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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G440820
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 109836333-109838853 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1960 bp · TkA03G440820|TK1151|cDNA

TTATTTTCGAAAAATTGATTAATTCTGGAAAATTTCCCTTTCCTGATCAGCCATGCTTTGGATTTCTTGAGACGAACCTTTAGATCATGATGGGGATTGGCCCAAACAGTTAACCGTTTGAATCATTCATCTTTTCAGACTCTTCCGTTTGTTACGTGCCCTTTTTAGACCTCCTCTGCTCGAAGAACCTCAAGGGCTTTGTCGTTACAATGGCTTTTCGAACCGATAGCCGGACGGCTACACTATTCATTATCGACGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1533 bp · TkA03G440820|TK1151|CDS

ATGGCTGAGGACGAAATTGGGATAAACGCAATAAAGCATGCCATGAGAGCTCTTAGAAAGCGTCATCTAGCAGAAGAGGGAGCTCATGGGCCTGCTTTTACAGCTATTTCAAAACCTATTGCTTCTCAGGGTATGGTCTGGAAAGAAAAGGCAGAAACTCTTGAATTGGAACTTCAACAATGCTACAAAGCTCAAGCTCGATTATCCGAACAACTTGTTGTAGAAGTTGCAGAATCCAGAGCTTCGAAAGCTTTAGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

510 aa · TkA03G440820|TK1151|PROTEIN

MAEDEIGINAIKHAMRALRKRHLAEEGAHGPAFTAISKPIASQGMVWKEKAETLELELQQCYKAQARLSEQLVVEVAESRASKALVQEKEALIPTLENELSQIRDECSRLTSLLEEKTKAINLLIDENHDLKIQNEDIRAKANNVESENKTLIDRWKAEKLKDSERLNEVNALYEDILNKLKANGLQKLASQQIDGIVRQTEQGAEHYTESTVPKTCTHRITAHQGGCASVIFEPTSRKLITGGQDQTVKTWDTDTATLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G440820
TK1151 IDTkA03G440820
OH-1004 IDLXL04_009466
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)82.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 14.902 / OH-1004 76.768
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G440820
位置Chr03:109836333-109838853 (-)
描述Similar to ATG16: Autophagy-related protein 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g50230 可能在自噬中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009466 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G50230
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.608
排名 1 · TkA03G440820 · TK1151
细胞核0.313
排名 2 · TkA03G440820 · TK1151
溶酶体／液泡0.124
排名 3 · TkA03G440820 · TK1151
高尔基体0.110
排名 4 · TkA03G440820 · TK1151
细胞膜0.060
排名 5 · TkA03G440820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24017Beta-prop_SCAP41-143 aa
PF27862Small_EgtBD46-100 aa
PF08614ATG1649-168 aa
PF06156YabA52-96 aa
PF26052BRE1B58-116 aa
PF30381CEP135_N69-207 aa
PF23770Beta-prop_RIG_1st73-151 aa
PF30907IPGA1_CC85-155 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G440820PF24017Beta-prop_SCAP411436e-1245.9
TkA03G440820PF27862Small_EgtBD461004.38.1
TkA03G440820PF08614ATG16491681.3e-1352.4
TkA03G440820PF06156YabA52960.4112.0
TkA03G440820PF26052BRE1B581160.7910.2
TkA03G440820PF30381CEP135_N692071.38.6
TkA03G440820PF23770Beta-prop_RIG_1st731510.0115.1
TkA03G440820PF30907IPGA1_CC851550.1912.8
TkA03G440820PF06156YabA961750.4112.0
TkA03G440820PF24807WD40_CDC20-Fz991461.1e-29104.4
TkA03G440820PF26052BRE1B1221820.7910.2
TkA03G440820PF00843Arena_nucleocap1361830.4710.0
TkA03G440820PF12787EcsC1532150.08813.2
TkA03G440820PF21031WDR541892542.7e-0524.2
TkA03G440820PF23419WD40_RFWD32012413.7e-0627.2
TkA03G440820PF24796WDR552073412.3e-2280.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6NNP0拟南芥sp|Q6NNP0|ATG16_ARATH Autophagy-related protein 1661.500%Swiss-Prot高置信

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