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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G060100
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 16039240-16042331 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2749 bp · TkA04G060100|TK1151|cDNA

GTTCATGAAATATGCCGTTTTTAGTTGCTTTGAGGAAAGCATGGAATAGTTTGCTAACAATAGTGGAACTTCTCCCCTGTTTCTTCTTCAACGCGTTCTTGACTGATCATCTTCAACTATCTGTAGTTTATCGGTGGGAAGGCATTATCTGGTCTCAATCCCGATCTTAAAGTTTACCTGCACTACAGAAATTTAACTTCTTCCAGTCCATCAATGGCTGCTGAAGCTTTGATCGGAGCTGGGGTAGGAGACGCCGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2442 bp · TkA04G060100|TK1151|CDS

ATGGCTGCTGAAGCTTTGATCGGAGCTGGGGTAGGAGACGCCGTTTCTAAGTTATCAGATGCCATCATACACGTATTAAAAACAACCTGGCAGTTTAGATCCAAACTCACTCAAATACAAGAAACCATAACGAGTAACAAACTGATCTTCGACGAAATCGAGAAACTAATTGAAGAATTGGATCGACCGAAAGAGGAAAAGGAGAAGTTCGTCGCTCAGATGAAAGGCGCGGAAGCTCTCGTTCTCAAATGCGAGCAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

813 aa · TkA04G060100|TK1151|PROTEIN

MAAEALIGAGVGDAVSKLSDAIIHVLKTTWQFRSKLTQIQETITSNKLIFDEIEKLIEELDRPKEEKEKFVAQMKGAEALVLKCEQIKWRFWKKYHHALKLDDLNASLLRFCQIDLQLMMMRGVMDLLMAKDVQMRMMKGDAARWSSGTPLLKGVVIGFDDRLRDLKAMVLKEASGDECSVVVVSAAGGSGKTTLATMLCHDSAIQEKFGRNIYFATISEIPNLKIAVQNLLQTNQAGQKFDFINDDEAISQWGRFLAEK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G060100
TK1151 IDTkA04G060100
OH-1004 IDLXL04_036257
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G060100
位置Chr04:16039240-16042331 (-)
描述Similar to At5g66900: Probable disease resistance protein At5g66900
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g66900 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g66910 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g33300 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g47280 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g33560 抗病（R）蛋白，通过水杨酸依赖方式介导对寄生霜霉的抗性。
Targeted activation tagging of the Arabidopsis NBS-LRR gene, ADR1, conveys resistance to virulent pathogens.2003 · DOI: 10.1094/mpmi.2003.16.8.669

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036257 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33300
ath:AT5G04720
ath:AT5G47280
ath:AT5G66900
ath:AT5G66910
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.608
排名 1 · TkA04G060100 · TK1151
细胞质0.235
排名 2 · TkA04G060100 · TK1151
细胞核0.150
排名 3 · TkA04G060100 · TK1151
内质网0.108
排名 4 · TkA04G060100 · TK1151
细胞外0.062
排名 5 · TkA04G060100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05659RPW84-130 aa
PF05729NACHT19-67 aa
PF01443Viral_helicase128-56 aa
PF17675APG6_N37-102 aa
PF00503G-alpha40-62 aa
PF20720nSTAND343-73 aa
PF25199nSTAND_NTPase548-66 aa
PF29645CHCH3_N52-75 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G060100PF05659RPW841307.1e-2484.8
TkA04G060100PF05729NACHT19670.04114.4
TkA04G060100PF01443Viral_helicase128560.2911.6
TkA04G060100PF17675APG6_N371020.05214.7
TkA04G060100PF00503G-alpha40620.002517.7
TkA04G060100PF20720nSTAND343737.1e-0523.3
TkA04G060100PF25199nSTAND_NTPase548668e-0523.2
TkA04G060100PF29645CHCH3_N52750.3511.8
TkA04G060100PF23404FAZ1_C54691.010.2
TkA04G060100PF23598LRR_141091344e-1143.0
TkA04G060100PF13191AAA_161612700.006317.8
TkA04G060100PF25199nSTAND_NTPase51702368e-0523.2
TkA04G060100PF00931NB-ARC1753244.4e-1246.6
TkA04G060100PF20720nSTAND31782807.1e-0523.3
TkA04G060100PF13481AAA_251802040.06313.6
TkA04G060100PF00503G-alpha1812970.002517.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKZ1拟南芥sp|Q9FKZ1|DRL42_ARATH Probable disease resistance protein At5g6690036.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FKZ0拟南芥sp|Q9FKZ0|DRL43_ARATH Probable disease resistance protein At5g6691033.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SZA7拟南芥sp|Q9SZA7|DRL29_ARATH Probable disease resistance protein At4g3330034.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LVT1拟南芥sp|Q9LVT1|DRL39_ARATH Putative disease resistance protein At5g4728032.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FW44拟南芥sp|Q9FW44|ADR1_ARATH Disease resistance protein ADR128.600%Swiss-Prot低置信

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