基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA03G536200
当前版本: TK1151
染色体: Chr03
坐标: 134948048-134950596
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1824 bp · TkA03G536200|TK1151|cDNA
TTGTTTACCAGCTGTGAAAACTTAGCACAAAAGCAAATACTTTGTGAAGGTTTCTGCTTCTCTACTCAATCGATTTCCCCGATCAAAATTCCAACACCGGAGCAAAGAATGGTGCCCCCGCCGCCTTCTCCGACGTCTTCGATGGCTCAGTATACTCAACAATTTCTCAGCTCTGTCCTCTCCCAGCGTGGCCCATCTTCCCTTCCATACTCAGAAGACGTTAAATGGCTAATCCGTCAACACCTCCTCTCGCTCTCCGA...
CDS
下载 CDS FASTA1377 bp · TkA03G536200|TK1151|CDS
TTGTTTACCAGCTGTGAAAACTTAGCACAAAAGCAAATACTTTGTGAAGGTTTCTGCTTCTCTACTCAATCGATTTCCCCGATCAAAATTCCAACACCGGAGCAAAGAATGGTGCCCCCGCCGCCTTCTCCGACGTCTTCGATGGCTCAGTATACTCAACAATTTCTCAGCTCTGTCCTCTCCCAGCGTGGCCCATCTTCCCTTCCATACTCAGAAGACGTTAAATGGCTAATCCGTCAACACCTCCTCTCGCTCTCCGA...
458 aa · TkA03G536200|TK1151|PROTEIN
LFTSCENLAQKQILCEGFCFSTQSISPIKIPTPEQRMVPPPPSPTSSMAQYTQQFLSSVLSQRGPSSLPYSEDVKWLIRQHLLSLSDAYPSLQPKTATFTHNDGRSINLLQSDGTVPMVFQNVTYNIPVVIWLMETYPRHPPLVFVNPTRDMVIKRQHPFVNPSGSVSIPYLQNWVYPSSNLVDLARNLGNYFGSDPPLYSQRRPNPNPNPNPNPNPNPSPSFNASGSSGSVSSGSIRPAIPPRTYPPSPYVSSSGRIPS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA03G536200 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA03G536200 |
| OH-1004 ID | LXL04_036927 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 28.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 79.913 / OH-1004 89.521覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA03G536200 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:134948048-134950596 (-) |
| 描述 | Similar to ELCL: Protein ELC-like |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006858 extracellular transport 生物过程 GO:0007175 negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity 生物过程 GO:0008333 endosome to lysosome transport 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0010091 trichome branching 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0016236 macroautophagy 生物过程 GO:0019076 viral release from host cell 生物过程 GO:0036258 multivesicular body assembly 生物过程 GO:0039702 viral budding via host ESCRT complex 生物过程 GO:0042059 negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway 生物过程 GO:0043162 ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G12400 ath:AT5G13860 ddi:DDB_G0286797 hsa:7251 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.670
细胞核0.345
溶酶体／液泡0.126
细胞膜0.105
高尔基体0.099
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF26095CC_Bre149-74 aaPF05743UEV73-201 aaPF00179UQ_con119-175 aaPF26095CC_Bre1280-343 aaPF30378CEP135_TSGA10_CC281-344 aaPF27603AKAP9_C287-362 aaPF10473CENP-F_leu_zip297-343 aaPF04822Takusan317-345 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA03G536200 | PF26095 | CC_Bre1 | 49 | 74 | 0.82 | 10.7 |
| TkA03G536200 | PF05743 | UEV | 73 | 201 | 7.7e-43 | 146.2 |
| TkA03G536200 | PF00179 | UQ_con | 119 | 175 | 0.058 | 13.7 |
| TkA03G536200 | PF26095 | CC_Bre1 | 280 | 343 | 0.82 | 10.7 |
| TkA03G536200 | PF30378 | CEP135_TSGA10_CC | 281 | 344 | 0.061 | 12.3 |
| TkA03G536200 | PF27603 | AKAP9_C | 287 | 362 | 0.073 | 11.1 |
| TkA03G536200 | PF10473 | CENP-F_leu_zip | 297 | 343 | 0.15 | 12.8 |
| TkA03G536200 | PF04822 | Takusan | 317 | 345 | 0.18 | 12.4 |
| TkA03G536200 | PF09454 | Vps23_core | 373 | 433 | 7.3e-25 | 87.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。