZI44|SAPK6_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase SAPK680.200%Swiss-Prot高置信

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