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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G586890
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 149140933-149142945 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1531 bp · TkA03G586890|TK1151|cDNA

AGCACTTTTCGCATCTACTCCGAGTAACTTGTGCTGACTTTTTTTTGAGATCCTGTCAAAAACAGACAAGAAAATATCAAAATAATCTCAAAATTCATCACCTCTTCTCTTTGCACCGGAAATATAGGATTTTTAGTAGTCAAAAGAAATTGATCTTTTAACTAATGGATGAAAACAGAAGATCGATGTCATCGTCGGCACCGTATTTACCTCCTACGATCTCAATACCTGCAAGTTCGACGTTGGATAACATGTTCGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1110 bp · TkA03G586890|TK1151|CDS

ATGACCTTACTCTCGAACTTTATGTCGGAGAACGATAGGGAATCTGATTATCGTTCATTCTCTCAGCTTTTAGCTGGAACCATATCATCGTCGGCAGAAATTCCAGGCCGTATCCCGCCTCCCGATCTCGATTCCGTTGCTTCTTTTACGGAGAACGCCGGTACCAGATGCGTTGACTTTCCGTATAGTACCGCCGGTCGACCATCGGTTTTGGCGGTTACGCAGACGTCCATGTTTACGATTCCTCCGGGATTAAGTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

369 aa · TkA03G586890|TK1151|PROTEIN

MTLLSNFMSENDRESDYRSFSQLLAGTISSSAEIPGRIPPPDLDSVASFTENAGTRCVDFPYSTAGRPSVLAVTQTSMFTIPPGLSPATLLNSPGFIPSAQASYGTSHQQATTHHRLPPSMADQYAMKPELSISGGHLQPIPADKPAEDGYNWRKYGQKQVKGSDYPRSYYRCTNQHCPVKKKVERSPDGLVTEIIYKGKHSHQPPRSIGPSGELGQTHKFNDSKEDQESGHEQSGSHDSDGGSDDVAKPQTKKRNVEVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G586890
TK1151 IDTkA03G586890
OH-1004 IDLXL04_011428
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.645 / OH-1004 85.849
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G586890
位置Chr03:149140933-149142945 (+)
描述Similar to WRKY4: Probable WRKY transcription factor 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g13960 特异性结合W盒（5′-(T)TGAC[CT]-3′）的转录因子；W盒是一类常见的激发子应答顺式作用元件。
Roles of Arabidopsis WRKY3 and WRKY4 transcription factors in plant responses to pathogens.2008 · DOI: 10.1186/1471-2229-8-68
Structural basis for sequence-specific DNA recognition by an Arabidopsis WRKY transcription factor.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.279844
At2g03340 转录因子。 暂无已核实直接文献
At3g01080 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q6B6R4 转录抑制因子（根据相似性）。 暂无已核实直接文献
Os01g0826400 可能参与脱落酸和赤霉素信号的转录调控。
Annotations and functional analyses of the rice WRKY gene superfamily reveal positive and negative regulators of abscisic acid signaling in aleurone cells.2005 · DOI: 10.1104/pp.104.054312
A negative regulator encoded by a rice WRKY gene represses both abscisic acid and gibberellins signaling in aleurone cells.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9463-4
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011428 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009938 negative regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13960
ath:AT2G03340
ath:AT3G01080
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.933
排名 1 · TkA03G586890 · TK1151
细胞质0.171
排名 2 · TkA03G586890 · TK1151
线粒体0.022
排名 3 · TkA03G586890 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA03G586890 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA03G586890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03119DNA_ligase_ZBD54-58 aa
PF03106WRKY148-204 aa
PF03108DBD_Tnp_Mut160-189 aa
PF18423zf_CopZ168-180 aa
PF04606Ogr_Delta168-178 aa
PF03119DNA_ligase_ZBD171-179 aa
PF03106WRKY288-344 aa
PF03108DBD_Tnp_Mut306-332 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G586890PF03119DNA_ligase_ZBD54585.57.6
TkA03G586890PF03106WRKY1482041.1e-51173.6
TkA03G586890PF03108DBD_Tnp_Mut1601890.1912.1
TkA03G586890PF18423zf_CopZ1681800.07413.7
TkA03G586890PF04606Ogr_Delta1681780.1512.7
TkA03G586890PF03119DNA_ligase_ZBD1711795.57.6
TkA03G586890PF03106WRKY2883441.1e-51173.6
TkA03G586890PF03108DBD_Tnp_Mut3063320.1912.1
TkA03G586890PF18423zf_CopZ3083200.07413.7
TkA03G586890PF04606Ogr_Delta3083180.1512.7
TkA03G586890PF03119DNA_ligase_ZBD3113195.57.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XI90拟南芥sp|Q9XI90|WRKY4_ARATH Probable WRKY transcription factor 445.600%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQ70拟南芥sp|Q9ZQ70|WRKY3_ARATH Probable WRKY transcription factor 341.600%Swiss-Prot中等置信
Q93WU7拟南芥sp|Q93WU7|WRK58_ARATH Probable WRKY transcription factor 5849.700%Swiss-Prot中等置信
Q6B6R4水稻sp|Q6B6R4|WRK24_ORYSI WRKY transcription factor WRKY2444.000%Swiss-Prot中等置信
Q6IEQ7水稻sp|Q6IEQ7|WRK24_ORYSJ WRKY transcription factor WRKY2449.600%Swiss-Prot中等置信

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