TkA04G434700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G434700

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 109628712-109631360 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1375 bp · TkA04G434700|TK1151|cDNA

TTCTATGAAAATTGACTTTTTATAATTCAAACTTGATTGGTTTTGCTACATTGCCAGTCCTAAAACAGCCCGATTTTTGGGAAACAATTTGAACTCAATCCTTTGAAACGTTAACTCTCCCCAACAACAATTTGAAACCTCATTTTCAAACTCAATTCCCTCTCTCCTTCTACAAACCCACTCTCACTCTCTGAACCCTAGCTGCGATCAACTTCAAATTCAAATGGCGGCGGTGCCACCAGTCACCGGCATGGAGCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA04G434700|TK1151|CDS

ATGGCGGCGGTGCCACCAGTCACCGGCATGGAGCTAAACAGTCCTCCCTCCGACGGCATATCCAACCTCCGCTTCTCTCACCACTCTGATCATCTCCTCGTCTCTTCCTGGGACAAACGTGTGCGCCTATACGATGCAAGTGCCAATGTGTTAAGAGGAGAGTTTCTACACGGAGGTGCAGTCCTTGATTGCTGCTTCCATGACGACACCTCTGGTTTTAGTGCTAGTGCTGATAACACTGTCACAAGGCTTGTTTTTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

340 aa · TkA04G434700|TK1151|PROTEIN

MAAVPPVTGMELNSPPSDGISNLRFSHHSDHLLVSSWDKRVRLYDASANVLRGEFLHGGAVLDCCFHDDTSGFSASADNTVTRLVFDNEREDVLGRHDAPVRCIEYSYATGQVITGSWDKTLKCWDPRGGGAQERALVGTYGQPERVYSISLVGNRVVVATAGRHVNVYDLRNMSQPEQRRESSLKYQTRCVQCYPNGTGYALSSVEGRVAMEFFELTESGQAKKYAFKCHRKSEAGRDIVYPVNAIAFHPVYGTFATGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G434700`
TK1151 ID	TkA04G434700
OH-1004 ID	LXL04_038491
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	97.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G434700

位置 Chr04:109628712-109631360 (-)

描述 Similar to BUB3.1: Mitotic checkpoint protein BUB3.1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g19590`	在纺锤体组装检查点信号转导及促进正确的动粒-微管（K-MT）连接建立中发挥双重作用。	The Arabidopsis checkpoint protein Bub3.1 is essential for gametophyte development.2008 · DOI: 10.2741/3076 Spindle assembly checkpoint protein dynamics reveal conserved and unsuspected roles in plant cell division.2009 · DOI: 10.1371/journal.pone.0006757
`At1g49910`	在纺锤体组装检查点信号转导及促进正确的动粒-微管（K-MT）连接建立中发挥双重作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038491 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007059 chromosome segregation 生物过程

GO:0007094 mitotic spindle assembly checkpoint signaling 生物过程

GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore 生物过程

GO:0034501 protein localization to kinetochore 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0051321 meiotic cell cycle 生物过程

GO:0051983 regulation of chromosome segregation 生物过程

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005819 spindle 细胞组分

GO:0005828 kinetochore microtubule 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G49910

ath:AT3G19590

bta:539594

hsa:9184

mmu:12237

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.741

排名 1 · TkA04G434700 · TK1151

细胞质0.330

排名 2 · TkA04G434700 · TK1151

细胞膜0.050

排名 3 · TkA04G434700 · TK1151

溶酶体／液泡0.034

排名 4 · TkA04G434700 · TK1151

高尔基体0.029

排名 5 · TkA04G434700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25460Beta-prop_Aladin9-89 aa

PF23393Beta-prop_WDR90_POC16_2nd14-48 aa

PF23775Beta-prop_RIG_2nd14-49 aa

PF24807WD40_CDC20-Fz16-128 aa

PF25174Beta-prop_THOC317-69 aa

PF00400WD4017-45 aa

PF24814WD40_Prp1917-82 aa

PF24817WD40_WDHD1_1st17-126 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G434700	`PF25460`	Beta-prop_Aladin	9	89	0.00028	20.9
TkA04G434700	`PF23393`	Beta-prop_WDR90_POC16_2nd	14	48	7.6e-07	29.3
TkA04G434700	`PF23775`	Beta-prop_RIG_2nd	14	49	9.8e-05	22.6
TkA04G434700	`PF24807`	WD40_CDC20-Fz	16	128	9.8e-13	48.8
TkA04G434700	`PF25174`	Beta-prop_THOC3	17	69	7.4e-28	98.0
TkA04G434700	`PF00400`	WD40	17	45	7e-26	90.3
TkA04G434700	`PF24814`	WD40_Prp19	17	82	7.3e-18	65.3
TkA04G434700	`PF24817`	WD40_WDHD1_1st	17	126	1.2e-17	64.7
TkA04G434700	`PF25175`	Beta-prop_WDR5	18	227	3.3e-22	79.8
TkA04G434700	`PF23414`	Beta-prop_EML_2	18	71	1.2e-17	64.9
TkA04G434700	`PF24805`	EIF3I	18	47	4.9e-10	39.8
TkA04G434700	`PF25048`	Beta-prop_TEP1_C	18	62	1.1e-07	32.5
TkA04G434700	`PF25171`	Beta-prop_WDR36-Utp21_1st	18	125	5.8e-05	23.4
TkA04G434700	`PF23381`	Beta-prop_IFT122_1st	19	126	1.1e-24	88.0
TkA04G434700	`PF25173`	Beta-prop_WDR3_1st	19	171	1.2e-18	68.2
TkA04G434700	`PF24796`	WDR55	19	46	2.1e-11	44.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LJN8`	拟南芥	sp\|Q9LJN8\|BUB31_ARATH Mitotic checkpoint protein BUB3.1	80.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C701`	拟南芥	sp\|Q9C701\|BUB32_ARATH Mitotic checkpoint protein BUB3.2	81.700%	Swiss-Prot	高置信

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