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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G153050
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 39536450-39541923 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1144 bp · TkA04G153050|TK1151|cDNA

CAGACAATGACTTGCGTTTTGGACCACCAACCCACCTACACGATTGACTCTAGAACACCGAGTCTACCGAGCTCAATACAAATCTAAAATAATCAAAAGGAATTTTATGTTGGTGGAGTGAAAGTGAAGCCGATGGATGTAATTTCTCAGTAATTGTTGGTGTTCTTGTCTGTTCCTTTTGATCTGTTCAACACGTATTTCCCTATAAAGAAACCTTCATCACAACCGATCAATTACACTCGTCCATTAATACCCTAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1428 bp · TkA04G153050|TK1151|CDS

ATGGAGGAAATTCAACGAAGAAAAGAAACAGAAGCTACATTCGCAAAACAAATTGAAGAAATCGAATCAATGAAGAACCAAAAACACCAATTCATGGAAGAGCTTCAAACCGTAAATAACCAAATACCGCAACTATTACACCAAATTTCAAACACCCGTGATACAGAAAAGGAGTTAGAGGAGAAGATCATTCAAGCTGTGAATCTGTTAATCAGTTTCAAAGAAAGCCGTGATAAGTTACAAGATGAGCAAGATAATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

475 aa · TkA04G153050|TK1151|PROTEIN

MEEIQRRKETEATFAKQIEEIESMKNQKHQFMEELQTVNNQIPQLLHQISNTRDTEKELEEKIIQAVNLLISFKESRDKLQDEQDNARRQINRLTKHDTDTITTTNLSQAQFYKPSFSEIMEATQDFNQSLKIGEGRYGSVYKGILRHVRVAIKMLPSLGSQSDAEFEHHAEVLSRTRHPNLVTLIGVCSATRSLIYEYLENGSLEDRIASSKGKTPSTLPWRTRIRIASEICSALIFLHANKPQIIHGNLTLANILLDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G153050
TK1151 IDTkA04G153050
OH-1004 IDLXL04_022646
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)44.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.737 / OH-1004 54.733
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G153050
位置Chr04:39536450-39541923 (+)
描述Similar to PUB33: U-box domain-containing protein 33
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g45910 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At3g49060 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g61560 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0163000 起E3泛素连接酶的作用。
MODD Mediates Deactivation and Degradation of OsbZIP46 to Negatively Regulate ABA Signaling and Drought Resistance in Rice.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00171
Os03g0424200 在体外具有 E3 泛素蛋白连接酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022646 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0061630 ubiquitin protein ligase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G45910
ath:AT3G49060
ath:AT5G61560
dosa:Os06g0163000
osa:4340220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.559
排名 1 · TkA04G153050 · TK1151
细胞核0.303
排名 2 · TkA04G153050 · TK1151
细胞膜0.284
排名 3 · TkA04G153050 · TK1151
高尔基体0.045
排名 4 · TkA04G153050 · TK1151
内质网0.041
排名 5 · TkA04G153050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10146zf-C4H22-117 aa
PF17675APG6_N2-95 aa
PF02403Seryl_tRNA_N3-52 aa
PF03961FapA3-83 aa
PF20379DUF66746-66 aa
PF08581Tup_N6-34 aa
PF05130FlgN7-97 aa
PF06818Fez18-112 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G153050PF10146zf-C4H221170.004318.3
TkA04G153050PF17675APG6_N2952.19.5
TkA04G153050PF02403Seryl_tRNA_N3520.2612.3
TkA04G153050PF03961FapA3835.87.1
TkA04G153050PF20379DUF66746660.6110.4
TkA04G153050PF08581Tup_N6340.8110.8
TkA04G153050PF05130FlgN7971.59.9
TkA04G153050PF06818Fez181120.5711.3
TkA04G153050PF01496V_ATPase_I81040.958.0
TkA04G153050PF17561TssO8641.39.7
TkA04G153050PF20849TelK_muzzle10940.07313.8
TkA04G153050PF23649FKBP1513970.05313.8
TkA04G153050PF04977DivIC13622.58.7
TkA04G153050PF07889DUF166413655.17.9
TkA04G153050PF07714PK_Tyr_Ser-Thr14391e-39137.1
TkA04G153050PF00069Pkinase14391.1e-33117.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GUH1拟南芥sp|Q8GUH1|PUB33_ARATH U-box domain-containing protein 3349.500%Swiss-Prot中等置信
Q94A51拟南芥sp|Q94A51|PUB32_ARATH U-box domain-containing protein 3248.900%Swiss-Prot中等置信
Q9FKG5拟南芥sp|Q9FKG5|PUB51_ARATH U-box domain-containing protein 5141.400%Swiss-Prot中等置信
Q5WA76水稻sp|Q5WA76|PUB70_ORYSJ U-box domain-containing protein 7045.800%Swiss-Prot中等置信
Q0DR28水稻sp|Q0DR28|PUB57_ORYSJ U-box domain-containing protein 5740.600%Swiss-Prot中等置信

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