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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G585000
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 148540611-148544506 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2312 bp · TkA03G585000|TK1151|cDNA

ACCACATGTATTTTTTTAAAATATTTGGTCTTGTATTACAATATAATACCATTATTTATTTATAGTATATGTTAATCTTGGCTCTTAAAAAAACAAAGGAAGAACGGGACCATAGTATGATGACGATGTACCAATTTTGGGCCTCCAGAAACCAACCAAATGTTGAAATCATGAACATAAAACAAATACTTTAATCAAAGAAAAAGGTTCAACAACCGATTTTCGATGCAGTTACCTTCTTTAGATTCTTTGGAACAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1680 bp · TkA03G585000|TK1151|CDS

ATGGGTACTATGCAAACTTGGCGGAAAGCCTACGGTGCTCTCAAGGATCAAACCAAAGTCGGGTTAGCCCACGTTAACAGCGATTTCAAGGATGTGGATGTTGCGATCGTTAAAGCTACAAATCACGTGGAATGCCCACCGAAAGAGAGACACATCAGAAAGGTTTTGGTTGCTTCTTCTGCGCTTCGACCTCGAGCAGATGTACAATACTGTTTACATGCCCTAGCAAGGCGATTAGCCAAGACCCGCAATTGGACGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

559 aa · TkA03G585000|TK1151|PROTEIN

MGTMQTWRKAYGALKDQTKVGLAHVNSDFKDVDVAIVKATNHVECPPKERHIRKVLVASSALRPRADVQYCLHALARRLAKTRNWTVALKTLIVIHRALREGDPTFREELLNFQQRGRVLQLANFKDDSSPIAWDCSAWVRTYGLFLEERLECFKILKYDIEAERIPRPAQGEENKGYSRTRDLDSEQLLEQLPSLQQLLYRLMGCRPEGAAIGNYVIQYALALVLKESFKIYCAVNDGIINLIDKFFEMPRHEAIKALD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G585000
TK1151 IDTkA03G585000
OH-1004 IDLXL04_011369
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G585000
位置Chr03:148540611-148544506 (+)
描述Similar to At2g01600: Putative clathrin assembly protein At2g01600
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g14910 推定的网格蛋白组装蛋白 At1g14910。 暂无已核实直接文献
At2g01600 推测的网格蛋白装配蛋白 At2g01600。 暂无已核实直接文献
At5g57200 假定的网格蛋白组装蛋白 At5g57200。 暂无已核实直接文献
At4g25940 假定的网格蛋白组装蛋白At4g25940。 暂无已核实直接文献
At5g35200 推定的网格蛋白组装相关蛋白At5g35200。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011369 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006900 vesicle budding from membrane 生物过程
GO:0048268 clathrin coat assembly 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005905 clathrin-coated pit 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0030136 clathrin-coated vesicle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14910
ath:AT2G01600
ath:AT4G25940
ath:AT5G35200
ath:AT5G57200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.458
排名 1 · TkA03G585000 · TK1151
细胞质0.451
排名 2 · TkA03G585000 · TK1151
细胞核0.197
排名 3 · TkA03G585000 · TK1151
高尔基体0.083
排名 4 · TkA03G585000 · TK1151
内质网0.052
排名 5 · TkA03G585000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07651ANTH31-310 aa
PF01417ENTH32-111 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G585000PF07651ANTH313103.6e-91305.7
TkA03G585000PF01417ENTH321110.00119.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P94017拟南芥sp|P94017|CAP9_ARATH Putative clathrin assembly protein At1g1491063.000%Swiss-Prot高置信
Q8LBH2拟南芥sp|Q8LBH2|CAP8_ARATH Putative clathrin assembly protein At2g0160063.700%Swiss-Prot高置信
Q9LVD8拟南芥sp|Q9LVD8|CAP7_ARATH Putative clathrin assembly protein At5g5720056.200%Swiss-Prot高置信
Q8VYT2拟南芥sp|Q8VYT2|CAP6_ARATH Putative clathrin assembly protein At4g2594056.000%Swiss-Prot高置信
Q9LHS0拟南芥sp|Q9LHS0|CAP10_ARATH Putative clathrin assembly protein At5g3520048.000%Swiss-Prot中等置信

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