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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G400560
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 100723056-100725406 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1969 bp · TkA04G400560|TK1151|cDNA

ATGATATTGACCAATTTAGATATATGTGGAAGTAAATTGTTTTTATTTCTATTTTCTTATTTAGTATTAAGTCTTCAGTCTCAACTTCCCCTTTTTATTGCCGAGTCCACTGCCCCTTTGAGACTTGATTTCTCTTTCTATCTTCATAAATGGCCAAACGATCAAGTGGACTCTCCTTTGATTCAGATCCCATCAGATTACTATTTCCACACAAACTCACCGTCATCAACTCTTTCCCGGACCGCCGCTCCACCACGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1731 bp · TkA04G400560|TK1151|CDS

ATGGCCAAACGATCAAGTGGACTCTCCTTTGATTCAGATCCCATCAGATTACTATTTCCACACAAACTCACCGTCATCAACTCTTTCCCGGACCGCCGCTCCACCACGTGGAGACCTATGGAGCCCGCCGGCAACGTCAACAGGTCCTCTTCACCGCCATCACCTACCACCATCCAATTCCCACTCAACCTCAACTGCAATCATGATCATCAAGAGAAACAGATTAACGAAATGGATTTCTTTTCCGATAAAAAACATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

576 aa · TkA04G400560|TK1151|PROTEIN

MAKRSSGLSFDSDPIRLLFPHKLTVINSFPDRRSTTWRPMEPAGNVNRSSSPPSPTTIQFPLNLNCNHDHQEKQINEMDFFSDKKHDEDRSRLPVSTSDPPPPVTELDFNINTGLHLVTGNTSSDQSVVDDGTSPNSEDKRAKNELAVVQAELERMNTENQRLREVLDQVTNNYNTLQTHLVTMMQQKQREEQSTEDHKTSNEGGEVMIVPRPFMDLGLAAPTAVETEEISQSSSDGHDEHSRSPTLHTNSTNIDHREES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G400560
TK1151 IDTkA04G400560
OH-1004 IDLXL04_038164
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.271 / OH-1004 94.271
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G400560
位置Chr04:100723056-100725406 (+)
描述Similar to WRKY6: WRKY transcription factor 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g62300 转录因子参与衰老和病原体防御相关过程的控制。
Targets of AtWRKY6 regulation during plant senescence and pathogen defense.2002 · DOI: 10.1101/gad.222702
WRKY42 modulates phosphate homeostasis through regulating phosphate translocation and acquisition in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1104/pp.114.253799
At4g04450 转录因子。
WRKY42 modulates phosphate homeostasis through regulating phosphate translocation and acquisition in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1104/pp.114.253799
At4g22070 转录因子。 暂无已核实直接文献
At4g01720 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0137500 转录因子，作为叶片衰老的正向调节因子。
OsWRKY5 Promotes Rice Leaf Senescence via Senescence-Associated NAC and Abscisic Acid Biosynthesis Pathway.2019 · DOI: 10.3390/ijms20184437
Inactivating transcription factor OsWRKY5 enhances drought tolerance through abscisic acid signaling pathways.2022 · DOI: 10.1093/plphys/kiab492
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038164 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080169 cellular response to boron-containing substance deprivation 生物过程
GO:1900057 positive regulation of leaf senescence 生物过程
GO:1901527 abscisic acid-activated signaling pathway involved in stomatal movement 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G62300
ath:AT4G01720
ath:AT4G04450
ath:AT4G22070
osa:107276141
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA04G400560 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA04G400560 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA04G400560 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA04G400560 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA04G400560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24319DUF749173-86 aa
PF26095CC_Bre1128-179 aa
PF15039DUF4530133-200 aa
PF06785UPF0242136-190 aa
PF05266DUF724137-203 aa
PF24319DUF7491140-187 aa
PF06818Fez1140-200 aa
PF15233SYCE1144-199 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G400560PF24319DUF749173860.5411.2
TkA04G400560PF26095CC_Bre11281790.113.6
TkA04G400560PF15039DUF45301332000.07613.9
TkA04G400560PF06785UPF02421361900.1612.8
TkA04G400560PF05266DUF7241372030.5410.8
TkA04G400560PF24319DUF74911401870.5411.2
TkA04G400560PF06818Fez11402001.210.3
TkA04G400560PF15233SYCE11441990.0414.7
TkA04G400560PF09726Macoilin1491964.76.4
TkA04G400560PF07875Coat_F1581880.3112.0
TkA04G400560PF09726Macoilin2292954.76.4
TkA04G400560PF26095CC_Bre12432920.113.6
TkA04G400560PF03106WRKY3163735.4e-2691.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C519拟南芥sp|Q9C519|WRKY6_ARATH WRKY transcription factor 647.900%Swiss-Prot中等置信
Q9XEC3拟南芥sp|Q9XEC3|WRK42_ARATH WRKY transcription factor 4249.200%Swiss-Prot中等置信
Q93WT0拟南芥sp|Q93WT0|WRK31_ARATH Probable WRKY transcription factor 3145.100%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSI7拟南芥sp|Q9ZSI7|WRK47_ARATH Probable WRKY transcription factor 4741.400%Swiss-Prot中等置信
Q75L34水稻sp|Q75L34|WRKY5_ORYSJ Transcription factor WRKY539.600%Swiss-Prot中等置信

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