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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G519820
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 130419134-130422156 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1625 bp · TkA03G519820|TK1151|cDNA

CGGGTTTTGACTTGCTATTGGTGGGTGTCGATAATTGCTTGGGTCTATGTATCAGCATCTTTATTTGGCTTCTCCATTATAAAACTGGACGAAAAGAAGCTCTCTCCTTCACCTCCAACTTTCCCTCTTCAAATCTATCTGTACTACTTTTGTCTATTTCCTGCTTTCCCAAATCACATCTCCCAATCTTTTCAGATTCTTGAATCCACCTCCGTATATTCATCATCAACACATCGAAATGCTTGGATTCAAGACCTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

735 bp · TkA03G519820|TK1151|CDS

ATGGATTATTATACCTGTAATCAGATATTTGCCAACTTGGAATCCATTGTGGACGATAGATTTTTGGGGAACTTCGGTGGGGATTGCGGGTCGTTCTCGAAATCTTCTCAATCGTTGGTGTTAGATGAAGGAAAAGGCGAGCTTGTGAAGGCTAATCCGAAAGTTATCGGGAAGAAAATCGGATTGATTTCTGATGAGAAATCTTTGGCTGCTTTGAAGAGTCACAGTGATGCTGAGAGAAGAAGAAGGGAGAGGATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

244 aa · TkA03G519820|TK1151|PROTEIN

MDYYTCNQIFANLESIVDDRFLGNFGGDCGSFSKSSQSLVLDEGKGELVKANPKVIGKKIGLISDEKSLAALKSHSDAERRRRERINAHLDTLRSLVPSNDKMDKATLLAEVIRQLKQLKTNATQASIGLIIPEDTDGLKIEKRNNGGLAFRATFCCKNRPELLIDVRRSIAALKVKIERTELSILGDHVKLVFDFAKTSAGTTDEDVISSIRDAFTSVLEKGSISPEYSPRTTLPNKRRRYAL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G519820
TK1151 IDTkA03G519820
OH-1004 IDLXL04_010332
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G519820
位置Chr03:130419134-130422156 (-)
描述Similar to BHLH30: Transcription factor bHLH30
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68810 转录因子 bHLH30。 暂无已核实直接文献
At3g25710 胚胎中 MONOPTEROS 依赖性根起始所需的转录因子。
MONOPTEROS controls embryonic root initiation by regulating a mobile transcription factor.2010 · DOI: 10.1038/nature08836
At2g41130 转录因子bHLH106。 暂无已核实直接文献
At3g56770 推测为转录因子 bHLH107。 暂无已核实直接文献
At4g38070 转录因子 bHLH131。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010332 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68810
ath:AT2G40200
ath:AT2G41130
ath:AT3G25710
ath:AT3G56770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA03G519820 · TK1151
细胞质0.085
排名 2 · TkA03G519820 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA03G519820 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA03G519820 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA03G519820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08833Axin_b-cat_bind12-19 aa
PF00010HLH74-120 aa
PF23177bHLH_IRO374-125 aa
PF23183bHLH_NPAS475-105 aa
PF23173bHLH_SAC5179-123 aa
PF20110DUF6500101-112 aa
PF20110DUF6500143-168 aa
PF23177bHLH_IRO3182-200 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G519820PF08833Axin_b-cat_bind12190.2112.2
TkA03G519820PF00010HLH741201.1e-1145.1
TkA03G519820PF23177bHLH_IRO3741252.5e-0525.2
TkA03G519820PF23183bHLH_NPAS4751050.08513.5
TkA03G519820PF23173bHLH_SAC51791231.2e-0629.0
TkA03G519820PF20110DUF65001011120.1412.7
TkA03G519820PF20110DUF65001431680.1412.7
TkA03G519820PF23177bHLH_IRO31822002.5e-0525.2
TkA03G519820PF08833Axin_b-cat_bind1841950.2112.2
TkA03G519820PF08833Axin_b-cat_bind2232370.2112.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S7Y1拟南芥sp|Q9S7Y1|BH030_ARATH Transcription factor bHLH3036.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LS08拟南芥sp|Q9LS08|BH032_ARATH Transcription factor AIG141.200%Swiss-Prot中等置信
O80674拟南芥sp|O80674|BH106_ARATH Transcription factor bHLH10636.500%Swiss-Prot中等置信
Q9LET0拟南芥sp|Q9LET0|BH107_ARATH Putative transcription factor bHLH10734.900%Swiss-Prot中等置信
P0CB25拟南芥sp|P0CB25|BH131_ARATH Transcription factor bHLH13137.500%Swiss-Prot中等置信

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