TkA04G013090 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G013090

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 3249819-3251399 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1518 bp · TkA04G013090|TK1151|cDNA

ATAATCACCCCTTATATAAATACAACGTCCCACCACCTTCGTTCCACTCTTTACCCACACACACACAAACTGTGACACTGTTTCGATCGACCTTACACCATTAATGTATCACAGAAAGAAAGCGTGAGTACCTCTTGCTTATAGAAGTTGAGGCTCCCTTTTGAGGCAAGTTCCGGGGATTAATTTGGTAAGATCTCAATATACGAGTAAAAATGGCGGTGGAGATTAGTAAAATTACATTGGAGATATTTTCGAAGCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1161 bp · TkA04G013090|TK1151|CDS

ATGGCGGTGGAGATTAGTAAAATTACATTGGAGATATTTTCGAAGCTTGAGAAGAAATGGCTGTCGCACTGTGAAGGCAGTAAGAAGACAAGAGTGCTCAGCATTGATGGTGGTGGAACCACTGGGGTTGTCTCAGGAGCTTCGTTGATCCATCTCGAAGACCAGATCCAGGCAAAAACTGGTGATTCGAATGCTCGAATAGTCGATTTCTTCGATATTATTGCTGGAACCGGCATTGGCGCGCTTCTCGCTGTAATGCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

386 aa · TkA04G013090|TK1151|PROTEIN

MAVEISKITLEIFSKLEKKWLSHCEGSKKTRVLSIDGGGTTGVVSGASLIHLEDQIQAKTGDSNARIVDFFDIIAGTGIGALLAVMLNADDGNGRPLFTATDAVKFVNDRRTQLFKVKTVGVFRRRLVYSGKSMDKVLKEVLTRDDGKVLTLKDTCKPLLVPCFDLNSSAPFVFSRADASQSASYDFELWKVIRATSADPSMLKPFPLTSVDEKTSCLAIDGGIVMNNPSAIAVTHALHNKRDFPSLTGVENLVVISMGN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G013090`
TK1151 ID	TkA04G013090
OH-1004 ID	LXL04_036974
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G013090

位置 Chr04:3249819-3251399 (-)

描述 Similar to PLP9: Probable inactive patatin-like protein 9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g63200`	可能的不活跃类巴塔丁蛋白 9。	暂无已核实直接文献
`At2g39220`	具有非特异性脂肪分解酰基水解酶 (LAH) 活性。	暂无已核实直接文献
`At3g54950`	具有非特异性脂肪分解酰基水解酶 (LAH) 活性。	暂无已核实直接文献
`At4g29800`	具有非特异性脂肪分解酰基水解酶 (LAH) 活性。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8B7E7`	具有非特异性脂肪分解酰基水解酶 (LAH) 活性。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036974 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006644 phospholipid metabolic process 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0019374 galactolipid metabolic process 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004620 glycerophospholipase activity 分子功能

GO:0016298 lipase activity 分子功能

GO:0016787 hydrolase activity 分子功能

GO:0047617 fatty acyl-CoA hydrolase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G39220

ath:AT3G54950

ath:AT3G63200

ath:AT4G29800

dosa:Os07g0144500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.436

排名 1 · TkA04G013090 · TK1151

细胞核0.243

排名 2 · TkA04G013090 · TK1151

线粒体0.166

排名 3 · TkA04G013090 · TK1151

细胞膜0.160

排名 4 · TkA04G013090 · TK1151

内质网0.064

排名 5 · TkA04G013090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01734Patatin33-233 aa

PF30609DnaJ_pico_M33-66 aa

PF16091DUF482094-183 aa

PF30609DnaJ_pico_M278-366 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G013090	`PF01734`	Patatin	33	233	1e-17	65.7
TkA04G013090	`PF30609`	DnaJ_pico_M	33	66	0.00065	20.4
TkA04G013090	`PF16091`	DUF4820	94	183	0.21	11.7
TkA04G013090	`PF30609`	DnaJ_pico_M	278	366	0.00065	20.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93ZQ3`	拟南芥	sp\|Q93ZQ3\|PLP9_ARATH Probable inactive patatin-like protein 9	66.000%	Swiss-Prot	高置信
`O80959`	拟南芥	sp\|O80959\|PLP6_ARATH Patatin-like protein 6	39.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SV43`	拟南芥	sp\|Q9SV43\|PLP7_ARATH Patatin-like protein 7	38.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8H133`	拟南芥	sp\|Q8H133\|PLP8_ARATH Patatin-like protein 8	38.300%	Swiss-Prot	中等置信
`B8B7E7`	水稻	sp\|B8B7E7\|PLP3_ORYSI Patatin-like protein 3	37.200%	Swiss-Prot	中等置信

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