TkA04G017750 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G017750

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 4447390-4449637 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1374 bp · TkA04G017750|TK1151|cDNA

TCCTCATATTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTTAAATTGCACCAATTCTCTATCTCTGCATAAATTACTCCTTTTTTCGAATTAAAAACACAGAAATTATGTTCCTGGTGTGCTTATGTCGTGGGAATTCTCTGCGTGAATCAACGGAAAGTTTCTCCCTCACACATCCAGAAACCCAATATGAAGATTTAAAGAATCTTTTGTTAGGGCTCTTGTAACTTCCTGGGGAAAAAGATGTGTTTGAATTTACTATAATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

426 bp · TkA04G017750|TK1151|CDS

ATGGAAGGAAGTGTGACGACTTTAGATGGAAGTTCGTTTCATTTGATTGGGTCTTCTCGGTCAACTGACCAAGGTACTTATCAACACAAACCGAGGTGTTCTGCTAGAGGAGATGATGGAAGCGTGAAATGTGGGAGTTCTGGTAGATGTCATTGCTCTAAAAAAAGGAAACATAGGGTTAAGAGGTCGATCAAAGTGCCAGCTGTCAGTAACAAGCTTGCAGATATACCTCCAGATGAATATTCATGGAGGAAATATGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

141 aa · TkA04G017750|TK1151|PROTEIN

MEGSVTTLDGSSFHLIGSSRSTDQGTYQHKPRCSARGDDGSVKCGSSGRCHCSKKRKHRVKRSIKVPAVSNKLADIPPDEYSWRKYGQKPIKGSPHPRCSSMRGCPARKHVERCLDDSTMLIVTYEGEHNHTRLPSQSANT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G017750`
TK1151 ID	TkA04G017750
OH-1004 ID	LXL04_036911
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	97.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 36.709 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G017750

位置 Chr04:4447390-4449637 (+)

描述 Similar to WRKY21: Probable WRKY transcription factor 21

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30590`	转录因子。	暂无已核实直接文献
`At3g04670`	转录因子。	暂无已核实直接文献
`At5g28650`	转录因子。	暂无已核实直接文献
`At2g24570`	转录因子。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036911 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009682 induced systemic resistance 生物过程

GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:2000022 regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能

GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G24570

ath:AT2G30590

ath:AT3G04670

ath:AT4G31550

ath:AT5G28650

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.909

排名 1 · TkA04G017750 · TK1151

细胞质0.176

排名 2 · TkA04G017750 · TK1151

细胞膜0.025

排名 3 · TkA04G017750 · TK1151

线粒体0.025

排名 4 · TkA04G017750 · TK1151

内质网0.013

排名 5 · TkA04G017750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03106WRKY28-35 aa

PF10533Plant_zn_clust31-75 aa

PF03106WRKY43-58 aa

PF03106WRKY79-131 aa

PF10533Plant_zn_clust98-107 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G017750	`PF03106`	WRKY	28	35	7.5e-21	74.8
TkA04G017750	`PF10533`	Plant_zn_clust	31	75	1.6e-17	64.0
TkA04G017750	`PF03106`	WRKY	43	58	7.5e-21	74.8
TkA04G017750	`PF03106`	WRKY	79	131	7.5e-21	74.8
TkA04G017750	`PF10533`	Plant_zn_clust	98	107	1.6e-17	64.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O04336`	拟南芥	sp\|O04336\|WRK21_ARATH Probable WRKY transcription factor 21	66.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SR07`	拟南芥	sp\|Q9SR07\|WRK39_ARATH Probable WRKY transcription factor 39	71.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q93WU6`	拟南芥	sp\|Q93WU6\|WRK74_ARATH Probable WRKY transcription factor 74	70.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SJA8`	拟南芥	sp\|Q9SJA8\|WRK17_ARATH Probable WRKY transcription factor 17	72.700%	Swiss-Prot	中等置信

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