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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G461330
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 115186961-115191139 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3570 bp · TkA03G461330|TK1151|cDNA

ATAGTCTTAAAACATATTTATGAAAAGTTTTTTTTGAAAAAAATAGTTTTTGAAGTGCCCTAAATCACCCTGATTGGTATCAGGGTACGATTCCTTCATCTCAATGATGATGAAACTGAATCACAATGGATCTCTACGCTGACTTCAGACATTCATCTCCACCGGCGACTTCAAAGCTTCCACTTCCTACCGGCGACTTCACAGCTTCCATCACCCGACGACGCCCTCTTGAGCGCCGGCGACTTCACAGTTTTCTGCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

3045 bp · TkA03G461330|TK1151|CDS

ATGCCTGCAAATCGCAGCGGTAGTTACAGTGGTGGCCTTGTTGATCCCAGCAATCTCCATCTGAAAAAGGAGTTAACTCAGATTAGGAAAGCTGCTCGTACTTTACGAGATCCCGGTACGACTTCCTCCTGGCGGTCTCCGCTCAGCTCATCCAGATCCACCACTGCCGTCGCTATAGCAGCTTCCATCACCACTACCCCAAGCAACCATTATAATCACCACTACAGTTACAGTGTAGAAGAGAATAATGTTAACGAGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1014 aa · TkA03G461330|TK1151|PROTEIN

MPANRSGSYSGGLVDPSNLHLKKELTQIRKAARTLRDPGTTSSWRSPLSSSRSTTAVAIAASITTTPSNHYNHHYSYSVEENNVNEISNNVSGSSNNHNTSRRKEKKVFLYNWKTQRSESERSASVENTRRLNLNGDGDDSLSDARNDRDLNNVDNRYALSSSSKMFSNCKGATSLMKKKPHSSSSALKLGQHRHLILPDQYDEVNSDDMVVKLSKLLRGGSRKDDSSYCYSTTPALSTSSFSKYWIRNPSTVGSWDAGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G461330
TK1151 IDTkA03G461330
OH-1004 IDLXL04_009667
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G461330
位置Chr03:115186961-115191139 (+)
描述Similar to At1g14460: Protein STICHEL-like 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02480 通过一种与内重复无关的途径，作为毛状体分枝的关键调控因子。 暂无已核实直接文献
At1g14460 类STICHEL蛋白 1。 暂无已核实直接文献
At4g24790 STICHEL样蛋白2。 暂无已核实直接文献
At5g45720 类 STICHEL 蛋白 4。 暂无已核实直接文献
At4g18820 STICHEL样蛋白3。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009667 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006261 DNA-templated DNA replication 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0010026 trichome differentiation 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005663 DNA replication factor C complex 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009360 DNA polymerase III complex 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003887 DNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14460
ath:AT2G02480
ath:AT4G24790
ath:AT5G45720
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.429
排名 1 · TkA03G461330 · TK1151
细胞质0.287
排名 2 · TkA03G461330 · TK1151
细胞膜0.251
排名 3 · TkA03G461330 · TK1151
质体0.083
排名 4 · TkA03G461330 · TK1151
内质网0.063
排名 5 · TkA03G461330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04851ResIII81-120 aa
PF05496RuvB_N406-459 aa
PF13177DNA_pol3_delta2416-573 aa
PF13191AAA_16423-458 aa
PF13401AAA_22435-551 aa
PF13604AAA_30435-541 aa
PF04851ResIII435-457 aa
PF00004AAA437-572 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G461330PF04851ResIII811200.4111.3
TkA03G461330PF05496RuvB_N4064590.0215.4
TkA03G461330PF13177DNA_pol3_delta24165731.3e-2384.5
TkA03G461330PF13191AAA_164234580.06114.6
TkA03G461330PF13401AAA_224355510.004318.1
TkA03G461330PF13604AAA_304355410.1212.8
TkA03G461330PF04851ResIII4354570.4111.3
TkA03G461330PF00004AAA4375721.9e-0835.5
TkA03G461330PF07728AAA_54374580.06214.0
TkA03G461330PF05496RuvB_N5115300.0215.4
TkA03G461330PF04851ResIII5135340.4111.3
TkA03G461330PF22608DNAX_ATPase_lid5796201.4e-0835.1
TkA03G461330PF21960RCF1-5-like_lid5836190.00916.7
TkA03G461330PF13604AAA_306276550.1212.8
TkA03G461330PF12169DNA_pol3_gamma36297116.2e-0730.0
TkA03G461330PF00004AAA7527781.9e-0835.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64728拟南芥sp|O64728|STI_ARATH Protein STICHEL46.200%Swiss-Prot中等置信
F4HW65拟南芥sp|F4HW65|STIL1_ARATH Protein STICHEL-like 145.900%Swiss-Prot中等置信
F4JRP8拟南芥sp|F4JRP8|STIL2_ARATH Protein STICHEL-like 240.200%Swiss-Prot低置信
F4KEM0拟南芥sp|F4KEM0|STIL4_ARATH Protein STICHEL-like 436.700%Swiss-Prot中等置信
F4JRP0拟南芥sp|F4JRP0|STIL3_ARATH Protein STICHEL-like 339.400%Swiss-Prot低置信

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