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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G402280
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 101147397-101149181 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

852 bp · TkA04G402280|TK1151|cDNA

TTGAATACTTTCATTACAGTTGATGTGATTTCAGCAATAGAATTTGACAAAGCTGGTGATCATCTTGCAACTGGAGATCGTGGGGCCGTGTGGTTTTATTTGAAAGAACTGATCAAACAAATGGTTCTAGAAGGAATGGATTGTTCCAGCAGCCGTCACCCTGAATACCGGTATAAAACCGAATTCCAAAGTCATGAGCCTGAGGTCCAAGAAAAGAAGATCAAGAAGATATGCAACTTTAATTTAGACCCTTCTAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

852 bp · TkA04G402280|TK1151|CDS

TTGAATACTTTCATTACAGTTGATGTGATTTCAGCAATAGAATTTGACAAAGCTGGTGATCATCTTGCAACTGGAGATCGTGGGGCCGTGTGGTTTTATTTGAAAGAACTGATCAAACAAATGGTTCTAGAAGGAATGGATTGTTCCAGCAGCCGTCACCCTGAATACCGGTATAAAACCGAATTCCAAAGTCATGAGCCTGAGGTCCAAGAAAAGAAGATCAAGAAGATATGCAACTTTAATTTAGACCCTTCTAAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

283 aa · TkA04G402280|TK1151|PROTEIN

LNTFITVDVISAIEFDKAGDHLATGDRGAVWFYLKELIKQMVLEGMDCSSSRHPEYRYKTEFQSHEPEVQEKKIKKICNFNLDPSKQLRNVLYKLTSHDTSLLARCRRTFAHAHDYHINSISNNSDGETFISADGLRINLWNLEINSQSFNIVDMKPANMEDLTEVIISADFHPSHCNMLAYSSSKGSIRLLDLRQSALCDNHSKFSIRTKIEPDTEICANMLDALNECLEICGQVLDENQERSIVDEIKQVITRVKKHL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G402280
TK1151 IDTkA04G402280
OH-1004 IDLXL04_008187
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)82.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 77.363
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G402280
位置Chr04:101147397-101149181 (-)
描述Similar to PP2AB2: Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g17720 B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。 暂无已核实直接文献
At1g51690 B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0563300 B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X2K3 B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。 暂无已核实直接文献
Os02g0224200 B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008187 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006470 protein dephosphorylation 生物过程
GO:0000159 protein phosphatase type 2A complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0019888 protein phosphatase regulator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17720
ath:AT1G51690
dosa:Os02g0224200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.452
排名 1 · TkA04G402280 · TK1151
细胞核0.402
排名 2 · TkA04G402280 · TK1151
高尔基体0.068
排名 3 · TkA04G402280 · TK1151
线粒体0.067
排名 4 · TkA04G402280 · TK1151
细胞膜0.066
排名 5 · TkA04G402280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23381Beta-prop_IFT122_1st8-26 aa
PF24817WD40_WDHD1_1st9-27 aa
PF00400WD4010-26 aa
PF25174Beta-prop_THOC310-26 aa
PF08679DsrD38-79 aa
PF15492Nbas_N74-107 aa
PF00400WD40105-142 aa
PF25174Beta-prop_THOC3105-152 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G402280PF23381Beta-prop_IFT122_1st8260.02114.9
TkA04G402280PF24817WD40_WDHD1_1st9270.03214.1
TkA04G402280PF00400WD4010264.4e-0524.6
TkA04G402280PF25174Beta-prop_THOC310267e-0522.7
TkA04G402280PF08679DsrD38790.1413.2
TkA04G402280PF15492Nbas_N741070.1112.5
TkA04G402280PF00400WD401051424.4e-0524.6
TkA04G402280PF25174Beta-prop_THOC31051527e-0522.7
TkA04G402280PF24817WD40_WDHD1_1st1121930.03214.1
TkA04G402280PF25174Beta-prop_THOC31142027e-0522.7
TkA04G402280PF23381Beta-prop_IFT122_1st1141910.02114.9
TkA04G402280PF00400WD401681914.4e-0524.6
TkA04G402280PF15492Nbas_N1761990.1112.5
TkA04G402280PF06603UpxZ2112670.01316.6
TkA04G402280PF18829Importin_rep_62192590.02315.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39247拟南芥sp|Q39247|2ABB_ARATH Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform52.000%Swiss-Prot高置信
Q38821拟南芥sp|Q38821|2ABA_ARATH Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform47.000%Swiss-Prot中等置信
Q5Z8Z7水稻sp|Q5Z8Z7|2ABA_ORYSJ Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform49.700%Swiss-Prot中等置信
A2X2K3水稻sp|A2X2K3|2ABB_ORYSI Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform49.100%Swiss-Prot中等置信
Q0E2P1水稻sp|Q0E2P1|2ABB_ORYSJ Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform49.100%Swiss-Prot中等置信

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