TkA04G141660 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G141660

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 36604774-36606389 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

867 bp · TkA04G141660|TK1151|cDNA

ATGGATCAACGTCCTCGATCCAGTGGCCGTCAGCACCCATCACCCGCCGGAAAACAACCGTTGCCCCGCCTGATACGTTGCAAAAGCGAAAATCCAGCCACATCCCCGCCGCCCTCCACTTTATCCAACAAATCAAACACCGTCACCAAATCACGCTCAAGATCCACTTCTAAAACGAGAAATTATAATGAGATGGAAGTCAATAGTTTCATGATTAACCTTCCGAGTCCGATGAAGATCAATACCGGCGTTACTAAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

867 bp · TkA04G141660|TK1151|CDS

ATGGATCAACGTCCTCGATCCAGTGGCCGTCAGCACCCATCACCCGCCGGAAAACAACCGTTGCCCCGCCTGATACGTTGCAAAAGCGAAAATCCAGCCACATCCCCGCCGCCCTCCACTTTATCCAACAAATCAAACACCGTCACCAAATCACGCTCAAGATCCACTTCTAAAACGAGAAATTATAATGAGATGGAAGTCAATAGTTTCATGATTAACCTTCCGAGTCCGATGAAGATCAATACCGGCGTTACTAAACC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

288 aa · TkA04G141660|TK1151|PROTEIN

MDQRPRSSGRQHPSPAGKQPLPRLIRCKSENPATSPPPSTLSNKSNTVTKSRSRSTSKTRNYNEMEVNSFMINLPSPMKINTGVTKPAGKKKVADVGSNGDGTSSEEADRHCSKLMNNRLLQWRFANARAEAAMSAVKTLAEKKTFNAWLKILAIRNSNMVKKMEVEKLERDIRLFHIMNSQLFLLEKWSGLEAKNSEAVGRVVRKLSVASLNIPLVDDSKGDTLAVRDALDNATRVLEDIESTIPKLCCQVDNSCYMLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G141660`
TK1151 ID	TkA04G141660
OH-1004 ID	LXL04_035341
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	81.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.917 / OH-1004 91.512 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G141660

位置 Chr04:36604774-36606389 (-)

描述 Similar to QWRF7: QWRF motif-containing protein 7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g25190`	含 QWRF 基序的蛋白 7。	暂无已核实直接文献
`At3g19570`	可能与微管相关的过氧化物酶体蛋白，参与叶绿体生物合成以及白化体中原膜体和原类囊体的形成。	暂无已核实直接文献
`At5g43160`	含有QWRF基序的蛋白质9。	暂无已核实直接文献
`At2g44190`	种子发育和胚乳微管功能所需的微管相关蛋白。	ENDOSPERM DEFECTIVE1 Is a Novel Microtubule-Associated Protein Essential for Seed Development in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.061812 Endosperm cellularization defines an important developmental transition for embryo development.2012 · DOI: 10.1242/dev.077057
`At3g60000`	含 QWRF 基序的蛋白 6。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035341 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0009658 chloroplast organization 生物过程

GO:0009960 endosperm development 生物过程

GO:0010342 endosperm cellularization 生物过程

GO:0048316 seed development 生物过程

GO:0051225 spindle assembly 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0005880 nuclear microtubule 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G24070

ath:AT2G44190

ath:AT3G19570

ath:AT4G25190

ath:AT4G30710

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.538

排名 1 · TkA04G141660 · TK1151

细胞质0.417

排名 2 · TkA04G141660 · TK1151

细胞膜0.096

排名 3 · TkA04G141660 · TK1151

内质网0.044

排名 4 · TkA04G141660 · TK1151

质体0.037

排名 5 · TkA04G141660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04484QWRF16-273 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G141660	`PF04484`	QWRF	16	273	2.3e-55	189.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q1PE51`	拟南芥	sp\|Q1PE51\|QWRF7_ARATH QWRF motif-containing protein 7	36.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8GXD9`	拟南芥	sp\|Q8GXD9\|SCO3_ARATH Protein SNOWY COTYLEDON 3	28.600%	Swiss-Prot	低置信
`F4K4M0`	拟南芥	sp\|F4K4M0\|QWRF9_ARATH QWRF motif-containing protein 9	31.300%	Swiss-Prot	中等置信
`O80588`	拟南芥	sp\|O80588\|EDE1_ARATH Protein ENDOSPERM DEFECTIVE 1	32.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5BPM6`	拟南芥	sp\|Q5BPM6\|QWRF6_ARATH QWRF motif-containing protein 6	30.700%	Swiss-Prot	中等置信

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