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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G081450
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 21386426-21389601 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1854 bp · TkA04G081450|TK1151|cDNA

ATGAGTACCGAAGTCAGCTTTCAGATTTTGTTGATGGGGTTGTACGTGATCATGTTTGGTGTTATATCCACATCGGTTTCTGGTCAATGTCAAATCGACCAGCAATCGATTTTAATCCGATTGAAGAAGGAGTTACACTTCAGTTCTTCATTATCAACAAAACTAGTGTCTTGGGACCCAAATGTGACAGATTGTTGCACCTGGGTAGGAGTTAATTGCAGCATCGGGGGTGAAGTTATAGTTTGGAGCTTGTCAAACTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1854 bp · TkA04G081450|TK1151|CDS

ATGAGTACCGAAGTCAGCTTTCAGATTTTGTTGATGGGGTTGTACGTGATCATGTTTGGTGTTATATCCACATCGGTTTCTGGTCAATGTCAAATCGACCAGCAATCGATTTTAATCCGATTGAAGAAGGAGTTACACTTCAGTTCTTCATTATCAACAAAACTAGTGTCTTGGGACCCAAATGTGACAGATTGTTGCACCTGGGTAGGAGTTAATTGCAGCATCGGGGGTGAAGTTATAGTTTGGAGCTTGTCAAACTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

617 aa · TkA04G081450|TK1151|PROTEIN

MSTEVSFQILLMGLYVIMFGVISTSVSGQCQIDQQSILIRLKKELHFSSSLSTKLVSWDPNVTDCCTWVGVNCSIGGEVIVWSLSNCQLSGPFDDFLGKLKSLSVIRLAQNNLNTSVPDFFGDFRNLTVLYLGACNLGGTFPTEVLQLQNLKILDLSSNTNLHGSLIDFPANGSLQSLVLSNTDFSGEISESIGNLKSLPWIELSNSNFSGVIPNSMENLTQSLYLDMSSNKFTGQIPSFQLCKNLTHIDLSRNNLSGTI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G081450
TK1151 IDTkA04G081450
OH-1004 IDLXL04_036049
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)45.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 70.989 / OH-1004 58.554
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G081450
位置Chr04:21386426-21389601 (+)
描述Similar to RLP7: Receptor-like protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g74180 类受体蛋白14。 暂无已核实直接文献
At1g47890 受体样蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At5g27060 类受体蛋白 53。 暂无已核实直接文献
At3g11080 类受体蛋白 35。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q9ZUK7 受体样蛋白 18。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036049 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G45616
ath:AT1G47890
ath:AT2G15080
ath:AT3G05660
ath:AT3G11010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.852
排名 1 · TkA04G081450 · TK1151
内质网0.089
排名 2 · TkA04G081450 · TK1151
细胞质0.062
排名 3 · TkA04G081450 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA04G081450 · TK1151
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · TkA04G081450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_234-74 aa
PF13516LRR_682-90 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2182-109 aa
PF00560LRR_183-100 aa
PF12799LRR_483-120 aa
PF23598LRR_1483-163 aa
PF13855LRR_884-137 aa
PF23211LRR_LRWD192-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G081450PF08263LRRNT_234743.9e-0730.9
TkA04G081450PF13516LRR_682901.3e-0834.9
TkA04G081450PF25019LRR_R13L1-DRL21821090.00119.7
TkA04G081450PF00560LRR_1831005e-36115.6
TkA04G081450PF12799LRR_4831201.9e-2589.0
TkA04G081450PF23598LRR_14831634.6e-2175.7
TkA04G081450PF13855LRR_8841373.1e-2794.8
TkA04G081450PF23211LRR_LRWD1921600.01116.2
TkA04G081450PF25013LRR_Zer-1971617.9e-0936.5
TkA04G081450PF29252LRR_NLRC4991362.18.2
TkA04G081450PF24758LRR_At5g563701011618.1e-0626.4
TkA04G081450PF00560LRR_11021235e-36115.6
TkA04G081450PF25019LRR_R13L1-DRL211141570.00119.7
TkA04G081450PF13516LRR_61251391.3e-0834.9
TkA04G081450PF00560LRR_11261455e-36115.6
TkA04G081450PF12799LRR_41261621.9e-2589.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HTV4拟南芥sp|F4HTV4|RLP14_ARATH Receptor-like protein 1437.800%Swiss-Prot低置信
Q9C699拟南芥sp|Q9C699|RLP7_ARATH Receptor-like protein 728.000%Swiss-Prot低置信
Q9S9U3拟南芥sp|Q9S9U3|RLP53_ARATH Receptor-like protein 5331.400%Swiss-Prot低置信
Q9SRL7拟南芥sp|Q9SRL7|RLP35_ARATH Receptor-like protein 3535.600%Swiss-Prot低置信
Q9ZUK7拟南芥sp|Q9ZUK7|RLP18_ARATH Receptor-like protein 1835.000%Swiss-Prot低置信

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