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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G064520
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 17186954-17190201 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2796 bp · TkA04G064520|TK1151|cDNA

GATACAGAAAGCAGATGTGTTATAATGAGAAAAAAACGTGAAAAACTATAAACGCAGACCCTGAAACCATTTCTGCTGGGACACTCCCTCCTGCTCTCTCTCCCCAAATCTCAAAACCCAAAGGGGTCCACGGGAACCTAGATGCTATTTATGCTTTCTACCTGAGTCCATCTCAATGTTTCTGCAAGTCGTCGTTCAAGTCTGCATTTCCGTTTTTTTCAGGTGATGATAATCGTGGCTCTCTTCGTGAAACTTTGACA...

CDS

下载 CDS FASTA

2091 bp · TkA04G064520|TK1151|CDS

ATGGACCACACTTTCAATTCCGATTCAGTTCCTCTCGTTCCAGCAGACAAGACCAAGATCTTAATCGTCAAACCATTACGGTGTCTCATCCCAATCTTCCCATCACCACAAGACCCTTCCGCTCCACCTTCATCTCAATACGCATCCGTCCCTCCATCAGGTCCATTTCCACCTGGCGCCGCCCCCTTCTTCCCCTTCTTCACCTCCCCCAATTCCCAAAAACCAACCACCACACCACAACCACAACCACATAACCCTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

696 aa · TkA04G064520|TK1151|PROTEIN

MDHTFNSDSVPLVPADKTKILIVKPLRCLIPIFPSPQDPSAPPSSQYASVPPSGPFPPGAAPFFPFFTSPNSQKPTTTPQPQPHNPRSYPIPSPVPLNSFRTPTSQAKNGDIGPSKRTHTYTDEDGYSDLETGSEADDTRRRITRRRTIPANISVSNSDIDIDPLVTHLLTSFNLSEADTFRQSDSDKELVDRVLLVYNILRRKITQLDDTKDSISKVAKRPDLRAGTICMAKGARANIRKRVGPVPGVEIGDIFFFRFE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G064520
TK1151 IDTkA04G064520
OH-1004 IDLXL04_036197
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G064520
位置Chr04:17186954-17190201 (-)
描述Similar to SUVH1: Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04940 组蛋白甲基转移酶。
Pivotal role of AtSUVH2 in heterochromatic histone methylation and gene silencing in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7600604
At1g73100 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g17770 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At2g24740 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036197 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005694 chromosome 细胞组分
GO:0001228 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003690 double-stranded DNA binding 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0010385 double-stranded methylated DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17770
ath:AT1G73100
ath:AT2G24740
ath:AT5G04940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.938
排名 1 · TkA04G064520 · TK1151
细胞质0.088
排名 2 · TkA04G064520 · TK1151
细胞膜0.033
排名 3 · TkA04G064520 · TK1151
质体0.021
排名 4 · TkA04G064520 · TK1151
内质网0.019
排名 5 · TkA04G064520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02182SAD_SRA242-395 aa
PF26348SRA_ScoMcrA277-357 aa
PF05033Pre-SET429-532 aa
PF22038PRC2_EED_ins464-490 aa
PF23212DUF7064526-567 aa
PF00856SET551-669 aa
PF05033Pre-SET682-692 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G064520PF02182SAD_SRA2423953.6e-54183.3
TkA04G064520PF26348SRA_ScoMcrA2773570.01915.5
TkA04G064520PF05033Pre-SET4295329.8e-1658.9
TkA04G064520PF22038PRC2_EED_ins4644900.6110.8
TkA04G064520PF23212DUF70645265670.1812.2
TkA04G064520PF00856SET5516694.1e-2176.1
TkA04G064520PF05033Pre-SET6826929.8e-1658.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF80拟南芥sp|Q9FF80|SUVH1_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH146.900%Swiss-Prot中等置信
Q9C5P4拟南芥sp|Q9C5P4|SUVH3_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH346.800%Swiss-Prot中等置信
Q9C5P1拟南芥sp|Q9C5P1|SUVH7_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH740.400%Swiss-Prot中等置信
Q9C5P0拟南芥sp|Q9C5P0|SUVH8_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH840.900%Swiss-Prot中等置信

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