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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G618150
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 157087103-157092833 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3441 bp · TkA03G618150|TK1151|cDNA

AAAAGGTAAGCAAATGGAAGAATAGAACGTTGTGTTGATTTTTTTGATTGATAATAATAACCGCAATCAACAAGTTGAGGTTTCTATGGAATTCCGATGAATCCTGGTTGTTGAAGTTTGATTTCATTCGTATTTTGCTTCCAACTAAAAACATCCGCCTAAATTAACTCAATTCCTGTGTTCTCAGTCCGTACTTTCTCTAGGGTTTTTCCTCACTCCACTCTTCCATCGCTTTTCTCTCTCATTTCTTTATTTCTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2445 bp · TkA03G618150|TK1151|CDS

ATGCATTTCGCAAAACTCGACGACTCTCCGATGTTCCGTAAACAGATGCAGTGTTTAGAGGAAAGTGCGGAATTGCTGAGGGACAGAAGCTTAAAATTCTACAAAGGATGTAGAAAATATACTGAAGGGCTGGGCGAGGGATATGATGGGGACATTGCTTTTGCCAGTACCCTTGAAACATTCGGCGGAGGACATAATGATCCAATTAGTGTCGCTTTTGGAGGTCCTGTAATGACAAAATTTACAATTGCACTACGGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

814 aa · TkA03G618150|TK1151|PROTEIN

MHFAKLDDSPMFRKQMQCLEESAELLRDRSLKFYKGCRKYTEGLGEGYDGDIAFASTLETFGGGHNDPISVAFGGPVMTKFTIALREIGTYKEVLRSQVEHILNDRLLQFVNIDLHDVKEARKRFDKASLVYDQAREKFLSLKKGTKNDVATVLEEDLHNARATFEQARFNLVTALSNVEAKKRFEFLEAVSGTMDAHLRYFKQGYELLHQMEPYINQVLTYAQQSRERSNYEQAALNERMQEYKRQIDRESRCSSNGSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G618150
TK1151 IDTkA03G618150
OH-1004 IDLXL04_011755
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G618150
位置Chr03:157087103-157092833 (-)
描述Similar to AGD3: ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13300 ADP 核糖基化因子 的 GTP 酶激活蛋白。
A series of novel mutants of Arabidopsis thaliana that are defective in the formation of continuous vascular network: calling the auxin signal flow canalization hypothesis into question.2000 · DOI: 10.1242/dev.127.15.3197
VAN3 ARF-GAP-mediated vesicle transport is involved in leaf vascular network formation.2005 · DOI: 10.1242/dev.01716
At5g61980 推测的 GTP酶激活蛋白（通过相似性）。
A class I ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein is critical for maintaining directional root hair growth in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.119529
At1g60860 可能的 GTP 酶激活蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g10870 可能的 GTP 酶激活蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011755 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006897 endocytosis 生物过程
GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0032456 endocytic recycling 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:1990090 cellular response to nerve growth factor stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10870
ath:AT1G60860
ath:AT5G13300
ath:AT5G61980
gga:424895
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.646
排名 1 · TkA03G618150 · TK1151
细胞膜0.286
排名 2 · TkA03G618150 · TK1151
细胞核0.185
排名 3 · TkA03G618150 · TK1151
高尔基体0.110
排名 4 · TkA03G618150 · TK1151
溶酶体／液泡0.074
排名 5 · TkA03G618150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16746BAR_36-235 aa
PF07739TipAS21-64 aa
PF03114BAR75-216 aa
PF10455BAR_278-211 aa
PF07739TipAS119-160 aa
PF08287DASH_Spc19207-264 aa
PF07739TipAS222-298 aa
PF20042DUF6444236-287 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G618150PF16746BAR_362353e-38132.5
TkA03G618150PF07739TipAS21640.03215.5
TkA03G618150PF03114BAR752166.5e-1452.9
TkA03G618150PF10455BAR_2782110.002517.8
TkA03G618150PF07739TipAS1191600.03215.5
TkA03G618150PF08287DASH_Spc192072640.6110.7
TkA03G618150PF07739TipAS2222980.03215.5
TkA03G618150PF20042DUF64442362870.05714.8
TkA03G618150PF20399PH_202883280.001819.0
TkA03G618150PF00169PH2914374.5e-1247.1
TkA03G618150PF15409PH_82913290.001119.9
TkA03G618150PF15413PH_113074330.0004921.2
TkA03G618150PF08287DASH_Spc193854410.6110.7
TkA03G618150PF15409PH_83924340.001119.9
TkA03G618150PF01412ArfGap5065923.4e-31108.5
TkA03G618150PF23745ANK_LRRK26416780.002418.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5W7F2拟南芥sp|Q5W7F2|AGD3_ARATH ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD370.500%Swiss-Prot高置信
Q9FIT8拟南芥sp|Q9FIT8|AGD1_ARATH ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD162.800%Swiss-Prot高置信
Q9C6C3拟南芥sp|Q9C6C3|AGD2_ARATH ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD243.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SMX5拟南芥sp|Q9SMX5|AGD4_ARATH ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD443.900%Swiss-Prot中等置信

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