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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G580790
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 147363596-147368858 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2216 bp · TkA03G580790|TK1151|cDNA

CAATTGTCTCATCACCATACTCCGCGTATATATGCACATTCCAGTACTCCACAGCCTTCCGCCGGTTCTCTCACACACAGTCGAACGATGCCGTCGCACCGGCGTTTCATTCTATCTATCTTACTCCTTCTTCTCCACATTTCCCCCCTCACCGCCACACCGCCATCCAGTAACCACCCAGACCTTGCCCCATTACTGTCGTTCAAATCATCCTCCGACGTCTCCAACAAGCTCGCCTCCTGGAACAACTCATCCGACCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1917 bp · TkA03G580790|TK1151|CDS

ATGCCGTCGCACCGGCGTTTCATTCTATCTATCTTACTCCTTCTTCTCCACATTTCCCCCCTCACCGCCACACCGCCATCCAGTAACCACCCAGACCTTGCCCCATTACTGTCGTTCAAATCATCCTCCGACGTCTCCAACAAGCTCGCCTCCTGGAACAACTCATCCGACCCATGTCACAGCTCCTCCAAATTCTACGGCGTCTCATGCCTCCATAACCGAGTTACCGGACTCGTCCTTGAAGGGCTTAATCTACATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

638 aa · TkA03G580790|TK1151|PROTEIN

MPSHRRFILSILLLLLHISPLTATPPSSNHPDLAPLLSFKSSSDVSNKLASWNNSSDPCHSSSKFYGVSCLHNRVTGLVLEGLNLHGRFDSLASLVKLRVLSLKRNRLVGPIPDLSNLTSMKLLFLSYNQISGELPPSLPSLFRLDLSHNKLEGSIPATLNRMTDLLTLRLEENQFSGSIEFLNFSNLQDFNISMNNVSGEIPASLAGFSYSVFLNNPALCGFPLLQCREPEIIAPDVASSPTSLPWTADVPGNKKPGNN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G580790
TK1151 IDTkA03G580790
OH-1004 IDLXL04_011288
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.659
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G580790
位置Chr03:147363596-147368858 (-)
描述Similar to At1g68400: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g68400
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68400 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g68400。 暂无已核实直接文献
At2g36570 富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶，参与木质部纤维次生细胞壁的形成。
The Arabidopsis LRR-RLK, PXC1, is a regulator of secondary wall formation correlated with the TDIF-PXY/TDR-WOX4 signaling pathway.2013 · DOI: 10.1186/1471-2229-13-94
At2g26730 可能失活的受体激酶 At2g26730。 暂无已核实直接文献
At5g58300 可能是非活性受体激酶 At5g58300。 暂无已核实直接文献
At4g23740 可能的非活性受体激酶 At4g23740。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011288 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009898 cytoplasmic side of plasma membrane 细胞组分
GO:0016328 lateral plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68400
ath:AT2G26730
ath:AT2G36570
ath:AT3G08680
ath:AT5G58300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.877
排名 1 · TkA03G580790 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkA03G580790 · TK1151
细胞质0.070
排名 3 · TkA03G580790 · TK1151
细胞核0.053
排名 4 · TkA03G580790 · TK1151
溶酶体／液泡0.021
排名 5 · TkA03G580790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_231-70 aa
PF12799LRR_483-117 aa
PF23598LRR_1488-196 aa
PF13855LRR_892-131 aa
PF00560LRR_197-115 aa
PF13516LRR_697-107 aa
PF24141LRR_ComC105-158 aa
PF13516LRR_6119-134 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G580790PF08263LRRNT_231702.2e-0731.8
TkA03G580790PF12799LRR_4831178.2e-0936.2
TkA03G580790PF23598LRR_14881960.0003620.1
TkA03G580790PF13855LRR_8921311.2e-0628.9
TkA03G580790PF00560LRR_1971151.8e-1039.5
TkA03G580790PF13516LRR_6971070.2512.2
TkA03G580790PF24141LRR_ComC1051580.09513.1
TkA03G580790PF13516LRR_61191340.2512.2
TkA03G580790PF12799LRR_41201528.2e-0936.2
TkA03G580790PF00560LRR_11221421.8e-1039.5
TkA03G580790PF13855LRR_81371761.2e-0628.9
TkA03G580790PF12799LRR_41401838.2e-0936.2
TkA03G580790PF00560LRR_11411621.8e-1039.5
TkA03G580790PF13516LRR_61411540.2512.2
TkA03G580790PF24141LRR_ComC1612240.09513.1
TkA03G580790PF13516LRR_61641770.2512.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M9C5拟南芥sp|Q9M9C5|Y1680_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g6840055.100%Swiss-Prot高置信
Q9SJQ1拟南芥sp|Q9SJQ1|PXC1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC143.300%Swiss-Prot中等置信
O48788拟南芥sp|O48788|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g2673044.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LVM0拟南芥sp|Q9LVM0|Y5830_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g5830046.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SUQ3拟南芥sp|Q9SUQ3|Y4374_ARATH Probable inactive receptor kinase At4g2374049.200%Swiss-Prot中等置信

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