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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G556470
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 140884511-140886697 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1712 bp · TkA03G556470|TK1151|cDNA

GTCAGGCTCTAGTCGTTGACTATGGGTGTTTGACCACGTCCATGGTACTCAATCTAAAAACTCATATGTCAAAAAGACTTCTTCAGAACCCCCAATTGCTCCCGCTATCAAATTGTTTCCGAGAATTGCCTACGAATTCGCTGAATAGGCGAATCTGTACTGATCTGGACTATGCAACGACGATTCTGACATCGAATTTCAGATCCATCTAATTTCCTACACGAGTTTGGCAGTGAACGAGTCCAATAGATGAAATCACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1317 bp · TkA03G556470|TK1151|CDS

ATGAGCAGTACACGAATTCCAACACGCTACGTGATCGTCATACTAACCTTCATATGCACCTGCGTATGCTACATAGAACGCGTAGGCTTTTCAATCGCATACACAGTCGCAGCAGATGCAGAAGGCGTAAGCCAATCAAGCAAAGGCACAATCCTCTCAACATTCTACTACGGCTACGCATTATCACAAGTCCCCGGCGGTTGGGCCGCTCAAAAAATCGGCGGTAGGCGTGTCCTTCTTCTCTCATTCATCCTATGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

438 aa · TkA03G556470|TK1151|PROTEIN

MSSTRIPTRYVIVILTFICTCVCYIERVGFSIAYTVAADAEGVSQSSKGTILSTFYYGYALSQVPGGWAAQKIGGRRVLLLSFILWSLTSALVPLDPNRVITLIIARLLVGIAQGFIFPSIHTVLAQWVPPHERSRSVSLTTSGMYLGAAMGMLLLPTLVKFKGPQSVFLAEACLGGMWSILWFKFASDPPRSNHPKAAASGFGESLLPVKDNQRTKNEKVTQIQIPWRKIFLSLPVWAIVVNNFTFHYALYVLMNWLPT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G556470
TK1151 IDTkA03G556470
OH-1004 IDLXL04_003344
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.607 / OH-1004 24.446
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G556470
位置Chr03:140884511-140886697 (-)
描述Similar to ANTR5: Probable anion transporter 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g00370 无机磷酸盐和可能的阴离子转运蛋白。
AtPHT4;4 is a chloroplast-localized ascorbate transporter in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1038/ncomms6928

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0186800 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os12g0180100 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os09g0570400 可能的阴离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003344 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0000118 histone deacetylase complex 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0048188 Set1C/COMPASS complex 细胞组分
GO:0003712 transcription coregulator activity 分子功能
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11950
ath:AT5G44370
dosa:Os11g0186800
dosa:Os12g0180100
osa:4349969
osa:4351670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.278
排名 1 · TkA03G556470 · TK1151
高尔基体0.195
排名 2 · TkA03G556470 · TK1151
内质网0.188
排名 3 · TkA03G556470 · TK1151
细胞质0.159
排名 4 · TkA03G556470 · TK1151
细胞膜0.122
排名 5 · TkA03G556470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30271SINE3_TM8-19 aa
PF07690MFS_117-385 aa
PF11137DUF290927-33 aa
PF00083Sugar_tr41-234 aa
PF05977MFS_365-186 aa
PF30271SINE3_TM77-93 aa
PF11137DUF290978-95 aa
PF03137OATP100-155 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G556470PF30271SINE3_TM8190.2412.2
TkA03G556470PF07690MFS_1173852.8e-53181.8
TkA03G556470PF11137DUF290927332.78.7
TkA03G556470PF00083Sugar_tr412345.8e-0522.9
TkA03G556470PF05977MFS_3651860.0001720.9
TkA03G556470PF30271SINE3_TM77930.2412.2
TkA03G556470PF11137DUF290978952.78.7
TkA03G556470PF03137OATP1001550.2510.3
TkA03G556470PF11137DUF29091031172.78.7
TkA03G556470PF03137OATP1693230.2510.3
TkA03G556470PF30271SINE3_TM2292410.2412.2
TkA03G556470PF05977MFS_32823280.0001720.9
TkA03G556470PF03137OATP3644310.2510.3
TkA03G556470PF07690MFS_14064302.8e-53181.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKV1拟南芥sp|Q9FKV1|ANTR5_ARATH Probable anion transporter 576.900%Swiss-Prot高置信
Q8GX78拟南芥sp|Q8GX78|ANTR2_ARATH Ascorbate transporter, chloroplastic35.500%Swiss-Prot中等置信
Q53P54水稻sp|Q53P54|PHT46_ORYSJ Probable anion transporter 670.700%Swiss-Prot高置信
Q2QWW7水稻sp|Q2QWW7|PHT47_ORYSJ Probable anion transporter 768.800%Swiss-Prot高置信
Q652N5水稻sp|Q652N5|PHT44_ORYSJ Probable anion transporter 4, chloroplastic35.900%Swiss-Prot中等置信

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