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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G167090
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 43185195-43188592 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2671 bp · TkA04G167090|TK1151|cDNA

CAAGCATCGTCTCTATCACTACAAAACCTTCTTTCATGACTATCTCATCCCAACTGTTTAATTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTCCTTTCATGGAGTCCAATTTCAACCAAAAGACTCCTAATCACTCAAACCCCTTTGACCAATCCAACATTCCCTTGAAGAAAAGAGAAAAATGGAAGACAAATACAAATAAGACACACTGTTTCACGTTATTTCTTCACCTACTAATTTCCATCCTCATTCACCCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2382 bp · TkA04G167090|TK1151|CDS

ATGGAGTCCAATTTCAACCAAAAGACTCCTAATCACTCAAACCCCTTTGACCAATCCAACATTCCCTTGAAGAAAAGAGAAAAATGGAAGACAAATACAAATAAGACACACTGTTTCACGTTATTTCTTCACCTACTAATTTCCATCCTCATTCACCCACTTCCTGTCGTAAGTCAATCATGGGATGGAATCATCGTCACCGAATCAGATTTTCAAGCCCTCCAATCTTTCAAACAAGAACTCATTGACCCAAATGGGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

793 aa · TkA04G167090|TK1151|PROTEIN

MESNFNQKTPNHSNPFDQSNIPLKKREKWKTNTNKTHCFTLFLHLLISILIHPLPVVSQSWDGIIVTESDFQALQSFKQELIDPNGFLKSWNDSGYGACSGRWEGIKCAQGQVIVIQLPWRGLGGRISPKIGQFQALRKLSLHDNSIGGSIPKELGFLPNLRGLQLFNNKFTGSIPPALGSCPLLQTIDLGNNSLVGTIPESLANCSKLYRVNFTYNSLTGSIPAPLTKLNSLQFLALQFNNLSGVLPDSWGNDKNGVKF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G167090
TK1151 IDTkA04G167090
OH-1004 IDLXL04_035108
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G167090
位置Chr04:43185195-43188592 (+)
描述Similar to IMK3: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g56100 能磷酸化 AGL24。 暂无已核实直接文献
At3g51740 可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 IMK2。 暂无已核实直接文献
At2g26730 可能失活的受体激酶 At2g26730。 暂无已核实直接文献
At1g68400 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g68400。 暂无已核实直接文献
At3g24660 似乎没有保守的激酶活性。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035108 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68400
ath:AT2G26730
ath:AT3G51740
ath:AT3G56100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.888
排名 1 · TkA04G167090 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA04G167090 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA04G167090 · TK1151
细胞核0.044
排名 4 · TkA04G167090 · TK1151
溶酶体／液泡0.020
排名 5 · TkA04G167090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_269-108 aa
PF23598LRR_14128-238 aa
PF13855LRR_8134-171 aa
PF12799LRR_4136-171 aa
PF00560LRR_1137-158 aa
PF13516LRR_6137-149 aa
PF12799LRR_4159-199 aa
PF13516LRR_6159-173 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G167090PF08263LRRNT_2691088.9e-1142.6
TkA04G167090PF23598LRR_141282382e-1247.3
TkA04G167090PF13855LRR_81341713.3e-2278.7
TkA04G167090PF12799LRR_41361711.6e-2073.4
TkA04G167090PF00560LRR_11371581.4e-2996.5
TkA04G167090PF13516LRR_61371490.5711.1
TkA04G167090PF12799LRR_41591991.6e-2073.4
TkA04G167090PF13516LRR_61591730.5711.1
TkA04G167090PF00560LRR_11601821.4e-2996.5
TkA04G167090PF24141LRR_ComC1672053.5e-0524.4
TkA04G167090PF13516LRR_61821940.5711.1
TkA04G167090PF13855LRR_81842433.3e-2278.7
TkA04G167090PF00560LRR_11852061.4e-2996.5
TkA04G167090PF24141LRR_ComC2052533.5e-0524.4
TkA04G167090PF13516LRR_62062210.5711.1
TkA04G167090PF00560LRR_12092301.4e-2996.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGP9拟南芥sp|C0LGP9|IMK3_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK374.200%Swiss-Prot高置信
Q9SCT4拟南芥sp|Q9SCT4|IMK2_ARATH Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK269.000%Swiss-Prot高置信
O48788拟南芥sp|O48788|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g2673046.700%Swiss-Prot低置信
Q9M9C5拟南芥sp|Q9M9C5|Y1680_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g6840048.300%Swiss-Prot低置信
P33543拟南芥sp|P33543|TMKL1_ARATH Putative kinase-like protein TMKL146.700%Swiss-Prot低置信

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