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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G400930
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99727314-99730090 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2167 bp · TkA03G400930|TK1151|cDNA

TGGCAGGCTCACAAGCTAACAAAAACGGGGACAAAATCTGAAAATGACCGAGAAAGGGGATGGAACATTGGAACCCACCCACACCGCACCCACTAAACAATGAAAATTCTTACACTTGAAGTTGAAGCCCTAATTATTAACTTCAGTTGACCGGAAGGAAGCAATACCATCAATCATCCATGGCCGATGATGCCGCAAGTACCAGCACCATTACTGGTAGAATGAACACCTCCATAACCGACATGTCACATGACCATCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1314 bp · TkA03G400930|TK1151|CDS

ATGGCCGATGATGCCGCAAGTACCAGCACCATTACTGGTAGAATGAACACCTCCATAACCGACATGTCACATGACCATCTCTTCTCCATCCTTCTGCTCCTGCCTCTGGAATCCATCCTGTCGTTTGCCATGACTTGTAAGAAAGCTACTCGCTTAACTCACTCCCACACTCTCTGGAAATCCATCTGCACCAGGGATTGGGGTCACTCCACCATCGATGCCTTCGTCAATTCTTCCTCCAATCCTCTTTCTGTCGACTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

437 aa · TkA03G400930|TK1151|PROTEIN

MADDAASTSTITGRMNTSITDMSHDHLFSILLLLPLESILSFAMTCKKATRLTHSHTLWKSICTRDWGHSTIDAFVNSSSNPLSVDWKRLYQRLRNLDRVSCYKLTDSETSPGSRASHSLNYFSGCLVLFGGGSEGGRHLDDTWVAYIGNNFRRMVSWQRVISEGPSGRFGHSCIVIGNSLVLFGGINDTGIRQNDTWMAQLDTTTTTLSWRLLDVGPVTPPTRGAHACCLIDSRRMLIHGGIGLFGTRLGDTWVLDLSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G400930
TK1151 IDTkA03G400930
OH-1004 IDLXL04_009138
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G400930
位置Chr03:99727314-99730090 (+)
描述Similar to At1g51550: F-box/kelch-repeat protein At1g51550
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g51550 F-盒/kelch 重复蛋白 At1g51550。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009138 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0043153 entrainment of circadian clock by photoperiod 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51550
ath:AT2G18915
ath:AT5G57360
dosa:Os06g0694000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.585
排名 1 · TkA03G400930 · TK1151
细胞核0.367
排名 2 · TkA03G400930 · TK1151
过氧化物酶体0.113
排名 3 · TkA03G400930 · TK1151
线粒体0.083
排名 4 · TkA03G400930 · TK1151
溶酶体／液泡0.055
排名 5 · TkA03G400930 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00646F-box19-60 aa
PF12937F-box-like27-65 aa
PF13854Kelch_HCF93-186 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC796-260 aa
PF13415Beta-prop_FBX42101-261 aa
PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR1104-148 aa
PF13418Beta-prop_TYW4112-190 aa
PF13854Kelch_HCF115-297 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G400930PF00646F-box19600.002418.4
TkA03G400930PF12937F-box-like27650.001219.3
TkA03G400930PF13854Kelch_HCF931863.4e-2279.9
TkA03G400930PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7962608.3e-53179.6
TkA03G400930PF13415Beta-prop_FBX421012611.9e-47162.3
TkA03G400930PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR11041489e-30104.6
TkA03G400930PF13418Beta-prop_TYW41121903.4e-2177.0
TkA03G400930PF13854Kelch_HCF1152973.4e-2279.9
TkA03G400930PF01344Kelch_11151451.1e-1144.8
TkA03G400930PF07646Kelch_21151337.9e-1142.1
TkA03G400930PF24996NANM1251900.0001421.5
TkA03G400930PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR11572439e-30104.6
TkA03G400930PF13418Beta-prop_TYW41682423.4e-2177.0
TkA03G400930PF07646Kelch_21681907.9e-1142.1
TkA03G400930PF01344Kelch_11691981.1e-1144.8
TkA03G400930PF07646Kelch_22242617.9e-1142.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C8K7拟南芥sp|Q9C8K7|FBK21_ARATH F-box/kelch-repeat protein At1g5155052.700%Swiss-Prot高置信

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