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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G358420
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 90306745-90310499 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1713 bp · TkA04G358420|TK1151|cDNA

TAATCTTAGACTGAAACAAGATTTAGTTTTATCCAAATCTTATATATGCAAATGTTTACACATTATTCCATTCATCCATTAACCTTAATTGTAAATCTTTATTATTTATAGATCATCAATGGCGAAAAAACGAGAAAGACATCAAAATCCAGAACCTTTCTTATCAGATGACACCAACAAATCCGTCTCCAAAAAGCGCACCAAACCCGCTAAACAGCATCAGGGTGAAGAAAAGCTTATATCAGCAGGGATGAGCTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1344 bp · TkA04G358420|TK1151|CDS

ATGGCGAAAAAACGAGAAAGACATCAAAATCCAGAACCTTTCTTATCAGATGACACCAACAAATCCGTCTCCAAAAAGCGCACCAAACCCGCTAAACAGCATCAGGGTGAAGAAAAGCTTATATCAGCAGGGATGAGCTCCAAAATTCTAAAAGAGGCTTTAATTCAACAAAAGGAAATACAGGAAGAGACAGATGCTGAAAACCCTAATAACATTGTTTTCCCCGAAGAACCTGTGACTCAGACTCAAGTAGAAGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

447 aa · TkA04G358420|TK1151|PROTEIN

MAKKRERHQNPEPFLSDDTNKSVSKKRTKPAKQHQGEEKLISAGMSSKILKEALIQQKEIQEETDAENPNNIVFPEEPVTQTQVEDDDDDVDNFAGFSDNHSQFGGYEEEINEDDERLLEAFFSKDKRPQQTLADVILQKIKQKDNMPPGLAAVLPQIPKLDDSIIEIYKSVGEIFKKYTSGKLPLAFKSIPAKQNWEELLFLTEPEKWSPNAVYQATRILASNMSSSKVTRFYKFVLLPRIRQDIRKNKKLHFALYQAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G358420
TK1151 IDTkA04G358420
OH-1004 IDLXL04_037886
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.753
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G358420
位置Chr04:90306745-90310499 (-)
描述Similar to ENP1: Bystin
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31660 胚胎发生和花粉发育过程中所需的必需蛋白。
40S ribosome biogenesis co-factors are essential for gametophyte and embryo development.2013 · DOI: 10.1371/journal.pone.0054084

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037886 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0006364 rRNA processing 生物过程
GO:0008283 cell population proliferation 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0042254 ribosome biogenesis 生物过程
GO:1904749 regulation of protein localization to nucleolus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31660
bta:514128
hsa:705
mbr:MONBRDRAFT_17006
mmu:53414
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.901
排名 1 · TkA04G358420 · TK1151
细胞质0.195
排名 2 · TkA04G358420 · TK1151
线粒体0.026
排名 3 · TkA04G358420 · TK1151
细胞膜0.025
排名 4 · TkA04G358420 · TK1151
内质网0.014
排名 5 · TkA04G358420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20070DUF646622-39 aa
PF14167YfkD22-61 aa
PF05291Bystin129-414 aa
PF14167YfkD131-161 aa
PF14167YfkD182-198 aa
PF20070DUF6466235-264 aa
PF12994DUF3878309-408 aa
PF17918TetR_C_15340-398 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G358420PF20070DUF646622390.6811.1
TkA04G358420PF14167YfkD22610.699.8
TkA04G358420PF05291Bystin1294147.1e-124413.6
TkA04G358420PF14167YfkD1311610.699.8
TkA04G358420PF14167YfkD1821980.699.8
TkA04G358420PF20070DUF64662352640.6811.1
TkA04G358420PF12994DUF38783094080.05413.8
TkA04G358420PF17918TetR_C_153403980.312.5
TkA04G358420PF20070DUF64663743910.6811.1
TkA04G358420PF14167YfkD3744120.699.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWS4拟南芥sp|Q8RWS4|BYST_ARATH Bystin58.300%Swiss-Prot高置信

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