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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G526670
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 132199880-132203634 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2104 bp · TkA03G526670|TK1151|cDNA

CGGAACTCAAACCCAACAATTAACCAAAAACAAGCAATTCCCATATAGATCTCGTTCAAGTCCGCGCCTCCTCCTCCCCGTCGCCCCCTTTTGTCATCACTCTCTTCTAAACTCCAAATCAAACCCTAATTCCCCCTCAATCATTGCCTTCAAACCTTCAATCGATTCGTTACTTCCACCCACAACGCCAATTCAACCCTACGGAGGCGAACCGGCCGTCAAATTGAGTTGTGTTTTTGAACGATTCGCGTTTCTTCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1338 bp · TkA03G526670|TK1151|CDS

ATGGACTACGAACCTTACGATAGCAGCGGAACTGATGATGATCTTCCGCCATCTCATCAAAACAGAATCCCAAGAGGTGGACGTGTTGCAGGTAATGGAAGATCTGCAGTTATGGCTCCTGTAGTACAATATCCAAGAATGTATGCAGAAACAGACATGGAAGCCCAAATCCACCTCCTTGAACAAGAAGCATACAGCTCTGTTCTTCGAGCCTTCAAAGCCCAAGCTGATGCAATTACTTGGGAAAAAGAAGGTTTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

445 aa · TkA03G526670|TK1151|PROTEIN

MDYEPYDSSGTDDDLPPSHQNRIPRGGRVAGNGRSAVMAPVVQYPRMYAETDMEAQIHLLEQEAYSSVLRAFKAQADAITWEKEGLITELRKELRLSNEEHRELLGKVNSDDVIRRIREWRQSGGVQSGMMNTGQAVHDPLPSPSVSASRKKQKINSSGPSQSFGVPSPSFHPQPVVPPPNQPSSSSARRAPVSGSTKGKNKKSGGQMMGGGGGSALKMQYPPSGPSGRGQIGNRVSAGPLANESAETSAFSPLIGRKVR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G526670
TK1151 IDTkA03G526670
OH-1004 IDLXL04_010418
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G526670
位置Chr03:132199880-132203634 (+)
描述Similar to EML3: Protein EMSY-LIKE 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13020 可能参与染色质状态的调控（可能）。 暂无已核实直接文献
At2g44440 可能参与染色质状态的调控（可能）。
EMSY-like genes are required for full RPP7-mediated race-specific immunity and basal defense in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1094/mpmi-05-11-0123
At3g12140 可能参与染色质状态的调控（可能）。
EMSY-like genes are required for full RPP7-mediated race-specific immunity and basal defense in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1094/mpmi-05-11-0123
At5g06780 可能参与染色质状态的调控（可能）。
EMSY-like genes are required for full RPP7-mediated race-specific immunity and basal defense in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1094/mpmi-05-11-0123

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010418 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
GO:0031491 nucleosome binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G44440
ath:AT3G12140
ath:AT5G06780
ath:AT5G13020
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.970
排名 1 · TkA03G526670 · TK1151
细胞质0.115
排名 2 · TkA03G526670 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA03G526670 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA03G526670 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA03G526670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25557GAUT_110-23 aa
PF29569DCT6_helical47-122 aa
PF03735ENT52-131 aa
PF14772NYD-SP2870-107 aa
PF25557GAUT_188-113 aa
PF18521TAD2135-144 aa
PF09465LBR_tudor204-217 aa
PF09465LBR_tudor255-293 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G526670PF25557GAUT_110230.2412.4
TkA03G526670PF29569DCT6_helical471220.2511.9
TkA03G526670PF03735ENT521316e-31107.0
TkA03G526670PF14772NYD-SP28701070.09313.5
TkA03G526670PF25557GAUT_1881130.2412.4
TkA03G526670PF18521TAD21351446.37.3
TkA03G526670PF09465LBR_tudor2042170.1812.3
TkA03G526670PF09465LBR_tudor2552930.1812.3
TkA03G526670PF18521TAD23063186.37.3
TkA03G526670PF29569DCT6_helical3814100.2511.9
TkA03G526670PF25557GAUT_13844180.2412.4
TkA03G526670PF02970TBCA3934240.05714.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4K2F0拟南芥sp|F4K2F0|EML3_ARATH Protein EMSY-LIKE 354.100%Swiss-Prot高置信
Q08A72拟南芥sp|Q08A72|EML4_ARATH Protein EMSY-LIKE 454.500%Swiss-Prot高置信
Q9C7C4拟南芥sp|Q9C7C4|EML1_ARATH Protein EMSY-LIKE 146.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FG29拟南芥sp|Q9FG29|EML2_ARATH Protein EMSY-LIKE 244.600%Swiss-Prot中等置信

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