TkA03G447280 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G447280

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 111595544-111599024 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2092 bp · TkA03G447280|TK1151|cDNA

GAGGACTAAATCTACAAGGTAGTGAAAACTTGAAGGACCTTATAAGCAAACATGACCTTAGTCGCTTTTAACTCGGAGTTTTCTGGACCTGGTGGAAATTATGCAATGTTTGGCGTCGGGATGAGCTAACACCCCTGCCCCTGATCCTTTCGCTGACATCAGAGCCAGCGTGTGAAGATGGCCACTCCTCCAAACCCTACTGATGGGAACCCCCAAAATCCAGTTCCAGACGCTGTAAATCCAACGACTAATGCTCAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1587 bp · TkA03G447280|TK1151|CDS

ATGGCCACTCCTCCAAACCCTACTGATGGGAACCCCCAAAATCCAGTTCCAGACGCTGTAAATCCAACGACTAATGCTCAACAAGAAGCCGACAAAGGAGCTACCAAAGAACCATCAATATTTGTCAACACAGAACCAATTCGAGAAGACCAAGTGCAAAATGCTATCAAGTTCCTTTCACATCCGAAGGTCAAGGGATCTCCAGTTATGTACAGACGATCTTTTCTTGAGAGAAAAGGCCTTACAAAAGAAGAGATAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

528 aa · TkA03G447280|TK1151|PROTEIN

MATPPNPTDGNPQNPVPDAVNPTTNAQQEADKGATKEPSIFVNTEPIREDQVQNAIKFLSHPKVKGSPVMYRRSFLERKGLTKEEIDEAFRRVPDESPSVATTQPAVVNQGGQSQTASNIQPQAPIQSLQPVTAPTSKLGTKFHWSHALLAVGVLAISGAGTAVVFKNAVVPRLKSWIKKVVHEDEKEDVGNETDRKPTPAEEAAASAKAAAAAAADVARASQDMLASKTEEKKYFGELLSLLDVQVQEMKSMSNSIRKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G447280`
TK1151 ID	TkA03G447280
OH-1004 ID	LXL04_009549
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G447280

位置 Chr03:111595544-111599024 (-)

描述 Similar to PEX14: Peroxisomal membrane protein PEX14

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g62810`	PEX13-PEX14 对接复合体的组分，一种转位通道，专门介导结合 PEX5 受体的过氧化物酶体货物蛋白的导入。	AtPex14p maintains peroxisomal functions by determining protein targeting to three kinds of plant peroxisomes.2000 · DOI: 10.1093/emboj/19.21.5701 Functional classification of Arabidopsis peroxisome biogenesis factors proposed from analyses of knockdown mutants.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm053 Molecular components required for the targeting of PEX7 to peroxisomes in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03970.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009549 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006625 protein targeting to peroxisome 生物过程

GO:0007031 peroxisome organization 生物过程

GO:0016558 protein import into peroxisome matrix 生物过程

GO:0016560 protein import into peroxisome matrix, docking 生物过程

GO:0016561 protein import into peroxisome matrix, translocation 生物过程

GO:0016562 protein import into peroxisome matrix, receptor recycling 生物过程

GO:0034453 microtubule anchoring 生物过程

GO:0034614 cellular response to reactive oxygen species 生物过程

GO:0036250 peroxisome transport along microtubule 生物过程

GO:0043335 protein unfolding 生物过程

GO:0044721 protein import into peroxisome matrix, substrate release 生物过程

GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G62810

hsa:5195

mmu:56273

rno:64460

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.399

排名 1 · TkA03G447280 · TK1151

线粒体0.203

排名 2 · TkA03G447280 · TK1151

细胞质0.199

排名 3 · TkA03G447280 · TK1151

细胞核0.164

排名 4 · TkA03G447280 · TK1151

内质网0.099

排名 5 · TkA03G447280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04695Pex14_N48-92 aa

PF23020PEX14-like_2nd142-261 aa

PF17733KPWE_dom314-362 aa

PF23020PEX14-like_2nd444-459 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G447280	`PF04695`	Pex14_N	48	92	2e-13	50.5
TkA03G447280	`PF23020`	PEX14-like_2nd	142	261	3.3e-53	179.8
TkA03G447280	`PF17733`	KPWE_dom	314	362	1.3e-16	61.1
TkA03G447280	`PF23020`	PEX14-like_2nd	444	459	3.3e-53	179.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FXT6`	拟南芥	sp\|Q9FXT6\|PEX14_ARATH Peroxisomal membrane protein PEX14	48.300%	Swiss-Prot	中等置信

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