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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G460840
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 116214640-116227883 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2717 bp · TkA04G460840|TK1151|cDNA

TGTCAGACCACCGGAGCAAACCGATCAGCTGTGGTGGCGAAATGGACGATGAAACTAACCCGATTTCGTTCACAACTGAATGTTACGCATGCACTCAAGTGGGTGTTCCGGTGTTCCACTCCACGAGCTGCGACCAAGCTCAGCAACCGGAATGGGAAGCCTCCGCCGGGTCTTCCCTGATCCCCATCAGAAACAGAGCCGGTTCTAAAATCATCAAGAACCGAGCTTCCGCCGGAAAACGGGGTTCACCGTCGTCAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1938 bp · TkA04G460840|TK1151|CDS

ATGCTTCACCAGACAGACCACGATAGAACGCCAGGCATTCGGTCACAATCATCGTCCCCATCATATTTGATAAACGAACACGTGTATGACCACCGGAGCAAACCGATCAGCTGTGGTGGCGAAATGGACGATGAAACTAACCCGATTTCGTTCACAACTGAATGTTACGCATGCACTCAAGTGGGTGTTCCGGTGTTCCACTCCACGAGCTGCGACCAAGCTCAGCAACCGGAATGGGAAGCCTCCGCCGGGTCTTCCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

645 aa · TkA04G460840|TK1151|PROTEIN

MLHQTDHDRTPGIRSQSSSPSYLINEHVYDHRSKPISCGGEMDDETNPISFTTECYACTQVGVPVFHSTSCDQAQQPEWEASAGSSLIPIRNRAGSKIIKNRASAGKRGSPSSGVFRRVYDPRSKGVQRWNRFVLLARGMALAVDPLFFYVLSIGRGGTPCLYMDGGLVVVVVAMRTVIDCFHVVHIWLQFRVAYVSRESLVVGCGKLVWDPNSIAYRYVRSLKGFWYDAFVILPIPQIVFLLLLPRLIREDRIKEIMTM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G460840
TK1151 IDTkA04G460840
OH-1004 IDLXL04_038740
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.295 / OH-1004 87.812
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G460840
位置Chr04:116214640-116227883 (-)
描述Similar to CNGC2: Cyclic nucleotide-gated ion channel 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g15410 充当环核苷酸门控离子通道。
The Arabidopsis dnd1 "defense, no death" gene encodes a mutated cyclic nucleotide-gated ion channel.2000 · DOI: 10.1073/pnas.150005697
Developmentally regulated expression of a cyclic nucleotide-gated ion channel from Arabidopsis indicates its involvement in programmed cell death.2001 · DOI: 10.1007/s004250000510
At5g54250 充当环核苷酸门控离子通道。
HLM1, an essential signaling component in the hypersensitive response, is a member of the cyclic nucleotide-gated channel ion channel family.2003 · DOI: 10.1105/tpc.006999
At1g15990 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g01010 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g30360 可能的环核苷酸门控离子通道。
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038740 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007263 nitric oxide mediated signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0070509 calcium ion import 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005216 monoatomic ion channel activity 分子功能
GO:0005221 intracellularly cyclic nucleotide-activated monoatomic cation channel activity 分子功能
GO:0005222 intracellularly cAMP-activated cation channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15990
ath:AT1G19780
ath:AT4G30560
ath:AT5G15410
ath:AT5G54250
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.883
排名 1 · TkA04G460840 · TK1151
细胞质0.073
排名 2 · TkA04G460840 · TK1151
内质网0.064
排名 3 · TkA04G460840 · TK1151
细胞核0.034
排名 4 · TkA04G460840 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA04G460840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520Ion_trans170-452 aa
PF11862DUF3382248-274 aa
PF11862DUF3382405-468 aa
PF11044TMEMspv1-c74-12427-448 aa
PF00027cNMP_binding554-604 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G460840PF00520Ion_trans1704521.2e-0525.3
TkA04G460840PF11862DUF33822482740.02615.5
TkA04G460840PF11862DUF33824054680.02615.5
TkA04G460840PF11044TMEMspv1-c74-124274480.1513.0
TkA04G460840PF00027cNMP_binding5546041.7e-0628.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65718拟南芥sp|O65718|CNGC2_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 269.700%Swiss-Prot高置信
Q94AS9拟南芥sp|Q94AS9|CNGC4_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 448.900%Swiss-Prot中等置信
Q9S9N5拟南芥sp|Q9S9N5|CNGC7_ARATH Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 736.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LD40拟南芥sp|Q9LD40|CNG13_ARATH Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 1335.400%Swiss-Prot中等置信
Q8L7Z0拟南芥sp|Q8L7Z0|CNG17_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 1736.300%Swiss-Prot中等置信

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