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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G549680
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 139102976-139113720 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5319 bp · TkA03G549680|TK1151|cDNA

ACTCACTTGTTATGACAGTCTTTTTATTAATAGTGAAATAAGAGCAGCCTCTCATTGTACCTGCAATAATTAATTGCTTCTGGATTTTAAGACCACATTTACGATACTGCTCCTTCCTCTCCCCTATTGTTCCTTGGCCGACATTATTTGTGCTACACTTTGTAGTACATTACGTAGTGGACTTGGTACCTTAGAGAGTAGGTACGTAAGTCTTAAGCACCACTTGTCCAAATGATCAAATCCAATTAAAATCTTAATAG...

CDS

下载 CDS FASTA

5277 bp · TkA03G549680|TK1151|CDS

ATGGAGATTATATCAGCTATCATGGGTCCAATTGTTGAAAGTGTATTGGTTCCTGTCAAGAGACATGTGAGTTATCTGTTTTCCTCCACAAAACATGTTAGGAAAATGGATACTCGAATAAAGCAACTGGATGGTACAAGCATTGATGCCAAAAAGAAAAAGGAGACGAACATCACCGCCAATCTCGAAATTCCAACTCGTGTACCGGATTGGTTGGAAGAAGTTGAAGATGTTAAGAAACGTGCTCATGGCATTTCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1758 aa · TkA03G549680|TK1151|PROTEIN

MEIISAIMGPIVESVLVPVKRHVSYLFSSTKHVRKMDTRIKQLDGTSIDAKKKKETNITANLEIPTRVPDWLEEVEDVKKRAHGISSTGCGCFNMKMRYRAGRNAFKITKEIVILDEEYSKIIWNDTPRPLGKVNSMTASTSARLDGDSQNDFRSREKSFNDALSFLQQNHTSQVIGLCGMGGVGKTTMMEQLKKATIEKKTFDYVVKVVIGQQINMFSVQQAVAEYMGQPLNETSKTARADRLRITFEKLPEGRRKVLV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G549680
TK1151 IDTkA03G549680
OH-1004 IDLXL04_010800
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.886 / OH-1004 99.717
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G549680
位置Chr03:139102976-139113720 (+)
描述Similar to At4g27190: Disease resistance protein At4g27190
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27190 抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g27220 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g15890 可能的疾病抗性蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g63350 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g05400 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010800 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63350
ath:AT4G26090
ath:AT4G27190
ath:AT4G27220
ath:AT5G05400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.606
排名 1 · TkA03G549680 · TK1151
细胞质0.263
排名 2 · TkA03G549680 · TK1151
细胞核0.203
排名 3 · TkA03G549680 · TK1151
内质网0.083
排名 4 · TkA03G549680 · TK1151
细胞外0.048
排名 5 · TkA03G549680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01637ATPase_2153-272 aa
PF00931NB-ARC157-322 aa
PF20720nSTAND3157-201 aa
PF25201nSTAND6157-231 aa
PF13191AAA_16161-205 aa
PF03193RsgA_GTPase162-196 aa
PF03308MeaB168-199 aa
PF13401AAA_22172-264 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G549680PF01637ATPase_21532720.0008220.0
TkA03G549680PF00931NB-ARC1573223.3e-2692.6
TkA03G549680PF20720nSTAND31572010.01216.1
TkA03G549680PF25201nSTAND61572310.1912.5
TkA03G549680PF13191AAA_161612050.2512.6
TkA03G549680PF03193RsgA_GTPase1621960.08313.4
TkA03G549680PF03308MeaB1681990.1611.7
TkA03G549680PF13401AAA_221722640.0315.4
TkA03G549680PF13604AAA_301732390.01415.8
TkA03G549680PF13173AAA_141742060.2212.3
TkA03G549680PF13238AAA_181762710.001319.9
TkA03G549680PF05729NACHT1762690.00218.7
TkA03G549680PF01637ATPase_23654060.0008220.0
TkA03G549680PF20720nSTAND33674050.01216.1
TkA03G549680PF13191AAA_164304910.2512.6
TkA03G549680PF23247LRR_RPS25706769.1e-104345.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T048拟南芥sp|Q9T048|DRL27_ARATH Disease resistance protein At4g2719022.600%Swiss-Prot低置信
O81825拟南芥sp|O81825|DRL28_ARATH Probable disease resistance protein At4g2722025.500%Swiss-Prot低置信
Q9LMP6拟南芥sp|Q9LMP6|DRL3_ARATH Probable disease resistance protein At1g1589023.000%Swiss-Prot低置信
Q9C8T9拟南芥sp|Q9C8T9|DRL19_ARATH Putative disease resistance protein At1g6335025.600%Swiss-Prot低置信
Q9FLB4拟南芥sp|Q9FLB4|DRL31_ARATH Putative disease resistance protein At5g0540022.300%Swiss-Prot低置信

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