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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G581910
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 147724766-147728441 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3108 bp · TkA03G581910|TK1151|cDNA

AAAATAGGCTTACAAACATCTCGTAATAAATCGTCGACTAATGACTAAACCGTGTCTCGAGTTTCCTTTGCTACCAAGAAAAATTATAGACAACTAGATCAGAGTTCATAACCAACACACAGTTGCAGCAATCTGTGTGAAATCAAGCATCCAATTGACTTGGTAATCAGCGTCCATCCTCCGATCTGTCATCGATTATGGCTGCTTCGGTGTCGTCATCGTCGTCGGCGACAAACATCATGCTTGCAATCTATGAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2652 bp · TkA03G581910|TK1151|CDS

ATGGCTGCTTCGGTGTCGTCATCGTCGTCGGCGACAAACATCATGCTTGCAATCTATGAGAAGAAAACCGTTGCGGTCGATCTTTATCGTCCTCTCCGCAACTACATAGTCTTCAATTACTCCGAGCGCGAGGCTCAAAACCTCGAAGACGATCTCGAAACCCTAAAGGAGATGCGCAACAGCATAGAACGTTCCTCAGCTGCCGACTCCCTCCCTGCGCGCCGAGATATTCTCCAGAACTACTTTAAAGCCCTAACCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

883 aa · TkA03G581910|TK1151|PROTEIN

MAASVSSSSSATNIMLAIYEKKTVAVDLYRPLRNYIVFNYSEREAQNLEDDLETLKEMRNSIERSSAADSLPARRDILQNYFKALTAVESRFPISADKDHVNSVTFTWHDAFKNKNKASQQNIHLEKAAILFNLGAVHSQIGLTFDRSTVEGRRQASHSFIAAAGAFAFLRDNAATKASIGSSTTVDISVECAGMLERLMLAQAQECVFENTIAKGSTPGVCSKISRQVGLYYEEALAALTVAPLTQHFDKTWLSHVQLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G581910
TK1151 IDTkA03G581910
OH-1004 IDLXL04_011317
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G581910
位置Chr03:147724766-147728441 (+)
描述Similar to BRO1: Vacuolar-sorting protein BRO1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15130 E类VPS蛋白，参与多泡体（MVB）货物蛋白的浓缩和分选，以便纳入囊泡腔内囊泡。
Arabidopsis ALIX is required for the endosomal localization of the deubiquitinating enzyme AMSH3.2015 · DOI: 10.1073/pnas.1510516112
ESCRT-III-Associated Protein ALIX Mediates High-Affinity Phosphate Transporter Trafficking to Maintain Phosphate Homeostasis in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00393

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011317 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0000915 actomyosin contractile ring assembly 生物过程
GO:0007033 vacuole organization 生物过程
GO:0009653 anatomical structure morphogenesis 生物过程
GO:0010824 regulation of centrosome duplication 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0016236 macroautophagy 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0036257 multivesicular body organization 生物过程
GO:0039702 viral budding via host ESCRT complex 生物过程
GO:0042318 penicillin biosynthetic process 生物过程
GO:0043328 protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ani:ANIA_04351
ath:AT1G15130
cnb:CNBG4510
ddi:DDB_G0275451
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.700
排名 1 · TkA03G581910 · TK1151
细胞膜0.182
排名 2 · TkA03G581910 · TK1151
高尔基体0.155
排名 3 · TkA03G581910 · TK1151
细胞核0.153
排名 4 · TkA03G581910 · TK1151
溶酶体／液泡0.078
排名 5 · TkA03G581910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03097BRO115-396 aa
PF13949ALIX_LYPXL_bnd28-87 aa
PF01706FliG_C32-61 aa
PF10146zf-C4H242-86 aa
PF08656DASH_Dad346-65 aa
PF26729TMA17_helical276-336 aa
PF08656DASH_Dad3276-322 aa
PF10146zf-C4H2277-321 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G581910PF03097BRO1153961.8e-106357.0
TkA03G581910PF13949ALIX_LYPXL_bnd28871.9e-74251.3
TkA03G581910PF01706FliG_C32610.2612.3
TkA03G581910PF10146zf-C4H242860.005118.1
TkA03G581910PF08656DASH_Dad346658.17.3
TkA03G581910PF26729TMA17_helical2763360.2312.6
TkA03G581910PF08656DASH_Dad32763228.17.3
TkA03G581910PF10146zf-C4H22773210.005118.1
TkA03G581910PF13949ALIX_LYPXL_bnd2813201.9e-74251.3
TkA03G581910PF01706FliG_C2883200.2612.3
TkA03G581910PF13949ALIX_LYPXL_bnd3633991.9e-74251.3
TkA03G581910PF01706FliG_C3784040.2612.3
TkA03G581910PF08656DASH_Dad33843988.17.3
TkA03G581910PF13949ALIX_LYPXL_bnd4327161.9e-74251.3
TkA03G581910PF08656DASH_Dad35065318.17.3
TkA03G581910PF26729TMA17_helical5095420.2312.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HXZ1拟南芥sp|F4HXZ1|BRO1_ARATH Vacuolar-sorting protein BRO177.100%Swiss-Prot高置信

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