基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G142710
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 36905719-36911793
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3513 bp · TkA04G142710|TK1151|cDNA
AACAGAGGACAAGTGGACAACTGTGGCAAAATGTAGCCAGTTAGGGAAACGGCAGTACGAGTAGTGACGGCCGCTGCCACTTTTCTTCTTTTCCCCAACACCCTATTTACTAACGTCTATTCACCGCCGTTTGCCTCTCTCTCCCTCCCTCTTCTGCAACAACAGCAGTATTTTCTCTCTCTTCATAACAATTCGCCATTAAACACGACTATCCTCTCTCTGCCTTACAGTTCACGCCAAACGCCTGTTCTCTCTTCATT...
CDS
下载 CDS FASTA2898 bp · TkA04G142710|TK1151|CDS
ATGGAGCTTGGGTTACGTGTGTTAATGGCGGTTTTACTGATTCTGGTACCGTGTTCGACGTCTCTCAGCGACGAAGGGAAAGCTTTAATGTCTATAAAGGCGTCGTTTAGCAATATCGTGAATGTGCTACTGGATTGGGACGAAGATCAGAATGACGATCTCTGTTCATGGAGAGGGGTTCAATGTGATAATATCAGCACAACTGTTGTTGCTTTGAACCTGTCAAATTTGAACCTCGGAGGGGAAATTTCTCCGGCCAT...
965 aa · TkA04G142710|TK1151|PROTEIN
MELGLRVLMAVLLILVPCSTSLSDEGKALMSIKASFSNIVNVLLDWDEDQNDDLCSWRGVQCDNISTTVVALNLSNLNLGGEISPAIGDLRNLQSVDLQGNKLTGQIPDEIGSCVSLVLLDLSDNMLYGDIPFSISKLKQLELLNLKNNQITGPIPSTLTQIPNLKTLDLAQNRLTGEIPRLIYWNEVLQYLGLRGNSLTGTLSADMCQLTGLWYFDVRGNNLTGTIPDSIGNCTSFEILDISYNQISGEIPYNIGFLQV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G142710 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G142710 |
| OH-1004 ID | LXL04_017905 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 62.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 43.627 / OH-1004 44.286覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G142710 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:36905719-36911793 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ERECTA: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程 GO:0009553 embryo sac development 生物过程 GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程 GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程 GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程 GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程 GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程 GO:0010148 transpiration 生物过程 GO:0010286 heat acclimation 生物过程 GO:0030155 regulation of cell adhesion 生物过程 GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G26330 ath:AT5G62230 dosa:Os02g0777400 dosa:Os06g0130100 dosa:Os06g0203800 osa:4340000 osa:4340427 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.874
内质网0.080
细胞质0.064
细胞核0.041
溶酶体／液泡0.025
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263LRRNT_223-63 aaPF29252LRR_NLRC462-127 aaPF13516LRR_666-76 aaPF24141LRR_ComC68-133 aaPF24048LRR_NXF1-570-108 aaPF00560LRR_171-90 aaPF12799LRR_472-103 aaPF23598LRR_1485-170 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G142710 | PF08263 | LRRNT_2 | 23 | 63 | 2.5e-09 | 38.0 |
| TkA04G142710 | PF29252 | LRR_NLRC4 | 62 | 127 | 2.1 | 8.2 |
| TkA04G142710 | PF13516 | LRR_6 | 66 | 76 | 0.0033 | 18.1 |
| TkA04G142710 | PF24141 | LRR_ComC | 68 | 133 | 1.1e-08 | 35.8 |
| TkA04G142710 | PF24048 | LRR_NXF1-5 | 70 | 108 | 0.32 | 11.3 |
| TkA04G142710 | PF00560 | LRR_1 | 71 | 90 | 6.9e-57 | 177.8 |
| TkA04G142710 | PF12799 | LRR_4 | 72 | 103 | 2.8e-33 | 113.9 |
| TkA04G142710 | PF23598 | LRR_14 | 85 | 170 | 1.2e-29 | 103.9 |
| TkA04G142710 | PF13855 | LRR_8 | 86 | 127 | 2.3e-40 | 136.9 |
| TkA04G142710 | PF23211 | LRR_LRWD1 | 87 | 174 | 0.00021 | 21.8 |
| TkA04G142710 | PF13516 | LRR_6 | 91 | 105 | 0.0033 | 18.1 |
| TkA04G142710 | PF24048 | LRR_NXF1-5 | 91 | 146 | 0.32 | 11.3 |
| TkA04G142710 | PF00560 | LRR_1 | 92 | 114 | 6.9e-57 | 177.8 |
| TkA04G142710 | PF14580 | LRR_9 | 95 | 179 | 9.8 | 6.4 |
| TkA04G142710 | PF00706 | Toxin_4 | 97 | 114 | 0.011 | 16.8 |
| TkA04G142710 | PF25372 | LRR_FBXL15 | 98 | 154 | 0.082 | 12.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
C0LGW6 | 拟南芥 | sp|C0LGW6|ERL1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL1 | 70.500% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q6XAT2 | 拟南芥 | sp|Q6XAT2|ERL2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERL2 | 71.100% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q658G7 | 水稻 | sp|Q658G7|SIK1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase SIK1 | 68.100% | Swiss-Prot | 低置信 |
I1Z695 | 水稻 | sp|I1Z695|EREC2_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER2 | 61.300% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q69SP5 | 水稻 | sp|Q69SP5|EREC1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER1 | 58.000% | Swiss-Prot | 低置信 |