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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G102440
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 26626425-26630099 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2581 bp · TkA04G102440|TK1151|cDNA

CTTAACACACATTCTGCATCCCCACTGCAACCTAACTGAGCAGAGAGCGTTGGGGGGTGGGGGTGGGGTTGGGGTAGGGTAGAACAAGCGAAAAGTTTGCAAAAAGGGGCACCTAAAGATACCACCCACTAGACAATTCAAGTTTCTTTTTGGTTTTTTCCTCTCATTATCCCTTTTCCTATGGGATCCGTCTTTTGTTTCTGACCTGTTGCTGTTTTTCCAGTTCGCAGTTGTAGTAATTTGAGCAATTTTGGGGTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1899 bp · TkA04G102440|TK1151|CDS

ATGCAGAGAGAATCGGTGATGTCGTTTGTGAGAGGGTTGATCGCGGCGGTTCTTGTTCTGGTTCTGGTTCTAGTTCATCATGTTGAGCTCGTGAATGCAAATGTGGAAGGCGATGCTTTACATAGTTTAAGAACCAACTTAGAAGATCCCAATAGCGTTCTTCAAAGCTGGGACCCCACTCTTGTTAACCCCTGCACCTGGTTTCATGTCACCTGCAATAACGATAACAGTGTTATAAGAGTAGATTTGGGAAATGCAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

632 aa · TkA04G102440|TK1151|PROTEIN

MQRESVMSFVRGLIAAVLVLVLVLVHHVELVNANVEGDALHSLRTNLEDPNSVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNNDNSVIRVDLGNAALSGTLVPQLGLLKNLQYLELYSNNLSGPIPSDLGNLTNLVSLDLYLNDFSGPIPVTLGKLSKLRFLRLNNNSLTGPIPLPLTNITSLQVLDLSNNRLSGPVPDSGSFSLFTPISFANNLDLCGPVTGHPCPGSPPFSPPPPFVQPPPIAAPVGKSGTGAIAGGVAVGAALLFA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G102440
TK1151 IDTkA04G102440
OH-1004 IDLXL04_035857
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G102440
位置Chr04:26626425-26630099 (+)
描述Similar to SERK1: Somatic embryogenesis receptor kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g71830 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Role of threonines in the Arabidopsis thaliana somatic embryogenesis receptor kinase 1 activation loop in phosphorylation.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m102381200
In vivo hexamerization and characterization of the Arabidopsis AAA ATPase CDC48A complex using forster resonance energy transfer-fluorescence lifetime imaging microscopy and fluorescence correlation spectroscopy.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.103986
At1g34210 参与油菜素甾醇依赖和非依赖信号通路的丝氨酸/苏氨酸激酶。
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os08g0174700 LRR 受体激酶参与防御反应。
Engineering OsBAK1 gene as a molecular tool to improve rice architecture for high yield.2009 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2009.00444.x
A subset of OsSERK genes, including OsBAK1, affects normal growth and leaf development of rice.2011 · DOI: 10.1007/s10059-011-0178-4
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035857 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007030 Golgi organization 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0040008 regulation of growth 生物过程
GO:0045089 positive regulation of innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34210
ath:AT1G71830
dosa:Os04g0457800
dosa:Os08g0174700
osa:4336035
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.883
排名 1 · TkA04G102440 · TK1151
内质网0.076
排名 2 · TkA04G102440 · TK1151
细胞质0.073
排名 3 · TkA04G102440 · TK1151
细胞核0.048
排名 4 · TkA04G102440 · TK1151
溶酶体／液泡0.021
排名 5 · TkA04G102440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_234-73 aa
PF00560LRR_180-97 aa
PF23598LRR_1489-181 aa
PF13855LRR_899-135 aa
PF12799LRR_4100-136 aa
PF13516LRR_6100-114 aa
PF00560LRR_1101-123 aa
PF23211LRR_LRWD1101-162 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G102440PF08263LRRNT_234733.9e-1040.5
TkA04G102440PF00560LRR_180973.1e-1244.8
TkA04G102440PF23598LRR_14891817.5e-0935.5
TkA04G102440PF13855LRR_8991353.4e-0524.2
TkA04G102440PF12799LRR_41001362.6e-1040.9
TkA04G102440PF13516LRR_61001140.8810.5
TkA04G102440PF00560LRR_11011233.1e-1244.8
TkA04G102440PF23211LRR_LRWD11011620.001718.8
TkA04G102440PF13516LRR_61231370.8810.5
TkA04G102440PF00560LRR_11251473.1e-1244.8
TkA04G102440PF13855LRR_81441843.4e-0524.2
TkA04G102440PF13516LRR_61481620.8810.5
TkA04G102440PF00560LRR_11491703.1e-1244.8
TkA04G102440PF12799LRR_41491842.6e-1040.9
TkA04G102440PF13516LRR_61721850.8810.5
TkA04G102440PF00560LRR_11731913.1e-1244.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94AG2拟南芥sp|Q94AG2|SERK1_ARATH Somatic embryogenesis receptor kinase 190.900%Swiss-Prot高置信
Q9XIC7拟南芥sp|Q9XIC7|SERK2_ARATH Somatic embryogenesis receptor kinase 289.400%Swiss-Prot高置信
B8BB68水稻sp|B8BB68|BAK1_ORYSI LRR receptor kinase BAK191.300%Swiss-Prot高置信
Q6Z4U4水稻sp|Q6Z4U4|BAK1_ORYSJ LRR receptor kinase BAK191.300%Swiss-Prot高置信
Q7XV05水稻sp|Q7XV05|SERK2_ORYSJ LRR receptor kinase SERK289.200%Swiss-Prot高置信

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