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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G400590
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99604059-99608141 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4005 bp · TkA03G400590|TK1151|cDNA

GTTATTTAGCGATACATAAAACAGACCCCAATAATTAATTAAAAGTACATAAATCTCAGATAAGAATGAAGATAGATATGCGGGAGGCACAGATACAGATGGCAAAATGAGAAACGACACACTTTAAGAATGTGGAACCGTCAGTCAAACCTTTCAGACCTCCCCGCAGAAACCGCGTTGAATTAATTTTTTTATCACTATTCCCTCCACCCATCTCTTGCTCCCAGTCTAGCTGCATCCGCCATTGGAGCTTGGATATT...

CDS

下载 CDS FASTA

3408 bp · TkA03G400590|TK1151|CDS

ATGCCTTCGTTTTTGCTGTTCTTGTTTCTGTTTGGGTTGGTTTCTCCATCATTCTCTCTTGTCTCTGATGGATTACACTTGTTATCACTCATGACTTACTGGACCGCAATACCTCCATCCGTTTCTTCGAGCTGGAACGCTTCAGACCTAACACCCTGCTCGTGGGTTGGAGTTCATTGCGACAACGACAGTCATGTCGATGCTCTTAACCTATCTAGTTACCTCATATCTGGAGAATTAGGGCCAGAACTTGGTTACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1135 aa · TkA03G400590|TK1151|PROTEIN

MPSFLLFLFLFGLVSPSFSLVSDGLHLLSLMTYWTAIPPSVSSSWNASDLTPCSWVGVHCDNDSHVDALNLSSYLISGELGPELGYLSNIRSIDLSYNNLSGSLPSQLGNCTLLQHLDLSFNVFTGRLPVTLGNLVSLKQLSLYSNKLTGSIPSQIGNCSQLEDFDMSSNRLTGTLPESLWNLQKLKVLSLYENSLYGSIPQFSFRGSQLETLYLSFNQLSGPIPSNIGNLSKLLDLELNNNGVSGSIPSSIGNCSSLQT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G400590
TK1151 IDTkA03G400590
OH-1004 IDLXL04_009127
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)56.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 33.040 / OH-1004 35.125
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G400590
位置Chr03:99604059-99608141 (+)
描述Similar to INRPK1: Receptor-like protein kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g73080 充当 PEP 防御肽的受体。
The cell surface leucine-rich repeat receptor for AtPep1, an endogenous peptide elicitor in Arabidopsis, is functional in transgenic tobacco cells.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603729103
BIK1 interacts with PEPRs to mediate ethylene-induced immunity.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1215543110
At1g17750 充当 PEP 防御肽的受体。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0203800 参与调节耐热性的受体激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009127 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G17750
ath:AT1G73080
ath:AT5G63930
ini:109187519
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · TkA03G400590 · TK1151
内质网0.088
排名 2 · TkA03G400590 · TK1151
细胞质0.062
排名 3 · TkA03G400590 · TK1151
细胞核0.038
排名 4 · TkA03G400590 · TK1151
溶酶体／液泡0.031
排名 5 · TkA03G400590 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_222-61 aa
PF00560LRR_169-87 aa
PF23598LRR_1469-216 aa
PF13855LRR_879-122 aa
PF25013LRR_Zer-187-103 aa
PF00560LRR_189-111 aa
PF12799LRR_489-122 aa
PF24758LRR_At5g5637098-169 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G400590PF08263LRRNT_222611.4e-0835.5
TkA03G400590PF00560LRR_169871.4e-62194.7
TkA03G400590PF23598LRR_14692167.2e-35121.1
TkA03G400590PF13855LRR_8791222.7e-43146.3
TkA03G400590PF25013LRR_Zer-1871030.000421.3
TkA03G400590PF00560LRR_1891111.4e-62194.7
TkA03G400590PF12799LRR_4891225.3e-38128.9
TkA03G400590PF24758LRR_At5g56370981695.6e-0833.4
TkA03G400590PF25013LRR_Zer-11121760.000421.3
TkA03G400590PF00560LRR_11141351.4e-62194.7
TkA03G400590PF12799LRR_41141495.3e-38128.9
TkA03G400590PF23952LRR_EndoS1271700.8710.6
TkA03G400590PF13855LRR_81311722.7e-43146.3
TkA03G400590PF00560LRR_11371591.4e-62194.7
TkA03G400590PF13855LRR_81371962.7e-43146.3
TkA03G400590PF12799LRR_41371735.3e-38128.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SSL9拟南芥sp|Q9SSL9|PEPR1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PEPR146.400%Swiss-Prot低置信
Q9FZ59拟南芥sp|Q9FZ59|PEPR2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PEPR248.500%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393039.800%Swiss-Prot低置信
Q69SP5水稻sp|Q69SP5|EREC1_ORYSJ LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ER139.500%Swiss-Prot低置信

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