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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G269910
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 68192924-68194729 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1383 bp · TkA04G269910|TK1151|cDNA

CAGAAGGTAAAGAGATCTAGCAGTTGAAGAAGAGGAAGAAGATATTAATTATGGGTGATAAGAATGTGGTGGTTTCATCAAACATTAAGCTTGAAAGGCTTCTTAGTATGAAAGGAGGCAAAGGCGAAGCCAGTTATGCCAACAACTCTCAAGCCCAGGCAAAGCATGCTCGATCAATGTTACACCTTCTGAAGGAAACGCTCGACGGTGTTCGCCTGAACTCGCCGGAGATACCCTTTGTGGTGGCGGATCTTGGTTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1161 bp · TkA04G269910|TK1151|CDS

ATGGGTGATAAGAATGTGGTGGTTTCATCAAACATTAAGCTTGAAAGGCTTCTTAGTATGAAAGGAGGCAAAGGCGAAGCCAGTTATGCCAACAACTCTCAAGCCCAGGCAAAGCATGCTCGATCAATGTTACACCTTCTGAAGGAAACGCTCGACGGTGTTCGCCTGAACTCGCCGGAGATACCCTTTGTGGTGGCGGATCTTGGTTGCTCCAGCGGAAGCAACACCATCTTCATCGTCAATGTCATCATCCAACACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

386 aa · TkA04G269910|TK1151|PROTEIN

MGDKNVVVSSNIKLERLLSMKGGKGEASYANNSQAQAKHARSMLHLLKETLDGVRLNSPEIPFVVADLGCSSGSNTIFIVNVIIQHITKRYEASGLSDLPEFSAFFADLPSNDFNTLFQLLPPLANQDVGSMEECLASTGHRSFFAAGVPGSFYRRLFPARSVDVFYSAFSLHWLSQVPEIVLEKSSTTYNKGKIFIHGANKSTANAYRRQFQTDLAGFLKMRSKEMKMGGSMFIALLGRTSEDPTDQGGAGLLFGTHFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G269910
TK1151 IDTkA04G269910
OH-1004 IDLXL04_037298
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G269910
位置Chr04:68192924-68194729 (-)
描述Similar to IAMT1: Indole-3-acetate O-methyltransferase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55250 催化植物激素吲哚-3-乙酸（IAA）游离羧基的甲基化。
An indole-3-acetic acid carboxyl methyltransferase regulates Arabidopsis leaf development.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.034959
The possible action mechanisms of indole-3-acetic acid methyl ester in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s00299-007-0458-9
At5g56300 催化多种赤霉素（GA）羧基的甲基化。
Methylation of gibberellins by Arabidopsis GAMT1 and GAMT2.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.044602
At4g26420 催化多种赤霉素（GA）羧基的甲基化。
Methylation of gibberellins by Arabidopsis GAMT1 and GAMT2.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.044602

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0665200 催化植物激素吲哚-3-乙酸（IAA）游离羧基的甲基化。
Structural, biochemical, and phylogenetic analyses suggest that indole-3-acetic acid methyltransferase is an evolutionarily ancient member of the SABATH family.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.110049
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037298 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0009856 pollination 生物过程
GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0140964 intracellular auxin homeostasis 生物过程
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能
GO:0010341 gibberellin carboxyl-O-methyltransferase activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0051749 indole acetic acid carboxyl methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G26420
ath:AT5G55250
ath:AT5G56300
dosa:Os04g0665200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.739
排名 1 · TkA04G269910 · TK1151
细胞核0.300
排名 2 · TkA04G269910 · TK1151
质体0.096
排名 3 · TkA04G269910 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA04G269910 · TK1151
细胞膜0.055
排名 5 · TkA04G269910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03492Methyltransf_716-383 aa
PF28098HPE1-like_N_CxxC218-232 aa
PF28098HPE1-like_N_CxxC275-318 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G269910PF03492Methyltransf_7163838.5e-114381.0
TkA04G269910PF28098HPE1-like_N_CxxC2182320.1313.1
TkA04G269910PF28098HPE1-like_N_CxxC2753180.1313.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLN8拟南芥sp|Q9FLN8|IAMT1_ARATH Indole-3-acetate O-methyltransferase 170.100%Swiss-Prot高置信
Q5XF78拟南芥sp|Q5XF78|GAMT2_ARATH Gibberellic acid methyltransferase 238.800%Swiss-Prot中等置信
F4JUY5拟南芥sp|F4JUY5|GAMT1_ARATH Gibberellic acid methyltransferase 137.200%Swiss-Prot中等置信
Q0J998水稻sp|Q0J998|IAMT1_ORYSJ Indole-3-acetate O-methyltransferase 161.600%Swiss-Prot高置信

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