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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G018000
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 4509097-4524587 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

7059 bp · TkA04G018000|TK1151|cDNA

GTTTAAATAATTGATAAATTTATTTACTTTTCTTATGTACACACGATAATGTTTACGATAGATACAACAACATGATATATATATACAATAAAGTAGTGGTAATATAACAGCAAACTTACATACATGGTGGAAATACACTAGAGTCGAATAGTGCACATGACTGCAGTTTTGAAATCCAAATGTTGTTGGAATGGCGGTTTAGTAATTAGGGTTCTCCATGTCTTGTTTCCAGGATGGTATATTTGTAAAAACAGAGATAA...

CDS

下载 CDS FASTA

5115 bp · TkA04G018000|TK1151|CDS

ATGGGTGCTACGACAAATATTATCGTAGGTTCCCCTGTATGGGTTGAAGACCTATCAGTTGCTTGGATTGATGGAGAAGTGTTAGGAATAAATGGAGAGGAAGCTGAGATACAAACTACTGATGGAAAGAAAGTTGTTGCGAATTTATCAAAAATATATTCCAAAGATGTGGAAGCTCCTGCTGGTGGAGTTGATGACATGACAAAGCTTTCTTATTTGCATGAGCCAGGAGTTTTGCAAAATTTAGCTACCAGATATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1704 aa · TkA04G018000|TK1151|PROTEIN

MGATTNIIVGSPVWVEDLSVAWIDGEVLGINGEEAEIQTTDGKKVVANLSKIYSKDVEAPAGGVDDMTKLSYLHEPGVLQNLATRYQLNEIYTYTGNILIAVNPFKRLPHLYDDKMMQRYKGAAFGDLDPHVFAIAESAFRAMVNEGKSNSILVSGESGAGKTETTKMLMQYLAFLGGRKGTEGKRTVEQQILESNPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIQFDKQGRISGAAIRTYLLERSRVCQISDPERNYHCFYL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G018000
TK1151 IDTkA04G018000
OH-1004 IDLXL04_036901
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.941 / OH-1004 99.883
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G018000
位置Chr04:4509097-4524587 (+)
描述Similar to XI-A: Myosin-7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08730 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g54560 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At5g20490 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g17580 肌球蛋白重链，是细胞周期调节的各种细胞器和蛋白质分离所需的重链。
Enzymatic activity and motility of recombinant Arabidopsis myosin XI, MYA1.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm054
A comparative study of the involvement of 17 Arabidopsis myosin family members on the motility of Golgi and other organelles.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.136853
Myosin XIK is a major player in cytoplasm dynamics and is regulated by two amino acids in its tail.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err265
At1g04160 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036901 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007015 actin filament organization 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0030048 actin filament-based movement 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0015629 actin cytoskeleton 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0016459 myosin complex 细胞组分
GO:0000146 microfilament motor activity 分子功能
GO:0003774 cytoskeletal motor activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04600
ath:AT1G08730
ath:AT1G54560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.572
排名 1 · TkA04G018000 · TK1151
细胞膜0.261
排名 2 · TkA04G018000 · TK1151
细胞核0.170
排名 3 · TkA04G018000 · TK1151
高尔基体0.125
排名 4 · TkA04G018000 · TK1151
溶酶体／液泡0.066
排名 5 · TkA04G018000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02736Myosin_N5-53 aa
PF00063Myosin_head64-726 aa
PF13191AAA_16139-173 aa
PF13401AAA_22150-172 aa
PF07475Hpr_kinase_C152-170 aa
PF07728AAA_5152-173 aa
PF07728AAA_5317-377 aa
PF07475Hpr_kinase_C430-498 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G018000PF02736Myosin_N5531.2e-0628.8
TkA04G018000PF00063Myosin_head647269.1e-257854.4
TkA04G018000PF13191AAA_161391730.01416.7
TkA04G018000PF13401AAA_221501720.04914.7
TkA04G018000PF07475Hpr_kinase_C1521701.39.2
TkA04G018000PF07728AAA_51521737.37.3
TkA04G018000PF07728AAA_53173777.37.3
TkA04G018000PF07475Hpr_kinase_C4304981.39.2
TkA04G018000PF07728AAA_54535247.37.3
TkA04G018000PF00612IQ7477614.1e-1039.2
TkA04G018000PF00612IQ7667824.1e-1039.2
TkA04G018000PF00612IQ7918094.1e-1039.2
TkA04G018000PF00612IQ8158334.1e-1039.2
TkA04G018000PF00612IQ8398574.1e-1039.2
TkA04G018000PF00612IQ8628814.1e-1039.2
TkA04G018000PF28422CCDC8988811290.0003820.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HXP9拟南芥sp|F4HXP9|MYO9_ARATH Myosin-962.100%Swiss-Prot高置信
F4HWY6拟南芥sp|F4HWY6|MYO11_ARATH Myosin-1164.700%Swiss-Prot高置信
F4K5J1拟南芥sp|F4K5J1|MYO17_ARATH Myosin-1760.500%Swiss-Prot高置信
Q39160拟南芥sp|Q39160|MYO5_ARATH Myosin-556.300%Swiss-Prot高置信
F4I460拟南芥sp|F4I460|MYO8_ARATH Myosin-854.000%Swiss-Prot高置信

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