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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G380570
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 95872511-95873565 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

438 bp · TkA04G380570|TK1151|cDNA

ATGGAAAAAACCCACAAAGAGAGCAAAAACATTTTTAATGGCACGAAATCAAACTTATCATTCAACAAAGGAGAACTCATAAATGCACAGACGAAACTAAAGCAGGCTTTCGTAGAGTTTCACCGAAAGCTCCGACTTCTGAAAAACTACTCTTCCTTGAATCAATTAGCTTTCTCCAAGATCTTGAAGAAGTACAATAAGATAACATCAAGAAACGCATCAAAAGGTTATCTGGAGATGGTTGAAAATTCTTCTTTGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

438 bp · TkA04G380570|TK1151|CDS

ATGGAAAAAACCCACAAAGAGAGCAAAAACATTTTTAATGGCACGAAATCAAACTTATCATTCAACAAAGGAGAACTCATAAATGCACAGACGAAACTAAAGCAGGCTTTCGTAGAGTTTCACCGAAAGCTCCGACTTCTGAAAAACTACTCTTCCTTGAATCAATTAGCTTTCTCCAAGATCTTGAAGAAGTACAATAAGATAACATCAAGAAACGCATCAAAAGGTTATCTGGAGATGGTTGAAAATTCTTCTTTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

145 aa · TkA04G380570|TK1151|PROTEIN

MEKTHKESKNIFNGTKSNLSFNKGELINAQTKLKQAFVEFHRKLRLLKNYSSLNQLAFSKILKKYNKITSRNASKGYLEMVENSSLGQSDEVVKLMERVEAAFIKHFANANHRQGMRDLRRRAKRDKHRLTFFIDELEISENVLA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G380570
TK1151 IDTkA04G380570
OH-1004 IDLXL04_013381
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.966 / OH-1004 36.752
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G380570
位置Chr04:95872511-95873565 (-)
描述暂无功能描述
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g03240 可能运输无机磷（Pi）。 暂无已核实直接文献
At2g03260 可能运输无机磷（Pi）。 暂无已核实直接文献
At3g29060 可能运输无机磷（Pi）。 暂无已核实直接文献
At1g14040 可能运输无机磷（Pi）。 暂无已核实直接文献
At2g03250 可能运输无机磷（Pi）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013381 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0000822 inositol hexakisphosphate binding 分子功能
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26730
ath:AT1G35350
ath:AT2G03240
ath:AT2G03260
ath:AT3G29060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.472
排名 1 · TkA04G380570 · TK1151
细胞质0.398
排名 2 · TkA04G380570 · TK1151
细胞核0.152
排名 3 · TkA04G380570 · TK1151
内质网0.097
排名 4 · TkA04G380570 · TK1151
高尔基体0.075
排名 5 · TkA04G380570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03632Glyco_hydro_65m7-110 aa
PF03105SPX11-81 aa
PF25876HH_MFP_RND22-53 aa
PF03105SPX104-118 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G380570PF03632Glyco_hydro_65m71100.1811.5
TkA04G380570PF03105SPX11817.8e-2279.5
TkA04G380570PF25876HH_MFP_RND22530.05414.5
TkA04G380570PF03105SPX1041187.8e-2279.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6R8G5拟南芥sp|Q6R8G5|PHO15_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 564.000%Swiss-Prot高置信
Q6R8G8拟南芥sp|Q6R8G8|PHO12_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 261.600%Swiss-Prot高置信
Q9LJW0拟南芥sp|Q9LJW0|PHO19_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 961.200%Swiss-Prot高置信
Q6R8G7拟南芥sp|Q6R8G7|PHO13_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 361.200%Swiss-Prot高置信
Q6R8G4拟南芥sp|Q6R8G4|PHO16_ARATH Phosphate transporter PHO1 homolog 660.500%Swiss-Prot高置信

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