TkA04G197070 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G197070

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 50754584-50761410 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1239 bp · TkA04G197070|TK1151|cDNA

ATGGAATACGTTCTGTATCCCCTTCAAGTCCAGGTGGTGTTACATCGACAGTTAAGGGATATCGACGAGATGAGGGCATTGGATAACGGTAATGATAAGTGGAACCATATATTTAATTACAACAACGTGTGGGGTGTTGTTGATGCCACTAAGACACTCGATAAAGGAGTCGATTCGAGGTCACGTTTGGATAATCGTAAGTGTAGGGCCATCAGAATTAAGAACAAATGGATCATTGTCTCATTACAACAACGAGATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1239 bp · TkA04G197070|TK1151|CDS

ATGGAATACGTTCTGTATCCCCTTCAAGTCCAGGTGGTGTTACATCGACAGTTAAGGGATATCGACGAGATGAGGGCATTGGATAACGGTAATGATAAGTGGAACCATATATTTAATTACAACAACGTGTGGGGTGTTGTTGATGCCACTAAGACACTCGATAAAGGAGTCGATTCGAGGTCACGTTTGGATAATCGTAAGTGTAGGGCCATCAGAATTAAGAACAAATGGATCATTGTCTCATTACAACAACGAGATGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

412 aa · TkA04G197070|TK1151|PROTEIN

MEYVLYPLQVQVVLHRQLRDIDEMRALDNGNDKWNHIFNYNNVWGVVDATKTLDKGVDSRSRLDNRKCRAIRIKNKWIIVSLQQRDVEGDDVGSVIFHPQPSSLPHWYHINSFSLCPILQSISKLGWQRGQMVSELKNWSCEILPVLTRDVRYRTLQENSQIATESYENIYENAFHGATTGKFDFRLETAATRFQIREELKSLNTALDIITYCSPDQSVEGLKVLYHQLENASDDPKEGSLVDELVENADKLKFDNAERT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G197070`
TK1151 ID	TkA04G197070
OH-1004 ID	LXL04_000727
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	67.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 32.767 / OH-1004 85.281 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G197070

位置 Chr04:50754584-50761410 (+)

描述 Similar to MOR1: Protein MOR1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g35630`	微管结合蛋白，对于皮质微管的组织和功能至关重要。	MOR1 is essential for organizing cortical microtubules in plants.2001 · DOI: 10.1038/35079128 Mutation or drug-dependent microtubule disruption causes radial swelling without altering parallel cellulose microfibril deposition in Arabidopsis root cells.2003 · DOI: 10.1105/tpc.011593 Genetic analysis of adventitious root formation with a novel series of temperature-sensitive mutants of Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1242/dev.00794 Cellulose microfibril alignment recovers from DCB-induced disruption despite microtubule disorganization.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01906.x Aberrant cell plate formation in the Arabidopsis thaliana microtubule organization 1 mutant.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci068 MICROTUBULE ORGANIZATION 1 regulates structure and function of microtubule arrays during mitosis and cytokinesis in the Arabidopsis root.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.069989 Hypersensitivity to cytoskeletal antagonists demonstrates microtubule-microfilament cross-talk in the control of root elongation in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2006.01671.x MOR1, the Arabidopsis thaliana homologue of Xenopus MAP215, promotes rapid growth and shrinkage, and suppresses the pausing of microtubules in vivo.2008 · DOI: 10.1242/jcs.039065

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0816400`	微管相关蛋白，对皮质微管的组织和功能至关重要。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000727 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程

GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程

GO:0007019 microtubule depolymerization 生物过程

GO:0007020 microtubule nucleation 生物过程

GO:0007051 spindle organization 生物过程

GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程

GO:0007098 centrosome cycle 生物过程

GO:0009920 cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis 生物过程

GO:0010609 mRNA localization resulting in post-transcriptional regulation of gene expression 生物过程

GO:0022618 protein-RNA complex assembly 生物过程

GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G35630

dosa:Os01g0816400

hsa:9793

mmu:75786

xla:779014

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.417

排名 1 · TkA04G197070 · TK1151

细胞质0.366

排名 2 · TkA04G197070 · TK1151

细胞膜0.162

排名 3 · TkA04G197070 · TK1151

线粒体0.099

排名 4 · TkA04G197070 · TK1151

内质网0.085

排名 5 · TkA04G197070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23976DUF7302375-402 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G197070	`PF23976`	DUF7302	375	402	0.28	12.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q94FN2`	拟南芥	sp\|Q94FN2\|MOR1_ARATH Protein MOR1	37.600%	Swiss-Prot	低置信
`Q5N749`	水稻	sp\|Q5N749\|MOR1_ORYSJ Protein MOR1	36.600%	Swiss-Prot	低置信

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