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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G564050
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 143127948-143133547 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2342 bp · TkA03G564050|TK1151|cDNA

AAAATATGTGATTTCTTTTTTTCACGCCAAATCACAGGAACCCAAACAGCTAAACACACGCACAATTTTAGAGAGAGAAAACTTTGAAAAATCTGACAGTGAGAAGATGCAGATTTAAATGGAGGCCAGTAGTCTAGAGTGACAAAACTTCAAACCATTTTCCCCCAGGATAAAGGATTTGATTTGGAGCTGATTGATGCTTGATTGAGTTCAGATCCGAGTGATGGAGGAAGTATCCGCGGAAGGTGATGTGATTGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1869 bp · TkA03G564050|TK1151|CDS

ATGGAGGAAGTATCCGCGGAAGGTGATGTGATTGGAATGACAGACACGCCGGAGGTATTGTACCGGGGAGAGTATAACGGCGGCAATGTACGGCCTCCGACCGGTGATACGACGCCGCTGACGGTGTCGGGATCTTTTAAGGACGGGGGAGGAGGAGGGAGAAGCTCGGGTACTGGTACTCGTAGGAGGGGTACGGGGAGGAGGCCGAGCTTAGACGCTGATGAGTTTATAAATTTGCTCCACGGTTCGGATCCGGTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

622 aa · TkA03G564050|TK1151|PROTEIN

MEEVSAEGDVIGMTDTPEVLYRGEYNGGNVRPPTGDTTPLTVSGSFKDGGGGGRSSGTGTRRRGTGRRPSLDADEFINLLHGSDPVKVELNRLENEVRDKDRELSESQAEIKALRLSERLREKAVEELTEELSKVDEKLKLTESLLESKNLEIKKINDEKKASMAAQFAAEATLRRVHAAQKDDDMPPIEAILAPLEAELKLARQEIAKLQDDNKALDRLTKSKEAALLEAEKTVQVALAKASMVDDLQNKNQELMKQIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G564050
TK1151 IDTkA03G564050
OH-1004 IDLXL04_000198
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 82.958 / OH-1004 88.182
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G564050
位置Chr03:143127948-143133547 (+)
描述Similar to MAP70.2: Microtubule-associated protein 70-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g24764 与微管相互作用的植物特异性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g68060 与微管相互作用的植物特异性蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g01750 与微管相互作用的植物特异性蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0736100 与微管相互作用的植物特异性蛋白。 暂无已核实直接文献
Os12g0640900 与微管相互作用的植物特异性蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000198 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0010005 cortical microtubule, transverse to long axis 细胞组分
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14840
ath:AT1G24764
ath:AT1G68060
ath:AT2G01750
dosa:Os02g0736100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.688
排名 1 · TkA03G564050 · TK1151
细胞核0.257
排名 2 · TkA03G564050 · TK1151
细胞膜0.127
排名 3 · TkA03G564050 · TK1151
高尔基体0.076
排名 4 · TkA03G564050 · TK1151
线粒体0.047
排名 5 · TkA03G564050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07058MAP7074-606 aa
PF15619Lebercilin89-176 aa
PF13747DUF416498-116 aa
PF30757CCDC125121-146 aa
PF30821TANGO1_helical122-149 aa
PF30757CCDC125124-154 aa
PF15619Lebercilin143-236 aa
PF30821TANGO1_helical168-272 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G564050PF07058MAP70746061.5e-276919.3
TkA03G564050PF15619Lebercilin891760.001718.7
TkA03G564050PF13747DUF4164981160.0009320.3
TkA03G564050PF30757CCDC1251211460.00916.8
TkA03G564050PF30821TANGO1_helical1221495.2e-0524.1
TkA03G564050PF30757CCDC1251241540.00916.8
TkA03G564050PF15619Lebercilin1432360.001718.7
TkA03G564050PF30821TANGO1_helical1682725.2e-0524.1
TkA03G564050PF30757CCDC1251962630.00916.8
TkA03G564050PF15619Lebercilin2363830.001718.7
TkA03G564050PF13747DUF41642482810.0009320.3
TkA03G564050PF13747DUF41642803380.0009320.3
TkA03G564050PF30757CCDC1253083270.00916.8
TkA03G564050PF30821TANGO1_helical3183695.2e-0524.1
TkA03G564050PF30757CCDC1253553750.00916.8
TkA03G564050PF15619Lebercilin5375830.001718.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7S4拟南芥sp|Q8L7S4|MP702_ARATH Microtubule-associated protein 70-270.400%Swiss-Prot高置信
Q9C9X0拟南芥sp|Q9C9X0|MP701_ARATH Microtubule-associated protein 70-171.800%Swiss-Prot高置信
Q9ZUA3拟南芥sp|Q9ZUA3|MP703_ARATH Microtubule-associated protein 70-370.000%Swiss-Prot高置信
Q6Z746水稻sp|Q6Z746|MP702_ORYSJ Microtubule-associated protein 70-271.700%Swiss-Prot高置信
Q2QLI6水稻sp|Q2QLI6|MP701_ORYSJ Microtubule-associated protein 70-168.900%Swiss-Prot高置信

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