基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G368380
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 92623253-92626476
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1441 bp · TkA04G368380|TK1151|cDNA
CATTAAGCCGGACAAAAGCCCATTACATACAACAAACTGAAATTGGCACCATAACGATTAACGCATAACCAAATTGGAGGGAAGCCCAAACCCAAGAGAATATTTGCGAATGTATTGTGATCTAATCATCTTTCCTCAAAATACCCCCAAAACTCCCAAAGAATCAACAAATTTTGTTCGCTCCAAAACCCCATCTTGAAATCAATGCATTTTCTGAGGTTGATTTGAGAACACAGGGCAGGAAGAAAATCACACACATC...
CDS
下载 CDS FASTA1038 bp · TkA04G368380|TK1151|CDS
ATGAAAAGATTCGTTTTCAGAAATATATATATCAGTAGTAATATTATCGGCGGCGATCAAAGGAAAATCTCACAATCATCAATCCATACAACAAACTTTACAAAAAAAAATTCTCATCATTCAACGTCTTCCTCTAGTGCTTCAGAAGGCTTCAAGGATAAAGCTATTAGTGAATTCCGAAATAGTTCCGTGACTAAAATGGTAGTAAACTTGGAAAATTTATCAAAGGTTAAAAGAAATGATGTTAATCACATTGATAT...
345 aa · TkA04G368380|TK1151|PROTEIN
MKRFVFRNIYISSNIIGGDQRKISQSSIHTTNFTKKNSHHSTSSSSASEGFKDKAISEFRNSSVTKMVVNLENLSKVKRNDVNHIDMLNVSYDNYDGVIVEVKENMDENIFTSLLQTSITQWRHQGKKGVWLKLSLELSNLVNPAVKEGFWYHHAEPTYLMLVYWIPKTKHTFPSNASHRVGVASFVLNSKGEILVVQEGNGVFKGTGVWKLPTGSVEEGEDIGTAAIREVKEEAGIDTEFVEVLAFRQSHMSFFTKSDI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G368380 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G368380 |
| OH-1004 ID | LXL04_034729 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 57.600 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 73.913 / OH-1004 78.593覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G368380 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:92623253-92626476 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to NUDT2: Nudix hydrolase 2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程 GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0010193 response to ozone 生物过程 GO:0010581 regulation of starch biosynthetic process 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0051707 response to other organism 生物过程 GO:0070212 protein poly-ADP-ribosylation 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:0080151 positive regulation of salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G04450 ath:AT4G12720 ath:AT4G25434 ath:AT5G47240 ath:AT5G47650 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.796
细胞质0.127
细胞核0.059
质体0.054
过氧化物酶体0.042
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF18290Nudix_hydro88-166 aaPF00293NUDIX179-302 aaPF14815NUDIX_4187-300 aaPF18290Nudix_hydro314-327 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G368380 | PF18290 | Nudix_hydro | 88 | 166 | 1.9e-29 | 102.2 |
| TkA04G368380 | PF00293 | NUDIX | 179 | 302 | 2.4e-25 | 89.8 |
| TkA04G368380 | PF14815 | NUDIX_4 | 187 | 300 | 0.0015 | 19.1 |
| TkA04G368380 | PF18290 | Nudix_hydro | 314 | 327 | 1.9e-29 | 102.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q94B74 | 拟南芥 | sp|Q94B74|NUDT2_ARATH Nudix hydrolase 2 | 58.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SU14 | 拟南芥 | sp|Q9SU14|NUDT7_ARATH Nudix hydrolase 7 | 52.000% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q6NPD7 | 拟南芥 | sp|Q6NPD7|NUD10_ARATH Nudix hydrolase 10 | 56.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SJC6 | 拟南芥 | sp|Q9SJC6|NUDT5_ARATH Nudix hydrolase 5 | 49.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SJC4 | 拟南芥 | sp|Q9SJC4|NUDT6_ARATH Nudix hydrolase 6 | 53.400% | Swiss-Prot | 高置信 |