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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G451970
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 113874970-113877930 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1609 bp · TkA04G451970|TK1151|cDNA

CTCTTCTCCCTCTCATTGCCTCATCTCTCCAGTAACTTCTCCGCCCGCAACCACCGCAACTCTGTCGTGCATAATCGTCCACTCAAAACTACAGAGTATATTCAATGGCAATCATACCTTGGACAAGTAGATTGGTGGCTCTATCAGGAGGTCAACCTCAGTCAATGATGAGTGTTTCTTCAAGTAGCAAGTCACTTCCACATATGCCTCGTTTTTCAACCAAAACAAGAGCACTTGCATCACCATGTTCAAGCTTATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1329 bp · TkA04G451970|TK1151|CDS

ATGGCAATCATACCTTGGACAAGTAGATTGGTGGCTCTATCAGGAGGTCAACCTCAGTCAATGATGAGTGTTTCTTCAAGTAGCAAGTCACTTCCACATATGCCTCGTTTTTCAACCAAAACAAGAGCACTTGCATCACCATGTTCAAGCTTATTTTCACAATGTTCCATGAACGCACTATATGATATGAAGTCATGTGGTACTTCTCATAAACGCAGAGGTGGTCGTCTCATTGTTCGAGCTCAAAGTGATTTCTATTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

442 aa · TkA04G451970|TK1151|PROTEIN

MAIIPWTSRLVALSGGQPQSMMSVSSSSKSLPHMPRFSTKTRALASPCSSLFSQCSMNALYDMKSCGTSHKRRGGRLIVRAQSDFYSVLGVSKNASKAEIKSAYRKLARSYHPDVNKEPGAEQKFKDISNAYEVLSDDDKRSIYDRYGEAGLKGSAGMGNGDFSNPFDIFESLFDMGGMGGGMGGGRSRNMATEGEDQGYNLVLNFKEAVFGIEKEIEVTKLDTCQTCKGSGAKPGTTASRCSPCGGQGQVISSARTPLG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G451970
TK1151 IDTkA04G451970
OH-1004 IDLXL04_038632
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G451970
位置Chr04:113874970-113877930 (-)
描述Similar to DJA6: Chaperone protein dnaJ A6, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g22360 可能与HSC70伴侣蛋白共同作用，在叶绿体的热应激期间辅助蛋白折叠并防止蛋白聚集。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0333500 在叶绿体发育中起关键作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0334000 在叶绿体发育中起关键作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0334400 在叶绿体发育中起关键作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038632 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22360
dosa:Os05g0333500
dosa:Os05g0334400
osa:107275576
osa:4338449
osa:4338452
tel:tll0790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.967
排名 1 · TkA04G451970 · TK1151
线粒体0.048
排名 2 · TkA04G451970 · TK1151
细胞质0.017
排名 3 · TkA04G451970 · TK1151
细胞核0.015
排名 4 · TkA04G451970 · TK1151
过氧化物酶体0.011
排名 5 · TkA04G451970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ84-145 aa
PF30912TIM141_C87-135 aa
PF01556DnaJ_C200-415 aa
PF30758Orange_C212-232 aa
PF27659CHP02642220-254 aa
PF15777Anti-TRAP224-252 aa
PF20833RNase_E_G_Thio224-233 aa
PF25112zf-AtTam37224-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G451970PF00226DnaJ841451.3e-2796.4
TkA04G451970PF30912TIM141_C871350.02715.2
TkA04G451970PF01556DnaJ_C2004152.6e-45154.9
TkA04G451970PF30758Orange_C2122322.69.2
TkA04G451970PF27659CHP026422202540.007516.5
TkA04G451970PF15777Anti-TRAP2242520.02715.2
TkA04G451970PF20833RNase_E_G_Thio2242330.04814.5
TkA04G451970PF25112zf-AtTam372242513.59.1
TkA04G451970PF00684DnaJ_CXXCXGXG2252886.3e-1555.9
TkA04G451970PF30758Orange_C2252892.69.2
TkA04G451970PF20833RNase_E_G_Thio2422760.04814.5
TkA04G451970PF23733GRXCR1-2_C2422801.99.2
TkA04G451970PF27659CHP026422642940.007516.5
TkA04G451970PF15777Anti-TRAP2662890.02715.2
TkA04G451970PF25112zf-AtTam372672923.59.1
TkA04G451970PF20833RNase_E_G_Thio2803000.04814.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJZ7拟南芥sp|Q9SJZ7|DNJA6_ARATH Chaperone protein dnaJ A6, chloroplastic71.400%Swiss-Prot高置信
P0DO01水稻sp|P0DO01|DJA7A_ORYSJ Chaperone protein dnaJ A7A, chloroplastic68.400%Swiss-Prot高置信
P0DO02水稻sp|P0DO02|DJA7B_ORYSJ Chaperone protein dnaJ A7B, chloroplastic68.400%Swiss-Prot高置信
P0DO03水稻sp|P0DO03|DJA8_ORYSJ Chaperone protein dnaJ A8, chloroplastic68.400%Swiss-Prot高置信

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