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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G575530
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 145974663-145977412 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2013 bp · TkA03G575530|TK1151|cDNA

CACTCGCATACCCTTGATCACTCTATATAAAGAAACTTTGGATAACCAATTCAAGAACCACACTAAACAGAATGGAGGACATGAAGACCAAAGGCAGACGCCATCGTCAAAGAGTCAAAGGTGGTATCATCACCATGCCCTTCATCTTCGCAAATGATGTGAGTGAGAAGCTAGCCATGGTTGGATTCCAAACGAATATGATTAGCTACTTAACACAACAACTTCATATGCCCATGACTAAAGCCGCCAACACTCTCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1779 bp · TkA03G575530|TK1151|CDS

ATGGAGGACATGAAGACCAAAGGCAGACGCCATCGTCAAAGAGTCAAAGGTGGTATCATCACCATGCCCTTCATCTTCGCAAATGATGTGAGTGAGAAGCTAGCCATGGTTGGATTCCAAACGAATATGATTAGCTACTTAACACAACAACTTCATATGCCCATGACTAAAGCCGCCAACACTCTCACCAACTTTAACGGCACTTCAAGCTTAACTCCACTACTTGGAGCTTTCATGGCGGATTCTTTTGCCGGCCGGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

592 aa · TkA03G575530|TK1151|PROTEIN

MEDMKTKGRRHRQRVKGGIITMPFIFANDVSEKLAMVGFQTNMISYLTQQLHMPMTKAANTLTNFNGTSSLTPLLGAFMADSFAGRFWTITVASIIYLIGMISLTLSAALPKLKPPPCDQNHEICQEPNTGQLTILYISLLLTAIGSGGIRPCVVAFGADQFDERDEKQKTNMSKYFNWYYFCMGASMLLGVTVLVYVQDNVGWGWGLGIPSIVMGFAIVAFVVGYPLYRNMDPDGSPFTRLIQVCVAAYRKRKLSRVSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G575530
TK1151 IDTkA03G575530
OH-1004 IDLXL04_021382
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)74.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G575530
位置Chr03:145974663-145977412 (-)
描述Similar to NPF3.1: Protein NRT1/ PTR FAMILY 3.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68570 可能充当外排型亚硝酸盐转运蛋白。
A nitrite transporter associated with nitrite uptake by higher plant chloroplasts.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm073
At3g54140 肽转运蛋白。
AtPTR1, a plasma membrane peptide transporter expressed during seed germination and in vascular tissue of Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02224.x
AtPTR1 and AtPTR5 transport dipeptides in planta.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123844
At2g02040 肽转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g62200 蛋白质NRT1/PTR家族8.5。 暂无已核实直接文献
At5g01180 肽转运蛋白。
AtPTR1 and AtPTR5 transport dipeptides in planta.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123844

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021382 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006857 oligopeptide transport 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010336 gibberellic acid homeostasis 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0015833 peptide transport 生物过程
GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程
GO:0042938 dipeptide transport 生物过程
GO:0042939 tripeptide transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G62200
ath:AT1G68570
ath:AT2G02040
ath:AT3G54140
ath:AT5G01180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.836
排名 1 · TkA03G575530 · TK1151
细胞质0.090
排名 2 · TkA03G575530 · TK1151
内质网0.056
排名 3 · TkA03G575530 · TK1151
溶酶体／液泡0.041
排名 4 · TkA03G575530 · TK1151
线粒体0.032
排名 5 · TkA03G575530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06781CrgA34-57 aa
PF07690MFS_141-500 aa
PF22285DUF696256-103 aa
PF03825Nuc_H_symport74-111 aa
PF00854PTR287-516 aa
PF06781CrgA87-104 aa
PF29242DUF8525133-195 aa
PF06781CrgA164-221 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G575530PF06781CrgA34570.511.2
TkA03G575530PF07690MFS_1415001e-1661.5
TkA03G575530PF22285DUF6962561030.5610.9
TkA03G575530PF03825Nuc_H_symport741110.007916.0
TkA03G575530PF00854PTR2875162.7e-99333.4
TkA03G575530PF06781CrgA871040.511.2
TkA03G575530PF29242DUF85251331950.6411.1
TkA03G575530PF06781CrgA1642210.511.2
TkA03G575530PF22285DUF69621672120.5610.9
TkA03G575530PF11470TUG-UBL12382760.04614.6
TkA03G575530PF22285DUF69623323520.5610.9
TkA03G575530PF03825Nuc_H_symport4485230.007916.0
TkA03G575530PF07690MFS_14515501e-1661.5
TkA03G575530PF22285DUF69624615080.5610.9
TkA03G575530PF29242DUF85254895540.6411.1
TkA03G575530PF03825Nuc_H_symport5415690.007916.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SX20拟南芥sp|Q9SX20|PTR18_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 3.170.700%Swiss-Prot高置信
Q9M390拟南芥sp|Q9M390|PTR1_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.144.700%Swiss-Prot中等置信
P46032拟南芥sp|P46032|PTR2_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.344.300%Swiss-Prot中等置信
Q93Z20拟南芥sp|Q93Z20|PTR17_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.544.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LFB8拟南芥sp|Q9LFB8|PTR5_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.243.200%Swiss-Prot中等置信

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