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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G394270
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 99145051-99148082 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1896 bp · TkA04G394270|TK1151|cDNA

ATGGCGTCATTATACCTAGAGGTGTACAAAAAAACCGGTTCAGGAACCGAAACTGGGTTTTTAAACCGATCCGATCCGATTCAAAAACCGGTTTGGTTGAAACCGATCCGGTTTGAAACCGAACCGGCGGTTTGTACCAGTTTGGGTATTTTGATGGTGGAACCGAGATCTGTAAAGCTTCAATCGAATCAAAAGAAGATGGATTTTGAGTTGAGAAGAGCGAGAGAGAAATTGGAGAAAGAGCAAAAGGATAGGAAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1896 bp · TkA04G394270|TK1151|CDS

ATGGCGTCATTATACCTAGAGGTGTACAAAAAAACCGGTTCAGGAACCGAAACTGGGTTTTTAAACCGATCCGATCCGATTCAAAAACCGGTTTGGTTGAAACCGATCCGGTTTGAAACCGAACCGGCGGTTTGTACCAGTTTGGGTATTTTGATGGTGGAACCGAGATCTGTAAAGCTTCAATCGAATCAAAAGAAGATGGATTTTGAGTTGAGAAGAGCGAGAGAGAAATTGGAGAAAGAGCAAAAGGATAGGAAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

631 aa · TkA04G394270|TK1151|PROTEIN

MASLYLEVYKKTGSGTETGFLNRSDPIQKPVWLKPIRFETEPAVCTSLGILMVEPRSVKLQSNQKKMDFELRRAREKLEKEQKDRKEKARVRLDRERKAKQEALRQREAIEASQRARRIDAMEAQLKADQQMEENILIGRGISFIRVLEAVPFEGPGDKIKLPPSCFNDLSSEGAFDKGPLHFQLSLHHQTTSPPSEPTTTHAGVLEFTADEGTVAIPPHIWNNLYSKNPQLTPLIQVKYVWLPKGTYAKLQSQQLGFSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G394270
TK1151 IDTkA04G394270
OH-1004 IDLXL04_038133
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.540 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G394270
位置Chr04:99145051-99148082 (+)
描述Similar to ufd1: Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038133 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0030970 retrograde protein transport, ER to cytosol 生物过程
GO:0032480 negative regulation of type I interferon production 生物过程
GO:0034614 cellular response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0036503 ERAD pathway 生物过程
GO:0039536 negative regulation of RIG-I signaling pathway 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0071218 cellular response to misfolded protein 生物过程
GO:0072344 rescue of stalled cytosolic ribosome 生物过程
GO:1902882 regulation of response to oxidative stress 生物过程
GO:1990116 ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21270
ath:AT4G38930
ddi:DDB_G0271122
hsa:7353
rno:84478
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.636
排名 1 · TkA04G394270 · TK1151
细胞核0.400
排名 2 · TkA04G394270 · TK1151
线粒体0.094
排名 3 · TkA04G394270 · TK1151
过氧化物酶体0.057
排名 4 · TkA04G394270 · TK1151
内质网0.056
排名 5 · TkA04G394270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24842UFD1_N257-80 aa
PF22017HP1454-like_C86-118 aa
PF03152UFD1_N1156-244 aa
PF24842UFD1_N2245-320 aa
PF22017HP1454-like_C356-396 aa
PF23580Znf_XAF1_N470-496 aa
PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF471-493 aa
PF22191IBR_1471-505 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G394270PF24842UFD1_N257801.8e-2692.7
TkA04G394270PF22017HP1454-like_C861180.01516.1
TkA04G394270PF03152UFD1_N11562441.1e-1867.2
TkA04G394270PF24842UFD1_N22453201.8e-2692.7
TkA04G394270PF22017HP1454-like_C3563960.01516.1
TkA04G394270PF23580Znf_XAF1_N4704967.9e-1348.3
TkA04G394270PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF4714932.2e-0937.8
TkA04G394270PF22191IBR_14715057.27.3
TkA04G394270PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF4895172.2e-0937.8
TkA04G394270PF02176zf-TRAF4895263.8e-0525.0
TkA04G394270PF26743zf-C2H2_CASZ14955341.59.7
TkA04G394270PF22191IBR_15155277.27.3
TkA04G394270PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF5195452.2e-0937.8
TkA04G394270PF02176zf-TRAF5415783.8e-0525.0
TkA04G394270PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF5585772.2e-0937.8
TkA04G394270PF21366TRAFD1-XIAF1_ZnF5946242.2e-0937.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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