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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G516790
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 129663507-129664921 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

942 bp · TkA03G516790|TK1151|cDNA

ATGGAGGAGTCTAATCCTGATTACGATTACTTGTACAAGCTTGTTTTGAATGGGGATCTTGGTGTCGGTAAAACCAATCTTTTCTCGCGATTCACGAGCGACAAATTCAGCCTCGAATCCAAATCCACAATCGGGGTTGAATTCGCCACCCGTCTCATCAATGTCGATGGCAAGATCATTAAAGCCCAAATTTGGGACACCGCGGAAACATTCGAACACGTTGAAAGATGGTTGAAGGAGCTTCGGGATTGCTCGGATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

942 bp · TkA03G516790|TK1151|CDS

ATGGAGGAGTCTAATCCTGATTACGATTACTTGTACAAGCTTGTTTTGAATGGGGATCTTGGTGTCGGTAAAACCAATCTTTTCTCGCGATTCACGAGCGACAAATTCAGCCTCGAATCCAAATCCACAATCGGGGTTGAATTCGCCACCCGTCTCATCAATGTCGATGGCAAGATCATTAAAGCCCAAATTTGGGACACCGCGGAAACATTCGAACACGTTGAAAGATGGTTGAAGGAGCTTCGGGATTGCTCGGATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

313 aa · TkA03G516790|TK1151|PROTEIN

MEESNPDYDYLYKLVLNGDLGVGKTNLFSRFTSDKFSLESKSTIGVEFATRLINVDGKIIKAQIWDTAETFEHVERWLKELRDCSDPNIVVMLVGNKADQINSRSVRTEDAKEFADRNNIKFFMETSALNTFNVDSAFTKLLTQIHHFSNIKTLDKDNAHMVERKDFVIACRRYSQDDGSIVEPPRFSSDNFSVWKNPKDMWDNLILIFEGADELHKAILGYEYECFTYKPGESLTDTYIRFKCVVNDMRQHGETFNNDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G516790
TK1151 IDTkA03G516790
OH-1004 IDLXL04_010225
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)42.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.527 / OH-1004 84.008
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G516790
位置Chr03:129663507-129664921 (+)
描述Similar to RABA1F: Ras-related protein RABA1f
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g15060 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献
At5g60860 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献
At5g45750 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献
At4g18430 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献
At4g18800 细胞内囊泡运输和蛋白质运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010225 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0042546 cell wall biogenesis 生物过程
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28550
ath:AT2G33870
ath:AT3G15060
ath:AT5G60860
nta:107770722
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.629
排名 1 · TkA03G516790 · TK1151
细胞核0.316
排名 2 · TkA03G516790 · TK1151
细胞膜0.084
排名 3 · TkA03G516790 · TK1151
内质网0.075
排名 4 · TkA03G516790 · TK1151
线粒体0.051
排名 5 · TkA03G516790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00071Ras13-68 aa
PF08477Roc13-68 aa
PF10662PduV-EutP13-67 aa
PF02492cobW14-63 aa
PF02367TsaE14-31 aa
PF09439SRPRB14-51 aa
PF01926MMR_HSR115-102 aa
PF09439SRPRB55-105 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G516790PF00071Ras13684.3e-36124.6
TkA03G516790PF08477Roc13682.1e-1660.9
TkA03G516790PF10662PduV-EutP13670.05114.1
TkA03G516790PF02492cobW14630.1312.6
TkA03G516790PF02367TsaE14310.1612.7
TkA03G516790PF09439SRPRB14510.2511.4
TkA03G516790PF01926MMR_HSR1151020.2112.4
TkA03G516790PF09439SRPRB551050.2511.4
TkA03G516790PF00071Ras681464.3e-36124.6
TkA03G516790PF08477Roc69992.1e-1660.9
TkA03G516790PF02492cobW921160.1312.6
TkA03G516790PF09439SRPRB1321730.2511.4
TkA03G516790PF14223Retrotran_gag_21983025.7e-1556.2
TkA03G516790PF24951LisH_PAC12122220.04514.2
TkA03G516790PF24951LisH_PAC12933060.04514.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK99拟南芥sp|Q9LK99|RAA1G_ARATH Ras-related protein RABA1g56.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FJH0拟南芥sp|Q9FJH0|RAA1F_ARATH Ras-related protein RABA1f56.700%Swiss-Prot低置信
Q9FK68拟南芥sp|Q9FK68|RAA1C_ARATH Ras-related protein RABA1c54.400%Swiss-Prot低置信
O49513拟南芥sp|O49513|RAA1E_ARATH Ras-related protein RABA1e55.600%Swiss-Prot低置信
Q9SN35拟南芥sp|Q9SN35|RAA1D_ARATH Ras-related protein RABA1d54.400%Swiss-Prot低置信

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