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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G551630
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 139683772-139687330 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2630 bp · TkA03G551630|TK1151|cDNA

AACCATGCAAAAGAACCGACGGCGTCGTATCAGTCGTCTTCTTCTTTATCCTATTCATAAATTCACCCCATTAATAAGGACTGTACATCGCCTTTTCTCCCCCAAATTTATTTTTAAACAATTATTTCTAAAATTCTAATTTTGCCCTAAACCTTTAAACCTCAAAAAATTCTCACCAAAAAAACCCCAAATCCATATATCATGGCCTTTCATGTACGATGCCCAATTACAAGGTAACTTCCCTCTTTCTCTCTACCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2130 bp · TkA03G551630|TK1151|CDS

ATGCCCAATTACAAGGTAACTTCCCTCTTTCTCTCTACCTTCTACGTATCTTATTTTCTCACTCTAATTGCCTCTCTTTCCTTCGATTGCAGCCGACGAATCTGTAACTGTAAGTTGGGGTTTCCATCGGAGCTACGGAGCGAAAAGGGTCAGCTTGAGTTCTTGGAGGCAGCGGCTAGGGTTGAGGAGATTTTTAGGAATCCGTCGTTGATTTATGGCAAACCGAAGTCGGTTCAGGTTCTTGTACCGAAGGTAGTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

709 aa · TkA03G551630|TK1151|PROTEIN

MPNYKVTSLFLSTFYVSYFLTLIASLSFDCSRRICNCKLGFPSELRSEKGQLEFLEAAARVEEIFRNPSLIYGKPKSVQVLVPKVVVAPPPLPPPPIQAIVTPNASAILDGGGDAAEELLSAQTKRVAMQKKAAAASLAAEDYARRFESGDMVEGITKDLAADEQGLLNAKVMCRLCFSGENEESERAKKMLSCKNCNKKYHRTCVKSWAQNRDLFHWSSWTCPSCRTCEVCRRTGDPNKLMYCKRCDGAYHCYCQQPPH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G551630
TK1151 IDTkA03G551630
OH-1004 IDLXL04_010848
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.628 / OH-1004 94.583
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G551630
位置Chr03:139683772-139687330 (-)
描述Similar to KMT2B: Histone-lysine N-methyltransferase 2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
GO:0033148 positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway 生物过程
GO:0035864 response to potassium ion 生物过程
GO:0043627 response to estrogen 生物过程
GO:0045815 transcription initiation-coupled chromatin remodeling 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
hsa:4297
hsa:9757
mmu:75410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA03G551630 · TK1151
细胞质0.071
排名 2 · TkA03G551630 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA03G551630 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA03G551630 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA03G551630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16866PHD_4171-226 aa
PF00628PHD174-226 aa
PF23004PHDvar_NSD174-208 aa
PF22908PHD_NSD174-224 aa
PF16866PHD_4228-279 aa
PF22908PHD_NSD228-273 aa
PF00628PHD229-272 aa
PF23004PHDvar_NSD229-274 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G551630PF16866PHD_41712260.0001922.1
TkA03G551630PF00628PHD1742268.9e-1555.2
TkA03G551630PF23004PHDvar_NSD1742089.1e-0626.3
TkA03G551630PF22908PHD_NSD1742240.002418.8
TkA03G551630PF16866PHD_42282790.0001922.1
TkA03G551630PF22908PHD_NSD2282730.002418.8
TkA03G551630PF00628PHD2292728.9e-1555.2
TkA03G551630PF23004PHDvar_NSD2292749.1e-0626.3
TkA03G551630PF00628PHD2983058.9e-1555.2
TkA03G551630PF22908PHD_NSD3113410.002418.8
TkA03G551630PF00628PHD3123658.9e-1555.2
TkA03G551630PF16866PHD_43183650.0001922.1
TkA03G551630PF23004PHDvar_NSD3223419.1e-0626.3
TkA03G551630PF23004PHDvar_NSD3563659.1e-0626.3
TkA03G551630PF23327Chromo_MORC2_6th6506790.01515.7
TkA03G551630PF22987Tudor_KDM3B6536930.02515.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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