RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G551470
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 139626923-139630235 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1848 bp · TkA03G551470|TK1151|cDNA

AGTTCATATCCCATGGCTGATGCCTCTCTCTTCAATTCTATATCCAAACCGTTTGCGTCCTCTTCTTTTGTATCTTCGTTACCCAACTGCAAAGCTCAGAAACTACTGATCATCACATCGCCGGCAAATCGGAACTTGTTAGGGGAGAGAAAGGCATTGTTGTTGAATAGCGAGAATGAGTAGTAGTGGTGGTGGAAAGGGAAGGACACGAGTAGGGAATTATGAGATTGGGAAGACTCTGGGTGAAGGCAGTTTCGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA03G551470|TK1151|CDS

ATGGAAGACTTAAAGAAGATGAAGCTCGAAGATACTTTCAGCAAACTTATAAACGCTGTAGATTACTGCCATAGTAGAGGCGTATATCACAGAGACCTCAAGCCTGAAAATCTACTCTTGGACTCATACGGAGTTCTAAAAGTTTCAGACTTTGGATTATCTCAACAAGTGGAAAATGGTATGCTGCATACAGCATGTGGGACTCCAAACTATGTTGCTCCTGAGGTGCTCACTGTAAAGGGTTATAATGGTGCAGCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

340 aa · TkA03G551470|TK1151|PROTEIN

MEDLKKMKLEDTFSKLINAVDYCHSRGVYHRDLKPENLLLDSYGVLKVSDFGLSQQVENGMLHTACGTPNYVAPEVLTVKGYNGAASDIWSCGVILFVLMAGYLPFDEANLIELYRRIEKADYRCPPWFSSGVKKLLSQILNPNPKTRITISEILENDWFKKGYKPPHFEQEEDVNVDDVDAVFNESKEHLVTEKKEKPESMNAFELISRSHSFSLENMFEKQKGLVKKETSFASKCPANEIMSKIEEAAKPLGFNVHKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G551470
TK1151 IDTkA03G551470
OH-1004 IDLXL04_031095
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)52.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.882 / OH-1004 70.312
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G551470
位置Chr03:139626923-139630235 (+)
描述Similar to CIPK8: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01140 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
A protein kinase, calcineurin B-like protein-interacting protein Kinase9, interacts with calcium sensor calcineurin B-like Protein3 and regulates potassium homeostasis under low-potassium stress in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.206896
At1g30270 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
A Ca(2)+ signaling pathway regulates a K(+) channel for low-K response in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0605129103
A protein phosphorylation/dephosphorylation network regulates a plant potassium channel.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707912104
Two calcineurin B-like calcium sensors, interacting with protein kinase CIPK23, regulate leaf transpiration and root potassium uptake in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03236.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0126800 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0150700 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os12g0132200 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031095 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24400
ath:AT5G35410
dosa:Os01g0536000
dosa:Os06g0606000
dosa:Os07g0150700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.495
排名 1 · TkA03G551470 · TK1151
细胞核0.381
排名 2 · TkA03G551470 · TK1151
细胞膜0.182
排名 3 · TkA03G551470 · TK1151
内质网0.070
排名 4 · TkA03G551470 · TK1151
溶酶体／液泡0.050
排名 5 · TkA03G551470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase6-160 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr8-156 aa
PF14531Kinase-like15-148 aa
PF07387Seadorna_VP722-52 aa
PF14531Kinase-like188-211 aa
PF03822NAF199-259 aa
PF07387Seadorna_VP7205-241 aa
PF26983DUF8312233-266 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G551470PF00069Pkinase61601.2e-45156.7
TkA03G551470PF07714PK_Tyr_Ser-Thr81564.2e-2176.2
TkA03G551470PF14531Kinase-like151483.6e-0627.2
TkA03G551470PF07387Seadorna_VP722520.2311.2
TkA03G551470PF14531Kinase-like1882113.6e-0627.2
TkA03G551470PF03822NAF1992592.2e-2176.5
TkA03G551470PF07387Seadorna_VP72052410.2311.2
TkA03G551470PF26983DUF83122332660.2612.0
TkA03G551470PF02149KA12893170.09713.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MAM1拟南芥sp|Q9MAM1|CIPK9_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 972.200%Swiss-Prot高置信
Q93VD3拟南芥sp|Q93VD3|CIPKN_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2366.500%Swiss-Prot高置信
Q10SC8水稻sp|Q10SC8|CIPK9_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 975.200%Swiss-Prot高置信
Q6ZLP5水稻sp|Q6ZLP5|CIPKN_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 2365.900%Swiss-Prot高置信
Q2QY53水稻sp|Q2QY53|CIPKW_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 3266.500%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看