TkA03G582000 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G582000

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 147755111-147757319 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1203 bp · TkA03G582000|TK1151|cDNA

ATGGGAGCTGAGAAGAAATGGCTTTTTACACTGTTCTTCGCCGCATTCATCTCCGTACTACTGTTTATCTCATCGATCTGCGGTTTTAGCTCTTCATACGCCTTCACTTCACACAAACCCTTCTCCACCGTCCACCGTGGGCGCGGCTACCCTCCGGCATTCGCTTACTACATTTCTGGCACCCGCGGTGATGCCGACAGGATTTTCCGCCTGCTGCTTGCGGTATATCATCCGAGGAACAGATATTTGTTGCACATTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1203 bp · TkA03G582000|TK1151|CDS

ATGGGAGCTGAGAAGAAATGGCTTTTTACACTGTTCTTCGCCGCATTCATCTCCGTACTACTGTTTATCTCATCGATCTGCGGTTTTAGCTCTTCATACGCCTTCACTTCACACAAACCCTTCTCCACCGTCCACCGTGGGCGCGGCTACCCTCCGGCATTCGCTTACTACATTTCTGGCACCCGCGGTGATGCCGACAGGATTTTCCGCCTGCTGCTTGCGGTATATCATCCGAGGAACAGATATTTGTTGCACATTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

400 aa · TkA03G582000|TK1151|PROTEIN

MGAEKKWLFTLFFAAFISVLLFISSICGFSSSYAFTSHKPFSTVHRGRGYPPAFAYYISGTRGDADRIFRLLLAVYHPRNRYLLHIGTEGSEDERRKLSVLVKSVPAIRAFGNVDVIGKPDPTTYMGASNIAAILRAAAIFLKVDRDWDWFITLSALDYPLLTQDDLSHAFSTISRDANFIDHTSELGWKEDQRIRPIVVDPGLYLARRTQIFRATEKRPLPNAFKVFTGSPWVILSRSFLEYCIFAWDNLPRTLLMYVN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G582000`
TK1151 ID	TkA03G582000
OH-1004 ID	LXL04_011321
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G582000

位置 Chr03:147755111-147757319 (+)

描述 Similar to GLCAT14A: Beta-glucuronosyltransferase GlcAT14A

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g39990`	β-葡萄糖醛酸基转移酶参与 II 型阿拉伯半乳聚糖的生物合成。	A β-glucuronosyltransferase from Arabidopsis thaliana involved in biosynthesis of type II arabinogalactan has a role in cell elongation during seedling growth.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12353
`At5g15050`	β-葡萄糖醛酸基转移酶参与 II 型阿拉伯半乳聚糖的生物合成。	Arabidopsis thaliana glucuronosyltransferase in family GT14.2014 · DOI: 10.4161/psb.28891
`At2g37585`	β-葡萄糖醛酸基转移酶参与 II 型阿拉伯半乳聚糖的生物合成。	Arabidopsis thaliana glucuronosyltransferase in family GT14.2014 · DOI: 10.4161/psb.28891

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011321 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006024 glycosaminoglycan biosynthetic process 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0015012 heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process 生物过程

GO:0030166 proteoglycan biosynthetic process 生物过程

GO:0034605 cellular response to heat 生物过程

GO:0050650 chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process 生物过程

GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分

GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分

GO:0005615 extracellular space 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0015020 glucuronosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G37585

ath:AT5G15050

ath:AT5G39990

cfa:494008

mmu:233781

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.742

排名 1 · TkA03G582000 · TK1151

细胞膜0.073

排名 2 · TkA03G582000 · TK1151

内质网0.057

排名 3 · TkA03G582000 · TK1151

细胞外0.041

排名 4 · TkA03G582000 · TK1151

细胞质0.033

排名 5 · TkA03G582000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02485Branch54-313 aa

PF24706DUF7669272-298 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G582000	`PF02485`	Branch	54	313	3.7e-65	220.7
TkA03G582000	`PF24706`	DUF7669	272	298	0.13	13.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FLD7`	拟南芥	sp\|Q9FLD7\|GT14A_ARATH Beta-glucuronosyltransferase GlcAT14A	43.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LFQ0`	拟南芥	sp\|Q9LFQ0\|GT14B_ARATH Beta-glucuronosyltransferase GlcAT14B	42.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8S8P3`	拟南芥	sp\|Q8S8P3\|GT14C_ARATH Beta-glucuronosyltransferase GlcAT14C	44.800%	Swiss-Prot	中等置信

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