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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G169570
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 43795925-43799662 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2027 bp · TkA04G169570|TK1151|cDNA

TCATTCCCATGAAAAGATGACGTCAGATAAAATGTGGAAAAATTCCTCACACGATACAAATTATCAATAGAAAGCAATTTTATGGTTCCAAATCTGAAAATGTATTTCACATCTGTGGGTCCAACAAAAACCTGTTGAGGAGACGCATGTTCCAACGATCACAACCGTCGACATGCCACCCAAAACGATCGTTATTCGTGAGCCGGCAGACGACGTTTCAAGATCCCCCCCGCCGAACCTCCCACCGGAATCAAGTCCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1704 bp · TkA04G169570|TK1151|CDS

ATGTCCAAGCAAACATTCACAGTATGTCTCTGTTTCAGACGACGTTTCAAGATCCCCCCCGCCGAACCTCCCACCGGAATCAAGTCCCTATTCAATAACTATTCAGCTAACGATCTGATGACCGCCGATCACCTCCAACGCTTCCTGGTTGAGGTTCAGAAACACGAGAAAGCTACGATCGAGGAAGCTGAAGCAATTATTACGCAGAATTCCCCTTCTCTCTTCCACCGCAAGGGTTTCAATCTCGAAGCCTTCTTCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

567 aa · TkA04G169570|TK1151|PROTEIN

MSKQTFTVCLCFRRRFKIPPAEPPTGIKSLFNNYSANDLMTADHLQRFLVEVQKHEKATIEEAEAIITQNSPSLFHRKGFNLEAFFKYIFGASNSVLSPSGSAHQDMTAPLSHYYIYTGHNSYLTGNQLNSDCSDVPIIQALQRGVRVIELDIWPNSTKDDVDVLHGGTLTTPVELRTCLKSIKNHAFSVSEYPVVITLEDHLTTDLQAKVAEMVHEIYGDTLFTPEKECLEEFPSPETLKKRFIISTKPPKEYLKAKGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G169570
TK1151 IDTkA04G169570
OH-1004 IDLXL04_035090
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G169570
位置Chr04:43795925-43799662 (+)
描述Similar to PLC2: Phosphoinositide phospholipase C 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g08510 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。
N-terminal EF-hand-like domain is required for phosphoinositide-specific phospholipase C activity in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1016/s0014-5793(01)02453-x
At3g55940 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At2g40116 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At5g58700 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At5g58670 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。
Arabidopsis PLC1 is required for secondary responses to abscisic acid signals.2001 · DOI: 10.1105/tpc.13.5.1143
A gene encoding a phosphatidylinositol-specific phospholipase C is induced by dehydration and salt stress in Arabidopsis thaliana.1995 · DOI: 10.1073/pnas.92.9.3903

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010601 positive regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048015 phosphatidylinositol-mediated signaling 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
GO:0051209 release of sequestered calcium ion into cytosol 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40116
ath:AT3G08510
ath:AT3G55940
ath:AT5G58690
ath:AT5G58700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.482
排名 1 · TkA04G169570 · TK1151
细胞质0.424
排名 2 · TkA04G169570 · TK1151
细胞核0.182
排名 3 · TkA04G169570 · TK1151
内质网0.076
排名 4 · TkA04G169570 · TK1151
高尔基体0.063
排名 5 · TkA04G169570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09279EF-hand_like27-98 aa
PF23617EF-hand_1528-94 aa
PF23583EF_HAND_2_PLCG38-97 aa
PF10022BcGHD61-102 aa
PF00388PI-PLC-X107-249 aa
PF04889Cwf_Cwc_15264-298 aa
PF06524NOA36267-298 aa
PF00387PI-PLC-Y332-417 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G169570PF09279EF-hand_like27989.9e-0523.5
TkA04G169570PF23617EF-hand_1528940.2112.5
TkA04G169570PF23583EF_HAND_2_PLCG38970.1313.3
TkA04G169570PF10022BcGHD611020.510.1
TkA04G169570PF00388PI-PLC-X1072496.6e-53179.0
TkA04G169570PF04889Cwf_Cwc_152642980.113.1
TkA04G169570PF06524NOA362672989.26.2
TkA04G169570PF00387PI-PLC-Y3324178.5e-30104.1
TkA04G169570PF10022BcGHD3874090.510.1
TkA04G169570PF10022BcGHD4424630.510.1
TkA04G169570PF00168C24595401.5e-1558.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39033拟南芥sp|Q39033|PLCD2_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 266.200%Swiss-Prot高置信
Q9LY51拟南芥sp|Q9LY51|PLCD7_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 766.200%Swiss-Prot高置信
Q8GV43拟南芥sp|Q8GV43|PLCD6_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 654.300%Swiss-Prot高置信
Q944C1拟南芥sp|Q944C1|PLCD4_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 451.500%Swiss-Prot高置信
Q39032拟南芥sp|Q39032|PLCD1_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 152.300%Swiss-Prot高置信

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