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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G043620
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 11740308-11741678 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

546 bp · TkA04G043620|TK1151|cDNA

ATGGCCGCTCCACCAGCAAGAGCACGAGCAGATTATGATTACCTCATAAAGCTCCTCTTGATTGGCGACAGCGGTGTGGGAAAGAGTTGCCTTCTTTTGCGATTTTCTGATGGATCTTTCACTACAAGCTTCATCACTACCATCGGTATTGATTTTAAGATAAGAACAATTGAACTTGATGGCAAACGGATCAAACTCCAAATCTGGGACACAGCTGGTCAGGAACGATTCCGAACAATCACAACTGCTTACTATAGGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

546 bp · TkA04G043620|TK1151|CDS

ATGGCCGCTCCACCAGCAAGAGCACGAGCAGATTATGATTACCTCATAAAGCTCCTCTTGATTGGCGACAGCGGTGTGGGAAAGAGTTGCCTTCTTTTGCGATTTTCTGATGGATCTTTCACTACAAGCTTCATCACTACCATCGGTATTGATTTTAAGATAAGAACAATTGAACTTGATGGCAAACGGATCAAACTCCAAATCTGGGACACAGCTGGTCAGGAACGATTCCGAACAATCACAACTGCTTACTATAGGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

181 aa · TkA04G043620|TK1151|PROTEIN

MAAPPARARADYDYLIKLLLIGDSGVGKSCLLLRFSDGSFTTSFITTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGILLVYDVTDESSFNNIRNWIRNIEQHASDNVNKILVGNKADMDESKRAVPTSKGQALADEYGIKFFETSAKTNLNVEQVFFSIATDIKQRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G043620
TK1151 IDTkA04G043620
OH-1004 IDLXL04_000526
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 83.796
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G043620
位置Chr04:11740308-11741678 (-)
描述Similar to RABE1C: Ras-related protein RABE1c
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46060 参与从高尔基体到质膜的膜转运。 暂无已核实直接文献
At3g53610 参与从高尔基体到质膜的膜转运。 暂无已核实直接文献
At5g03520 参与从高尔基体到质膜的膜转运。 暂无已核实直接文献
At3g09900 参与从高尔基体到质膜的膜转运。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000526 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G09900
ath:AT3G46060
ath:AT3G53610
ath:AT5G03520
bvg:104900163
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.555
排名 1 · TkA04G043620 · TK1151
高尔基体0.423
排名 2 · TkA04G043620 · TK1151
细胞膜0.168
排名 3 · TkA04G043620 · TK1151
溶酶体／液泡0.160
排名 4 · TkA04G043620 · TK1151
内质网0.140
排名 5 · TkA04G043620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00025Arf16-144 aa
PF00493MCM16-44 aa
PF00071Ras17-178 aa
PF08477Roc17-131 aa
PF00009GTP_EFTU17-32 aa
PF04670Gtr1_RagA17-132 aa
PF10662PduV-EutP17-169 aa
PF02421FeoB_N17-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G043620PF00025Arf161443.2e-1556.8
TkA04G043620PF00493MCM16440.1312.1
TkA04G043620PF00071Ras171784.5e-68228.6
TkA04G043620PF08477Roc171312.9e-35121.8
TkA04G043620PF00009GTP_EFTU17321.7e-0731.7
TkA04G043620PF04670Gtr1_RagA171320.0002321.4
TkA04G043620PF10662PduV-EutP171690.1113.1
TkA04G043620PF02421FeoB_N171690.1112.8
TkA04G043620PF01926MMR_HSR1181291e-0526.4
TkA04G043620PF13555AAA_2918320.05114.1
TkA04G043620PF13401AAA_2218370.2412.4
TkA04G043620PF03193RsgA_GTPase19366.1e-0523.6
TkA04G043620PF00009GTP_EFTU491731.7e-0731.7
TkA04G043620PF00493MCM83970.1312.1
TkA04G043620PF13124DUF3963941130.311.8
TkA04G043620PF03193RsgA_GTPase1111736.1e-0523.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P28186拟南芥sp|P28186|RAE1C_ARATH Ras-related protein RABE1c97.800%Swiss-Prot高置信
O24466拟南芥sp|O24466|RAE1A_ARATH Ras-related protein RABE1a97.200%Swiss-Prot高置信
Q9LZD4拟南芥sp|Q9LZD4|RAE1D_ARATH Ras-related protein RABE1d93.400%Swiss-Prot高置信
Q9SF91拟南芥sp|Q9SF91|RAE1E_ARATH Ras-related protein RABE1e93.400%Swiss-Prot高置信

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