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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G416060
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 103491543-103492954 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1337 bp · TkA03G416060|TK1151|cDNA

CAAGGAGTCCACGTCACCGAGTGGCCTATCCTATCCTTCGTTACGGATTGCGTTATCAACTCACCCACACATCCAAGAAACACCTTAGTCTCCCGTTGACTTAGTTCTCGCCGGTCTCTCGGAGCTGCAAAAATGGCGTTCTCCTCCGCCCTTTTTTCCCACAATGTCTGCTTCACCACCAACCAATGCTCCAACCGTAATCCTAAATCCTACAAACTAAACAATCGAAGAACCCTAACTGTATCCGCACTAGGAGCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkA03G416060|TK1151|CDS

ATGGCGTTCTCCTCCGCCCTTTTTTCCCACAATGTCTGCTTCACCACCAACCAATGCTCCAACCGTAATCCTAAATCCTACAAACTAAACAATCGAAGAACCCTAACTGTATCCGCACTAGGAGCTGATACATTCGACAGCACAACACTGGCGGTCATCGGAGGCAGCTCAGTCGCAGCAATCGCTGCCGCAATTTCACTCGCGGACCCCGAGAAGCGGCGTCAATTACAAGCCGAGGAAGTTGGCGGTGGTGATAAGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

311 aa · TkA03G416060|TK1151|PROTEIN

MAFSSALFSHNVCFTTNQCSNRNPKSYKLNNRRTLTVSALGADTFDSTTLAVIGGSSVAAIAAAISLADPEKRRQLQAEEVGGGDKEVVREYFTNDGFQRWKKIYGVTDDVNKVQLDIRIGHAKTVESVMKMLTDEGSLKGVSVCDAGCGTGLLSIPLAKEGAVVSASDISSSMVSEAQKQAKQELQGIDNVQMPKFEVSDLESLNGKYDTVVCLDVLIHYPQNKADGMIAHLASLAENRLILSFAPKTLYYDVLKRIGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G416060
TK1151 IDTkA03G416060
OH-1004 IDLXL04_009288
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G416060
位置Chr03:103491543-103492954 (-)
描述Similar to CHLM: Magnesium protoporphyrin IX methyltransferase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g25080 使用 S-腺苷-L-甲硫氨酸作为辅助因子，将 Mg-原卟啉 IX 转化为 Mg-原卟啉 IX 甲酯。
Knock-out of the magnesium protoporphyrin IX methyltransferase gene in Arabidopsis. Effects on chloroplast development and on chloroplast-to-nucleus signaling.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m610286200

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009288 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0015995 chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0030494 bacteriochlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0036068 light-independent chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0036070 light-independent bacteriochlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G25080
cbs:COXBURSA331_A0458
cbu:CBU_0350
syn:slr0525
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.982
排名 1 · TkA03G416060 · TK1151
线粒体0.024
排名 2 · TkA03G416060 · TK1151
细胞质0.013
排名 3 · TkA03G416060 · TK1151
细胞核0.013
排名 4 · TkA03G416060 · TK1151
细胞膜0.011
排名 5 · TkA03G416060 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19333FAXC_N27-63 aa
PF12847Methyltransf_1830-99 aa
PF26823T5_Terminase_small54-117 aa
PF01135PCMT74-193 aa
PF07757AdoMet_MTase91-164 aa
PF17573GA-like119-131 aa
PF05401NodS124-221 aa
PF06325PrmA125-214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G416060PF19333FAXC_N27630.2112.5
TkA03G416060PF12847Methyltransf_1830990.03115.0
TkA03G416060PF26823T5_Terminase_small541170.003618.0
TkA03G416060PF01135PCMT741930.009916.4
TkA03G416060PF07757AdoMet_MTase911640.113.6
TkA03G416060PF17573GA-like1191310.1512.7
TkA03G416060PF05401NodS1242210.006417.1
TkA03G416060PF06325PrmA1252146.9e-0626.5
TkA03G416060PF01209Ubie_methyltran1252120.0004820.3
TkA03G416060PF13679Methyltransf_321252030.006517.2
TkA03G416060PF08003Methyltransf_91372210.003117.2
TkA03G416060PF03848TehB1392330.0003820.6
TkA03G416060PF13489Methyltransf_231402913.1e-1350.5
TkA03G416060PF13847Methyltransf_311402239.8e-1245.6
TkA03G416060PF02353CMAS1402273e-0524.2
TkA03G416060PF05175MTS1402140.000122.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SW18拟南芥sp|Q9SW18|CHLM_ARATH Magnesium protoporphyrin IX methyltransferase, chloroplastic79.200%Swiss-Prot高置信

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