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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G024690
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 6401816-6404447 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1895 bp · TkA04G024690|TK1151|cDNA

GCAATTTTCACCAAAGTCTTCTCTCTCCCATTGGTCTCCCAAAAAATGGGAGAGAACCAAATGGGATATTCTCTTCAGAAATTTCAACTATTGGGTCAAAATCTTGATAATTTCTCTTGAATAATTAGACCTTTAGATTTACAGCCACAATAGGCTTTTGCATATTCTGATTCTAGGGTTTCAAGTTTCAACATACACAAAGAGGATTCTTCAAATAGATTGACAGCATGGGCTGTTTTTCATGTTTTCCGAAAGAACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1110 bp · TkA04G024690|TK1151|CDS

ATGGGCTGTTTTTCATGTTTTCCGAAAGAACGACAACCCATCGAAACTGGGACACAAGGAAAGACACAAAAAAACAATTGTTTTCCGTGTTTCCAAACACAAAAGTCAACCCAAACAAACAAAGACCCAACGGTAGAAAAGACACCAAAGATGGATTGTTTCTCATGTTTTCGAAAGAAAGAATCTATACAAGAGAAGACACAAAAACCGAATTATTTCACATGTTTCAAGGCAGAAGTAAATGAAGACTCCCCCGAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

369 aa · TkA04G024690|TK1151|PROTEIN

MGCFSCFPKERQPIETGTQGKTQKNNCFPCFQTQKSTQTNKDPTVEKTPKMDCFSCFRKKESIQEKTQKPNYFTCFKAEVNEDSPEIKKRKRKCFSCFPTRPKKDSTQGKRRKMIRFSCFATKWKRRNNKMKRFGNCHCLPFRFKKNKVSDEFDDQDFLLPKKAKNNANKNISAKIFSFKELATATKNFKEECILGEGGFGRVYKGKLEKTGEVVAVKQLNREGKQGNREFHVEVMMLSHLCHQHLVKLVGYCADGDQRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G024690
TK1151 IDTkA04G024690
OH-1004 IDLXL04_000850
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 50.949 / OH-1004 44.340
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G024690
位置Chr04:6401816-6404447 (+)
描述Similar to PBL26: Probable serine/threonine-protein kinase PBL26
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g07070 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At5g18610 可能作为受体样胞质激酶，参与几丁质诱导的免疫信号转导。
Selective regulation of the chitin-induced defense response by the Arabidopsis receptor-like cytoplasmic kinase PBL27.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12535
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At3g24790 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At5g13160 抗病 蛋白 RPS5 介导的植物防御机制所需的蛋白激酶。
The Arabidopsis PBS1 resistance gene encodes a member of a novel protein kinase subfamily.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01014.x
Cleavage of Arabidopsis PBS1 by a bacterial type III effector.2003 · DOI: 10.1126/science.1085671
Indirect activation of a plant nucleotide binding site-leucine-rich repeat protein by a bacterial protease.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0608779104
Receptor-like cytoplasmic kinases integrate signaling from multiple plant immune receptors and are targeted by a Pseudomonas syringae effector.2010 · DOI: 10.1016/j.chom.2010.03.007
Activation of a plant nucleotide binding-leucine rich repeat disease resistance protein by a modified self protein.2012 · DOI: 10.1111/j.1462-5822.2012.01779.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0372100 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中充当 CERK1 的直接下游信号传导伴侣。
A receptor-like cytoplasmic kinase targeted by a plant pathogen effector is directly phosphorylated by the chitin receptor and mediates rice immunity.2013 · DOI: 10.1016/j.chom.2013.02.007
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000850 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071323 cellular response to chitin 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G07070
ath:AT3G24790
ath:AT4G13190
ath:AT5G02800
ath:AT5G18610
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.763
排名 1 · TkA04G024690 · TK1151
细胞质0.155
排名 2 · TkA04G024690 · TK1151
细胞核0.126
排名 3 · TkA04G024690 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA04G024690 · TK1151
高尔基体0.029
排名 5 · TkA04G024690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02497Arteri_GP423-65 aa
PF12260PIP49_C31-73 aa
PF03109ABC1189-220 aa
PF00069Pkinase190-342 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr193-341 aa
PF12260PIP49_C234-335 aa
PF03109ABC1303-339 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G024690PF02497Arteri_GP423656.07.7
TkA04G024690PF12260PIP49_C31730.05513.8
TkA04G024690PF03109ABC11892200.01115.7
TkA04G024690PF00069Pkinase1903424.7e-34118.7
TkA04G024690PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1933413.5e-34119.0
TkA04G024690PF12260PIP49_C2343350.05513.8
TkA04G024690PF03109ABC13033390.01115.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SFT7拟南芥sp|Q9SFT7|PBL26_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2675.700%Swiss-Prot中等置信
Q1PDV6拟南芥sp|Q1PDV6|PBL27_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBL2773.900%Swiss-Prot低置信
Q9LRY1拟南芥sp|Q9LRY1|PBL25_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2571.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FE20拟南芥sp|Q9FE20|PBS1_ARATH Serine/threonine-protein kinase PBS170.100%Swiss-Prot低置信
Q6I5Q6水稻sp|Q6I5Q6|RK185_ORYSJ Receptor-like cytoplasmic kinase 18570.700%Swiss-Prot低置信

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